python-tifffile.imwrite函数详解

1.tifffile.imwrite()参数说明

在Python的tifffile模块中，imwrite函数用于将图像数据保存为TIFF格式文件。它的参数如下：

参数	描述
file	保存图像数据的文件路径或文件对象。
data	要保存的图像数据，可以是多维数组。
shape	图像数据的形状，默认为None。如果给定了这个参数，会将图像数据重新调整为指定的形状。
dtype	图像数据的类型，默认为None。如果给定了这个参数，会将图像数据转换为指定的类型。
bigtiff	是否使用BigTIFF格式，默认为False。如果设为True，可以处理大于4GB的文件。
software	创建TIFF文件时要写入的软件名称，默认为None。
byteorder	字节顺序，可以是"little"或"big"。默认为None，表示使用当前系统的字节顺序。
imagej	是否创建兼容ImageJ/Fiji的TIFF文件，默认为False。
metadata	图像元数据，以字典的形式提供。默认为None。
extratags	附加的TIFF标签，以列表的形式提供。默认为None。
compress	压缩类型，可以是"none"、“deflate”、“lzw"或"jpeg”。默认为"none"，表示不进行压缩。
photometric	彩色空间类型，可以是"minisblack"、“miniswhite”、“rgb"或"palette”。默认为"minisblack"，表示灰度图像。
planarconfig	平面配置，可以是"contig"或"separate"。默认为"contig"，表示平面存储。
resolution	分辨率，以每英寸点数的元组形式提供。默认为None。
tile	切片大小，以元组形式提供。默认为None，表示不使用切片。
description	图像描述，默认为空字符串。

2.读入数据

代码如下（示例）：

import numpy as np
import tifffile

# file: 保存图像数据的文件路径或文件对象
# data: 要保存的图像数据，可以是多维数组

file_path = "example.tif"
image_data = np.random.randint(0, 255, size=(512, 512), dtype=np.uint8)
tifffile.imwrite(file_path, image_data)

# shape: 图像数据的形状，默认为None
shape = (512, 512)
image_data_reshaped = image_data.reshape(shape)
tifffile.imwrite(file_path, image_data_reshaped, shape=shape)

# dtype: 图像数据的类型，默认为None
image_data_float = image_data.astype(np.float32)
tifffile.imwrite(file_path, image_data_float, dtype=np.float32)

# bigtiff: 是否使用BigTIFF格式，默认为False
tifffile.imwrite(file_path, image_data, bigtiff=True)

# software: 创建TIFF文件时要写入的软件名称，默认为None
tifffile.imwrite(file_path, image_data, software="My Software")

# byteorder: 字节顺序，可以是"little"或"big"。默认为None，表示使用当前系统的字节顺序
tifffile.imwrite(file_path, image_data, byteorder="little")

# imagej: 是否创建兼容ImageJ/Fiji的TIFF文件，默认为False 
tifffile.imwrite(file_path, image_data, imagej=True)

# metadata: 图像元数据，以字典的形式提供。默认为None
metadata = {"Author": "John", "Date": "2023-08-12"}
tifffile.imwrite(file_path, image_data, metadata=metadata)

# extratags: 附加的TIFF标签，以列表的形式提供。默认为None
extratags = [(270, 's', 0, 'Comment', 'Custom comment')]
tifffile.imwrite(file_path, image_data, extratags=extratags)

# compress: 压缩类型，可以是"none"、"deflate"、"lzw"或"jpeg"。默认为"none"，表示不进行压缩
tifffile.imwrite(file_path, image_data, compress="deflate")

# photometric: 彩色空间类型，可以是"minisblack"、"miniswhite"、"rgb"或"palette"。默认为"minisblack"，表示灰度图像
tifffile.imwrite(file_path, image_data, photometric="rgb")

# resolution: 分辨率，以每英寸点数的元组形式提供。默认为None
resolution = (300, 300)
tifffile.imwrite(file_path, image_data, resolution=resolution)

# tile: 切片大小，以元组形式提供。默认为None，表示不使用切片
tile_size = (256, 256)
tifffile.imwrite(file_path, image_data, tile=tile_size)


# description: 图像描述，默认为空字符串 
tifffile.imwrite(file_path, image_data, description="This is an example image")