关于肉鸡育种

关于肉鸡育种

转眼已经毕业一年了，看着朋友圈里新一届的毕业生，突然意识到自己已经成为了一个老人了。特地在此记录一下近几年的学习和成长。毕业之后没有了老师的督促和同学的陪伴，感觉学习的动力都不够了，工作的一年内除了在业务上的成长之外，好像其他方面基本都没有什么成长，也希望以此贴督促自己不断学习进步。再放一下我导的十六字真言《修身齐家，认知迭代，终身学习，学以致用》

硕士课题 | 什么是育种

我的硕士课题主要是围绕着肉鸡的育种工作展开的。首先理解一下什么是育种，这是ChatGPT的回答
描述的比较官方，比较学术，按照我通俗易懂的理解，育种指的是选育繁种，它是由两个部分组成的，一个是选育，也就是以改良性状或培育品种为目标的过程，另一个是以市场为目的的繁种过程。
选育很好理解，从一个世代的繁育，表型记录，选种选配，再到下一个世代的繁育，表型记录，选种选配…看似是一个循环往复，没有目的的重复性工作。但是以时间为维度去看的话，2世代选育的性状是优于1世代的性状的，3世代又优于2世代，这就像是一个弹簧从底部，不断绕着圆圈，但又在不断上升一样，所以我说育种就像是一根弹簧，你的选择压越大，你弹簧的力就越大，选育的进展也就越快。
育种本身是一个耗时耗力但是产出又十分缓慢的工作，说白了就是要不断往里砸钱。而通过新品种占据市场则可以弥补育种的投入，所以根据不同品种的特性，培育出适合市场的配套系，使用纯系繁育出祖代，再通过祖代繁育父母代和商品代，借此来占据市场，为育种的选育环节提供资金。所以繁种也是育种上一个重要的环节。

基因组选择 | 育种实施

最初的育种可能就是两千多年以前的‘伯乐相马’了，从马圈里识别出哪个是最具有潜力的千里马，就是育种的主要工作之一。千里马常有，而伯乐不常有，古时的伯乐只能通过马的外形来判读，如今的育种师则可以通过马的基因来判断。在2001年，Meuwissen提出了全基因组选择（通过全基因组范围内的高密度分子标记计算个体的育种值），后来也在其他学者的研究下发现基因组选择在育种工作中具有巨大的应用潜力，随后基因组选择就广泛应用在动植物的育种工作当中。

使用基因型数据来计算个体的育种值，也有不同的计算方法（计算模型），比如，Bayes类的直接法和以GBLUP和SSGBLUP为代表的间接法，不同的模型有不同的优缺点，由于鸡的个体经济价值小，没有办法做到所有的个体都测一遍基因型，通过系谱和部分个体的基因型信息结合起来构建亲缘关系矩阵的一步法，所以在鸡上的基因组选择主要以SSGBLUP为主。

基因组选择 | 注意事项

实施基因组选择需要个体的基因型，以及对应个体的表型记录。使用合适的软件合适的模型对后代的基因组育种值进行预测。当然，无论是基因型还是表型数据，总有一些干扰数据。基因型有测错的，表型有离群的，因此在实施基因组选择前，对基本数据进行质量控制是非常有必要的。关于数据的基本质控后续再讲。

一个人的精力是有限的，使用合适的工具记录自己的学习历程和心得不仅可以帮到有需要的人，更重要的是可以不断勉励自己。