linux系统下成功安装lammps

我用的系统是Ubuntu版本
安装软件 fftw-3.3.10 lammps-2Aug2023 mpich-4.2.0b1
centos版本apt命令换成yum

一、准备工作

1.下载需要的依赖包

sudo apt-get install gcc    
sudo apt-get install g++    
sudo apt-get install gfortran    
sudo apt-get install make

2.下载需要的压缩包

FFTW下载地址:http://www.fftw.org/download.html
MPICH下载地址:https://www.mpich.org/downloads/
LAMMPS下载地址:https://www.lammps.org/download.html

3.将三个压缩包传到linux系统下的Downloads目录下,打开终端进入Downloads,使用下面命令解压,注意文件名

tar -zxvf fftw-3.3.10.tar.gz
tar -zxvf mpich-4.2.0b1.tar.gz
tar -zxvf  lammps-2Aug2023 .tar.gz

二、安装fftw

进入Downloads目录下开始安装

cd fftw-3.3.10    #进入解压后的文件目录
./configure --prefix=/usr/local --enable-float    #配置FFTW安装路径,这里是/usr/local
sudo make  
sudo make install 

三、安装MPICH

进入Downloads目录下开始安装

cd mpich-4.2.1    #进入解压后的文件目录
./configure --prefix=/usr/local    #配置FFTW安装路径,这里是/usr/local
sudo make  
sudo make install

四.安装lammps

1. 进入Downloads目录下开始安装

cd lammps-2Aug2023/src    #进入解压后文件夹的src
make package-status
make yes-包名 #选择所需要的依赖包

2.打开src/MAKE目录下makefile.mpi文件

sudo vim Makefile.mpi

3.更改为以下内容

注意自己的安装路径

4返回目录src,使用安装命令

sudo make mpi #使用mpi并行文件 

运行成功后自动生成lmp_mpi文件
在这里插入图片描述

五,测试

我们到lammps自带的例子中试着跑一下

 mpirun -np 4 lmp_mpi < in.crack
 ## lmp_mpi为自动生成文件的路径
 ## in.crack为examples/crack路径下的文件

成功运行截图

在这里插入图片描述

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### 回答1: 1. 下载LAMMPS源代码 从LAMMPS官网(https://lammps.sandia.gov/download.html)下载最新版本的源代码,解压缩到指定目录。 2. 安装必要的软件 在安装LAMMPS之前,需要安装一些必要的软件,如C++编译器、MPI库等。可以使用以下命令安装: sudo apt-get install g++ mpi-default-dev mpi-default-bin libopenmpi-dev libfftw3-dev 3. 编译LAMMPS 进入LAMMPS源代码目录,执行以下命令编译: make mpi 编译完成后,会在src目录下生成一个lmp_mpi可执行文件。 4. 运行LAMMPS 在终端中进入LAMMPS源代码目录,执行以下命令运行LAMMPS: mpirun -np 4 ./lmp_mpi -in in.file 其中,-np 4表示使用4个进程运行LAMMPS,in.file是LAMMPS输入文件。 以上就是在Linux安装LAMMPS的步骤。 ### 回答2: LAMMPS(Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator)是一种分子动力学仿真软件包,非常适合于模拟各种尺度和物理和化学问题。在Linux系统安装LAMMPS需要执行以下步骤: 1.下载LAMMPS软件包 可以通过官方网站或GitHub等渠道下载最新版本的LAMMPS。您也可以下载预编译包。 2.安装必要的依赖项 LAMMPS需要MPI(Message Passing Interface)库和FFTW(Fastest Fourier Transform in the West)库。因此,您需要在系统安装这些库。您可以使用以下命令在Ubuntu系统安装它们: sudo apt-get install libfftw3-dev sudo apt-get install libmpi-dev 3.编译和构建LAMMPS 解压下载的LAMMPS软件包并进入解压后的目录。然后使用以下命令进行编译: make yes-all make no-lib make mpi 使用上述命令将启用所有可用的软件包和GPU支持。如果您不需要某些软件包或GPU支持,请相应地更改命令。编译完成后,使用以下命令进行安装: make install 4.基本测试 使用以下命令运行LAMMPS示例输入文件进行基本测试: lammps-daily < in.lj 此命令将使用LAMMPS运行in.lj作为输入文件。 以上是在Linux系统安装LAMMPS的基本步骤。但是,安装步骤可能会因操作系统的不同而异。如果您遇到任何问题,请查看LAMMPS的文档并参考操作系统的官方指南。 ### 回答3: LAMMPS(Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator)是一款基于分子动力学原理的分子模拟软件。它可以模拟分子尺度的物理行为,比如原子的动力学、晶体的性质、材料力学等等。LAMMPS适用于从化学、材料科学、生物医学、材料制造、材料设计等广泛领域的研究工作。 在Linux操作系统安装LAMMPS非常简单,只需要遵循以下几个步骤: 1. 下载LAMMPS 首先需要在官网(https://lammps.sandia.gov/download.html)上下载LAMMPS最新版的tar.gz压缩文件。 2. 解压LAMMPS 使用以下命令解压LAMMPS的tar.gz压缩文件: $ tar xvzf lammps*.tar.gz 3. 进入LAMMPS源代码目录 解压后,在命令行中进入LAMMPS源代码目录: $ cd lammps* 4. 编译LAMMPS 进入LAMMPS源代码目录后,使用以下命令编译LAMMPS: $ make yes-all $ make serial 上述命令将会编译串行版本的LAMMPS。 5. 测试LAMMPS 编译完成后,可以测试一下LAMMPS是否正常运作。在命令行中输入以下命令: $ lmp_serial -in in.lj 其中,in.lj是一个标准的LAMMPS输入文件,在LAMMPS源代码目录下examples目录中。 LAMMPS将会运行几秒钟,然后输出一些信息,包括能量、温度、压力等。这表明LAMMPS已经成功安装。 以上就是在Linux操作系统安装LAMMPS的简单步骤。在安装过程中需要注意的是,LAMMPS依赖于很多第三方库,比如fftw、mpi等,需要在编译之前先安装好这些库。此外,在编译过程中还需要根据实际需要选择不同的选项,具体可以参考LAMMPS官方文档。
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