conda 转载自 生信技能树

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cat ~/.condarc    conda config --show channels
 

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vim ~/.condarc

创建某环境

conda create -n gen

创建某一环境 并将Python3 加进去

 conda create -n py3 python=3

删除某环境

conda remove -n py3 --all

打开某一环境

source ~/miniconda3/bin/activate gen

退出某环境

conda deactivate

将环境列出来

conda env list

conda寻找某软件

conda search fastqc

conda 安装软件，（特别注意要安装的环境是bash 还是其他）

conda install fastqc

conda安装指定软件版本

conda install fastqc=0.11.7

同时还能添加参数 跳过确认步骤

conda install -y fastqc=0.11.7

(安装软件时找不到这个包怎么办 The following packages are not availble from current channels)

1.确认conda是否能安装你所需要的软件

2.确认名字是否出错

3.确认你要的包在conda中的位置

查看当前环境所安装的软件

conda list

查看符合正则表达式的软件

conda list fast*

查看指定环境的软件

conda list -n bash            conda list -n gen

删除指定环境下的某个软件

conda remove -n bash fastqc        conda remove -n gen fastqc

有时候提醒你 conda 需要升级，要升级吗？

建议只要不影响使用，就不需要管他

能升级软件 ，也能降级软件 只要指定该软件的旧版本就可以了

conda install python=2.7

用conda升级软件 ，以及升级conda

conda update fastqc              conda update conda