bamCoverage 空间不足的问题

已于 2024-05-06 15:05:42 修改
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分类专栏： 软件 文章标签： python
于 2024-05-06 14:54:01 首次发布
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        使用deeptools 中 bamCoverage的时候，转bg 文件提示空间不足，但实际上磁盘空间是够的，原因是程序默认将临时文件放在 /tmp 下，而这个目录所在的磁盘空间很小。

        因为程序没有设置tmp目录的参数，所以只能自己修改系统环境变量中的tmp 文件路径。

        

mkdir -p /data/tmp

#修改  ~/.bashrc

TMPDIR="/data/tmp"
export TMPDIR

source  ~/.bashrc 即可

General FAQ — deepTools 3.5.6 documentation

zgyu
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https://github.com/descostesn/BiocNYC-ChIPSeqSpike https://rdrr.io/bioc/ChIPSeqSpike/f/inst/doc/ChIPSeqSpike.pdf https://rdrr.io/bioc/ChIPSeqSpike/f/vignettes/ChIPSeqSpike.Rmd https://mp.weixin.qq.com/s/La_AwYYf0atmFvsHh7AL6Q I-2 The data In this workshop
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