data whale 夏令营笔记

#AI夏令营 #datawhale #夏令营

代码小白跑通baseline—修改代码——进阶baseline

     预测目标

  • 选手需要预测PROTACs的降解能力,具体来说,就是预测Label字段的值。

  • 根据DC50Dmax的值来判断降解能力的好坏:如果DC50大于100nM且Dmax小于80%,则Label为0;如果DC50小于等于100nM或Dmax大于等于80%,则Label为1


    导入模块

    导入Python中用于数据分析、机器学习建模和化学信息学所需的库。以下是每个库的简要说明:

  • numpy: 提供强大的多维数组对象和相应的操作。

  • pandas: 提供高性能、易用的数据结构和数据分析工具。

  • catboost: 一个用于机器学习的库,特别是分类和回归任务。

  • sklearn.model_selection: 包含模型选择的多种方法,如交叉验证。

  • sklearn.metrics: 包含评估模型性能的多种指标。

  • rdkit: 一个化学信息学和机器学习软件,用于处理化学结构。

  • sklearn.feature_extraction.text: 提供将文本转换为特征向量的Tf-idf向量化器。

  • tqdm: 用于在长循环中添加进度条的库。

  • sys: 与Python解释器密切相关的模块,提供访问由解释器使用或维护的变量和函数。

  • os: 提供与操作系统交互的功能。

  • gc: 垃圾收集器接口,用于手动标记对象为可删除。

  • re: 正则表达式库,用于字符串搜索和替换。

  • argparse: 用于编写用户友好的命令行接口。

  • warnings: 用于发出警告的库,这里用来忽略警告信息。

包管理器 pip用来安装python库

在编程中,特别是在面向对象编程(OOP)的语言中,如 Python,有特定的关系:

  1. 库(Library):这是一个包含预先编写好的代码和数据资源的集合,用于实现特定功能。库通常由一组相关的模块、函数、类和变量组成,它们共同提供某种形式的服务或功能。例如,catboost 是一个库,专门用于实现基于梯度提升的机器学习算法。

  2. 类(Class):在面向对象编程中,类是一个蓝图,用于创建对象。它定义了一组属性(称为成员变量)和方法(称为成员函数),这些属性和方法定义了对象的行为和状态。类是面向对象编程的基本构建块,用于封装数据和相关的操作。

关系:

  • 库包含类:一个库可以包含一个或多个类。例如,catboost 库包含了 CatBoostClassifier 和 Pool等多个类。
  • 类是库的组成部分:类是库提供的功能的一部分。开发者可以通过导入库来访问和使用这些类。

在 Python 中,使用 import 语句来导入库或库中的类

  • catboost: 一个用于机器学习的库,特别是分类和回归任务。

后面的TASK4没看懂,类似于更新算法来获得更好的预测效果

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