TransUnet: 结构解析

最新推荐文章于 2025-02-02 14:16:07 发布
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分类专栏： 降雨预测 文章标签： 深度学习 机器学习 神经网络
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本文链接：https://blog.csdn.net/weixin_46435936/article/details/121658305
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最近在学习TransUnet的算法，希望能应用到降雨预测中

论文中本人认为没有对此结构进行非常清晰的解释，尤其是CNN代码块部分。而源码因本人刚开始接触深度学习内容阅读起来也较为困难。因此打算分成两个部分进行学习，首先是TransUnet的结构部分，重点为数据的输入输出。其次是源代码中自己使用数据的替换。暂时不对结构的深层次原理做过多研究。

首先非常感谢这位博主提供的TransUnet具体实现图，为本人理解此网络结构帮助巨大

https://b

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基于Transformer和U-Net的图像分割模型——TransUNet的实现与原理解析【代码+示例数据训练】
源代码杀手的博客
01-12 740
实现了一个基于Transformer和U-Net结构的图像分割模型——。其核心思路是将U-Net中的卷积结构与Transformer的自注意力机制相结合，从而提升图像分割任务的性能。
TransUNet：Transformers Make Strong Encoders for Medical Image Segmentation用于医疗图像分割的transformers编码器详解
weixin_43656644的博客
03-20 1万+
原文地址：https://arxiv.org/pdf/2102.04306.pdf 收录：CVPR 2021 代码:https://github.com/Beckschen/TransUNet 首篇将transformers用于医疗分割的文章 设计的Idea：UNet +transformers的结合体，使用的具体模块:ViT+ResNet50+skip connection 对关键的公式，和结构图进行了个人的一些注释，供大家参考。 摘要 在医学图像中， U-Net, 已经成为了 de-f..
基于transUnet和swinUnet的医学图像分割项目实验对比
02-01
基于transUnet和swinUnet的医学图像分割项目实验对比，包含完整代码，可以一键运行。评估指标包括dice、iou、recall、precision等
TransUnet复现，完整代码（附实现说明）
04-25
TransUnet复习，完整代码（附实现说明）
第12章：基于TransUnet和SwinUnet网络实现的医学图像语义分割：腹部13器官分割（网页推理）
最新发布
Henry的博客
02-02 1277
TransUNet 是一种用于医学图像分割的混合架构，结合了 Transformer 和 U-Net 的优势。它利用 Transformer 的全局上下文建模能力和 U-Net 的精确定位特性，在医学图像分割任务中实现了优异的性能。TransUNet 的核心组成部分：1. Transformer 编码器：Transformer 编码器用于捕捉输入图像中的长距离依赖关系和全局上下文信息。这在医学图像中尤为重要，因为整个图像的上下文信息对准确分割至关重要。
TransUnet 改进：在Transformer块中加入CBAM模块的实现的【心脏左心房】医学场景分割完整项目
12-11
数据集采用【心脏左心房分割】，数据在data目录下，划分了训练集和验证集。 【改进部分】代码在TransUnet的Transformer中加入了CBAM模块。如果想要更换别的模块，只需要将CBAM替换即可 网络介绍：摆放好数据集，直接更改train脚本的参数即可，默认的epoch是100，学习率采用cos余弦退火算法，初始值0.01，衰减到0.00001。如果想在大尺度进行训练，修改img-size参数即可，优化器采用了AdamW。评估的指标为dice、iou、recall、precision、f1、pixel accuracy等等，代码会对训练和验证集进行评估，结果保存runs下的json文件中。 网络推理的时候，会自动将inference/img下所有图像进行推理，并且保存在infer_get、show下，前者是推理gt阈值图像，后者是img+推理gt的掩膜效果 更多改进项目参本人【改进专栏】
图像分割unet系列------TransUnet详解
gz7seven
08-21 6542
transformer简介与实际应用中的思考
TransUNet：此存储库包含TransUNet的官方项目，在我们的论文中进行了介绍：TransUNet：变压器为医学图像分割提供了强大的编码器
03-04
传输网 此存储库包含代码 用法 1.下载Google预先训练的ViT模型 ：R50-ViT-B_16，ViT-B_16，ViT-L_16 ... wget https://storage.googleapis.com/vit_models/imagenet21k/{MODEL_NAME}.npz && mkdir ../model/vit_checkpoint/imagenet21k && mv {MODEL_NAME}.npz ../model/vit_checkpoint/imagenet21k/{MODEL_NAME}.npz 2.准备数据 请访问以获取详细信息，或将电子邮件发送至jienengchen01 AT gmail.com以请求预处理的数据。 如果您想使用预处理后的数据，请将其用于研究目的，请勿重新分发。 3.环境 请准备一个python = 3.7的环境，然后使用命令“
TransUNet
Black的博客
02-28 1万+
TransUnet: Transformers 和 Unet 的结合 论文题目：TransUNet: Transformers Make Strong Encoders for Medical Image Segmentation. 论文链接：链接: https://arxiv.org/abs/2102.04306.
TransUNet代码解读
Rasmussen_的博客
04-21 3121
随后，DecoderCup利用CUP结构逐级提升特征分辨率，并在此过程中结合从编码器阶段获取的高分辨率特征，通过跳过连接传递到相应的解码层，以实现精细的空间定位能力。DecoderCup类是Vision Transformer (ViT) 模型中的解码器组件，它的作用是将编码器的输出转换回图像的空间维度，以便进行像素级的分割任务。可能代表模型中跳过（skip）连接的数量，这是一种在卷积神经网络（如UNet、ResNet等）中常见的结构，用于将较浅层的特征直接传递给深层或解码阶段以保留更多细节信息。
