CT图像预处理

做第一个课题时没人告诉我要做插值，现总结基本步骤供大家参考，少走弯路。

step1:

spacing interpolation
间隔插值，也就是在做重采样的事情，让所有像素对应的物理空间size一样大。
（具体做法：sitk实现resample）

	PS：在 brain MRI中，看情况考虑spacing的问题。
	分割任务中，如果spacing差异不大可以认为是size varation，因为不同subjects也有size varation。
	配准算法是考虑了数据spacing的，配出来的都是target的spacing。
	厚层Fetal brain MRI 重建薄层数据的时候也考虑了spacing，并且可以设定重建出来的spacing。

step2:

window transform
调整窗宽窗位

step3:

get mask effective range
画mask

step4:

generate subimage
裁ROI