Linux下安装lammps(OpenMPI）并行

最新推荐文章于 2024-03-15 19:17:14 发布
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Ydj99
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linux下Lammps 成功并行安装教程 高清.pdf版
08-30
本人亲自做的教程，亲测了好几次，每次都成功！注意： 本教程要在 root 用户下安装
Lammps分子动力学软件MPI并行+Intel高效编译版 Linux完整安装教程
chenning3230的博客
08-21 4331
简介 LAMMPS是一种经典的分子动力学仿真代码，设计用于在并行计算机上高效运行。它是由美国能源部下属的桑迪亚国家实验室(Sandia National Laboratories)开发的。它是一个开源代码，根据GNU公共许可证(GPL)的条款自由分发。 Github官网：https://...
Linux非root用户安装lammps
weixin_45728128的博客
11-03 298
为了方便，我创建了一个文件夹/home/hsiung/software/lammps，所有的文件下载和安装都在这个文件夹里使用cat命令查看版本：CentOS Linux release 7.9.2009 (Core)
【LAMMPS学习】二、LAMMPS安装(1)Linux安装
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有 3 个基本变体（lammps = 无 MPI、lammps-mpich = MPICH MPI 库、lammps-openmpi = OpenMPI MPI 库），每种都支持链接到 C 库接口（lammps-devel、lammps-mpich-devel、lammps -openmpi-devel)、使用 C 库接口编译程序的头文件 (lammps-headers) 以及 Python 3 的 LAMMPS python 模块。如果您计划修改或扩展LAMMPS，那么您必须从源代码构建LAMMPS。
Linux版LAMMPS软件安装教程
u011618064的博客
07-27 5482
其中，“./configure”指令用于执行当前目录下的“configure”脚本，并生成“Makefile”文件，该文件规定了编译器类型和参数等信息。”路径下的“Makefile.fftw”文件和“Makefile.g++_mpich_link”文件查看，前者的FFT_INC、FFT_PATH和后者的MPI_INC、MPI_PATH均包含“解压后，“lammps”文件夹里多出“fftw-3.3.10”、“mpich-4.1.2”和“lammps-23Jun2022”三个文件夹。如果成功，则表明设置无误。
linux系统下lammps完整安装
dhyzz的博客
11-13 886
配置过程中可能会出错，提示后缀为.base文件找不到，进入src/bingding/fortran/use_mpi,打开mpi.f90文件 sudo vim mpi.f90 ，用sudo apt install vim安装vim，删除报错提示的那一行,插入用i,保存退出用 先esc后 :wq。./configure --prefix=/usr/local --enable-float #配置FFTW安装路径，这里是/usr/local。需要打开src/MAKE目录下makefile.mpi文件，
lammps运行Linux,Lammps分子动力学软件MPI并行+Intel高效编译版 Linux完整安装教程
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lammps并行安装教程.pdf
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03-02
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OpenMP用法大全（个人整理版）
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m0_59097348的博客
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m0_60787307的博客
04-10 1万+
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weixin_30991735的博客
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linux下安装lammps
06-28
### 回答1： 1. 下载LAMMPS源代码 从LAMMPS官网（https://lammps.sandia.gov/download.html）下载最新版本的源代码，解压缩到指定目录。 2. 安装必要的软件 在安装LAMMPS之前，需要安装一些必要的软件，如C++编译器、MPI库等。可以使用以下命令安装： sudo apt-get install g++ mpi-default-dev mpi-default-bin libopenmpi-dev libfftw3-dev 3. 编译LAMMPS 进入LAMMPS源代码目录，执行以下命令编译： make mpi 编译完成后，会在src目录下生成一个lmp_mpi可执行文件。 4. 运行LAMMPS 在终端中进入LAMMPS源代码目录，执行以下命令运行LAMMPS： mpirun -np 4 ./lmp_mpi -in in.file 其中，-np 4表示使用4个进程运行LAMMPS，in.file是LAMMPS输入文件。 以上就是在Linux下安装LAMMPS的步骤。 ### 回答2： LAMMPS（Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator）是一种分子动力学仿真软件包，非常适合于模拟各种尺度和物理和化学问题。在Linux系统上安装LAMMPS需要执行以下步骤： 1.下载LAMMPS软件包 可以通过官方网站或GitHub等渠道下载最新版本的LAMMPS。您也可以下载预编译包。 2.安装必要的依赖项 LAMMPS需要MPI（Message Passing Interface）库和FFTW（Fastest Fourier Transform in the West）库。因此，您需要在系统中安装这些库。您可以使用以下命令在Ubuntu系统上安装它们： sudo apt-get install libfftw3-dev sudo apt-get install libmpi-dev 3.编译和构建LAMMPS 解压下载的LAMMPS软件包并进入解压后的目录。然后使用以下命令进行编译： make yes-all make no-lib make mpi 使用上述命令将启用所有可用的软件包和GPU支持。如果您不需要某些软件包或GPU支持，请相应地更改命令。编译完成后，使用以下命令进行安装： make install 4.基本测试 使用以下命令运行LAMMPS示例输入文件进行基本测试： lammps-daily < in.lj 此命令将使用LAMMPS运行in.lj作为输入文件。 以上是在Linux系统下安装LAMMPS的基本步骤。但是，安装步骤可能会因操作系统的不同而异。如果您遇到任何问题，请查看LAMMPS的文档并参考操作系统的官方指南。 ### 回答3： LAMMPS（Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator）是一款基于分子动力学原理的分子模拟软件。它可以模拟分子尺度的物理行为，比如原子的动力学、晶体的性质、材料力学等等。LAMMPS适用于从化学、材料科学、生物医学、材料制造、材料设计等广泛领域的研究工作。 在Linux操作系统中安装LAMMPS非常简单，只需要遵循以下几个步骤： 1. 下载LAMMPS 首先需要在官网（https://lammps.sandia.gov/download.html）上下载LAMMPS最新版的tar.gz压缩文件。 2. 解压LAMMPS 使用以下命令解压LAMMPS的tar.gz压缩文件： $ tar xvzf lammps*.tar.gz 3. 进入LAMMPS源代码目录 解压后，在命令行中进入LAMMPS源代码目录： $ cd lammps* 4. 编译LAMMPS 进入LAMMPS源代码目录后，使用以下命令编译LAMMPS： $ make yes-all $ make serial 上述命令将会编译串行版本的LAMMPS。 5. 测试LAMMPS 编译完成后，可以测试一下LAMMPS是否正常运作。在命令行中输入以下命令： $ lmp_serial -in in.lj 其中，in.lj是一个标准的LAMMPS输入文件，在LAMMPS源代码目录下examples目录中。 LAMMPS将会运行几秒钟，然后输出一些信息，包括能量、温度、压力等。这表明LAMMPS已经成功安装。 以上就是在Linux操作系统下安装LAMMPS的简单步骤。在安装过程中需要注意的是，LAMMPS依赖于很多第三方库，比如fftw、mpi等，需要在编译之前先安装好这些库。此外，在编译过程中还需要根据实际需要选择不同的选项，具体可以参考LAMMPS官方文档。

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