TransUNet：基于 Transformer 和 CNN 的混合编码网络
weixin_37737254的博客
07-08 1万+
VisualTransformerAuthor：louwillMachine Learning Lab 在深度学习医学图像分割领域，UNet结构一直以来都牢牢占据着主导地位。自从2...
Transformer-Unet:使用变压器编码器的Unet实现
03-05
变压器-Unet 使用变压器编码器的Unet实现
论文解析[8] TransUNet: Transformers Make Strong Encoders for Medical Image Segmentation
默的博客
12-03 1128
关于TransUNet论文的论文解析，《TransUNet: Transformers Make Strong Encoders for Medical Image Segmentation》
TransUNet: Transformers Make Strong Encoders for Medical Image Segmentation（阅读笔记）
GXU_PJM的博客
03-06 1332
Abstract TransUNet:Transformers为医学图像分割做强大编码器。医学图像分割领域U-Net架构取得突出成果但在远程依赖关系上有局限，而序列预测transformer由于low-level细节不足导致定位能力受限，本文提出transformer与U-Net结合，transformer将CNN特征图编码为上下文序列，解码器对编码的特征上采样，再与高分辨率特征图结合实现精准定位，结合transformer的U-Net，是医学图像分割的有效方案。 Introduction CNN..
TransUnet官方代码训练自己数据集（彩色RGB3通道图像的分割）
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qq_37652891的博客
03-13 4万+
官方代码：https://github.com/Beckschen/TransUNet 目的：训练5个类别的汽车部件分割任务（测试在另一篇博客中） 实现效果： 1. github下载代码，并解压。 项目里的文件可能跟你下载的不一样，不急后面会讲到！ 2. 配置数据集（尽最大努力还原官方数据集的格式）。 通常自己手上的数据集分images和labels文件夹，分别存放着原始图像和对应的mask图像，如下图所示; mask图像中的像素有0,1,2,3,4 分别代表背景，车身，轮子，车灯，窗户，一共五个
复现TransUnet官方代码用于训练自己数据集-超详细实操和debug记录
Everyday try to become better -Kobe Bryant
11-26 4011
正常我们是直接利用test_vol_h5和train_npz中的文件名来生成，但是，我们在上一步并没有对数据进行划分，因此在这里生成list的时候，就需要进行划分了。在根目录下创建prepareddata文件夹，并在其中创建image_data3_crop_deleted和image_data3_crop_deleted文件夹、以及图像转化工具getnpz_test.py和getnpz_train.py 还有列表生成工具write_test_txt.py和write_train_txt.py。
TransUNet: Transformers Make StrongEncoders for Medical Image Segmentation文章详解(结合代码)
Orange_sparkle的博客
12-01 4123
尽管基于CNN的方法具有非凡的表示能力，但由于卷积运算的内在局部性，其在建模显式长程关系时通常表现出局限性。因此，这些结构通常产生较弱的性能，特别是对于患者之间在纹理、形状和大小方面存在较大差异的目标结构。为了克服这一限制，现有研究建议基于CNN特征建立自我注意机制。另一方面，专为序列预测而设计的Transformers已成为替代架构，它完全使用分配卷积算子，并且仅依赖于注意机制而不是Transformer。
transunet数据
01-15
### TransUNet 数据集下载与使用教程 #### 获取 Seg-CQ500 数据集 为了训练和评估 TransUNet，在医疗图像分割领域选择了 Seg-CQ500 数据集[^1]。该数据集专注于头部CT扫描，适用于研究创伤性脑损伤(TBI)等问题。 访问原始 CQ500 数据集可以通过其官方发布渠道获取。通常这类公开医学影像数据库会要求注册账号并通过审核才能获得下载权限。具体操作流程如下： - 访问 [CQ500 官方网站](http://headctstudy.qure.ai/dataset/) - 注册账户并等待管理员批准 - 登录后按照指引完成数据集申请过程 对于已经处理好的 Seg-CQ500 版本，则可能存在于某些科研机构内部服务器或是由论文作者提供链接分享给同行学者们用于重复实验验证目的。 #### 使用 DA-TransUNet 教程概述 针对如何应用改进版的 TransUNet——即 DA-TransUNet 来执行具体的医学图像分割任务，有详细的指南可供参考[^2]。此文档不仅涵盖了环境配置、模型搭建等基础准备工作，还深入讲解了参数调整技巧以及常见问题解决方案等内容。 以下是基于 PyTorch 实现的一个简单例子来加载预训练权重文件并对单张图片做预测： ```python import torch from da_transunet import Da_TransUnet # 假设这是自定义库中的类名 device = 'cuda' if torch.cuda.is_available() else 'cpu' model_path = './pretrained_weights/best_model.pth' # 初始化网络结构并将模型移动到GPU/CPU设备上运行 net = Da_TransUnet().to(device) # 加载之前保存的最佳模型状态字典 checkpoint = torch.load(model_path, map_location=device) net.load_state_dict(checkpoint['state_dict']) def predict(image_tensor): net.eval() with torch.no_grad(): input_data = image_tensor.unsqueeze(0).to(device) output = net(input_data) pred_mask = torch.argmax(output.squeeze(), dim=0).detach().cpu().numpy() return pred_mask ``` 这段代码展示了怎样构建一个可以用来推理的新实例，并且包含了读取外部存储器里的最优权值表从而恢复先前学习成果的方法；同时也给出了调用 `predict` 函数来进行实际推断的具体方式。
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