Day 6学习小组--陈新颖

今天学习的内容是R包的使用

安装和加载R包

建立镜像

首先，需要建立镜像。为了保证我们可以自定义CRAN和Bioconductor的下载镜像，其实是可以在Rstudio中进行设置的，只需要运行这两行代码即可：

options(“repos”=c(CRAN=“https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/”)) #对应清华源
options(BioC_mirror=“https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/”) #对应中科大源

安装及加载

安装命令为:

install.packages(“包”)
BiocManager::install(“包”)

options(“repos” = c(CRAN=“https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/”))
options(BioC_mirror=“https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/”)
install.packages(“dplyr”)
library(dplyr)

dplyr五个基础函数

mutate(),新增列

select(),按列筛选

按列号筛选

按列名筛选

filter()筛选行

arrange(),按某1列或某几列对整个表格进行排序

汇总

处理关系数据

将两个表连接

內连inner_join,取交集

左连left_join

全连full_join

半连接：返回能够与y表匹配的x表所有记录semi_join

反连接：返回无法与y表匹配的x表的所记录anti_join

简单合并