基于Material Studio实现裂解产物片段统计(perl脚本)

 石油裂化(cracking)是在一定的条件下,将相对分子质量较大、沸点较高的烃断裂为相对分子质量较小、沸点较低的烃的过程。单靠热的作用发生的裂化反应称为热裂化,在催化作用下进行的裂化,叫做催化裂化。裂解是石油化工生产过程中,以比裂化更高的温度(700℃~800℃,有时甚至高达1000℃以上),使石油分馏产物(包括石油气)中的长链烃断裂成乙烯、丙烯等短链烃的加工过程。

热裂化是在热的作用下(不用催化剂)使重质油发生裂化反应,转变为裂化气(炼厂气的一种)、汽油、柴油的过程。热裂化原料通常为原油蒸馏过程得到的重质馏分油或渣油,或其他石油炼制过程副产的重质油 。在400~600℃,大分子烷烃分裂为小分子的烷烃和烯烃;环烷烃分裂为小分子或脱氢转化成芳烃,其侧链较易断裂;芳烃的环很难分裂,主要发生侧链断裂。热裂化气体的特点是甲烷、乙烷-乙烯组分较多;而催化裂化气体中丙烷-丙烯组分、丁烷-丁烯组分较多。

在进行科研工作时,我们往往需要利用模拟软件来实现裂解产物的探究,常用软件有Material Studio等。在MS中我们可以通过GULP模块进行相关计算,可以采用的力场为ReaxFF力场。

首先是使用MS,搭建需要要研究的材料体系,如正十四烷烃,再利用AC模块进行盒子的搭建,最后在GULP下进行裂解过程的计算。

在反应前后的对比中,我们可以清楚的看出,长链状烷烃已经发生了裂解,那么,我们又该如何去统计生成的产物呢?很显然,通过手数的方式是不可取的,因此,我们可以通过perl脚本的方法对产物进行统计。下图为脚本截图和部分结果描述。

通过脚本的分析,我们就可以得到类似如下结果的图表了。

最后,如有需要欢迎通过微信公众号或者VX联系我们.

公众号:320科技工作室

VX: CAE320

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Material Studio是一个用于材料模拟和计算的软件平台,其中包含了多种计算工具和脚本。其中一个脚本用于计算氢键的相关性质。 氢键是一种特殊的化学键,它是由氢与其他原子形成的弱键。氢键的计算对于研究分子间相互作用、物质性质以及结构确定具有重要意义。 Material Studio使用的氢键计算脚本可以通过以下步骤进行操作: 1. 准备输入文件:首先,需要准备一个包含要计算氢键的分子结构的输入文件,可以是.pdb或.cif格式。确保输入文件的几何结构是准确的。 2. 打开Material Studio:启动Material Studio软件,并确定所需计算工具在"计算模块"中是否可用。 3. 导入分子结构:使用"文件"菜单中的"导入"选项,将已准备好的输入文件导入到Material Studio中。确保分子结构被正确加载并显示在屏幕上。 4. 配置计算参数:选择"计算模块"中的"氢键计算"工具,并打开相应的参数设置界面。在此界面中,可以设置氢键计算的具体参数,如截断半径、键能和键长等。 5. 运行计算:配置完参数后,点击"运行计算"按钮开始进行氢键计算。计算过程可能需要一些时间,具体时间取决于所选的计算方法和输入文件的大小。 6. 结果分析:计算完成后,Material Studio将生成一个包含氢键计算结果的输出文件。可以使用工具栏上的分析功能来查看和解释计算结果,如氢键的类型、强度和方向等。 Material Studio的氢键计算脚本提供了一种方便和高效的方法来研究氢键的特性。通过进行氢键计算,我们可以更好地理解分子间相互作用,从而对于材料的设计和性质预测提供支持。

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