R 语言【ashr】warning: solve(): system is singular (rcond:****)； attempting approx solution

最近更新了R，升级到了4.2，在使用 ashr 对DESeq2结果进行 LFC shrinkage 的时候，突然出现了warning……

warning: solve(): system is singular (rcond: 2.12669e-17); attempting approx solution

warning……其实不管它，对我最后的结果也不会有影响，但是，看着难受啊，忍不了……所以，一定有别人在我之前遇到了这个warning，并且他也觉得很难受

直接Google

果不其然：
https://github.com/stephens999/ashr/issues/131

就是需要升级（重装）一下mixsqp

install.packages("mixsqp")
# 或者
# install.packages("devtools")
devtools::install_github("stephenslab/mixsqp",build_vignettes = TRUE)

舒服了