姆姆子-CSDN博客

原创计算机药物设计和GROMACS案例解析推荐

计算机辅助药物设计与GROMACS分子动力学模拟在线直播实战课程两阶段（软件基础+案例进阶）教学、班级群跟踪辅导！助力科研我们是认真的，快快加入我们吧！专题一药物设计：1.生物分子互作用研究方法2. PDB 数据库3. Pymol 软件4. Swiss-Model 同源建模5. ChemDraw软件6. 小分子数据库7.分子对接软件（Autodock或薛定谔) 使用半柔性对接、柔性对接8.分子对接用于虚拟筛选9.预测蛋白-蛋白相互作用（ZDOCK）10. 3D-QSAR模型构建（.

2021-05-07 16:13:22 420

原创计算机辅助药物设计与GOMACS

下周六开课，计算机辅助药物设计与GROMACS分子动力学模拟在线直播实战课程两阶段（软件基础+案例进阶）教学、班级群跟踪辅导！助力科研我们是认真的，快快加入我们吧！专题一药物设计：1.生物分子互作用研究方法2. PDB 数据库3. Pymol 软件4. Swiss-Model 同源建模5. ChemDraw软件6. 小分子数据库7.分子对接软件（Autodock或薛定谔) 使用半柔性对接、柔性对接8.分子对接用于虚拟筛选9.预测蛋白-蛋白相互作用（ZDOCK）10. 3D-QSAR

2021-05-06 17:08:49 388

原创 CADD药物设计以及Gromacs分子动力

当今，随着人类基因组计划的完成、蛋白组学的迅猛发展，以及大量与人类疾病相关基因的发现，药物作用的靶标分子急剧增加；计算机辅助药物设计是通过计算机模拟、计算和预算药物与受体生物大分子之间的关系，设计和优化先导化合物的方法；在计算机技术推动下，现在每项有一定规模的新药研究工作中，计算机辅助药物设计的研究都是一个基本的工作，世界上每一个大的制药公司都在使用计算机技术，致力发展该技术，应用前景十分广阔。分子动力学模拟软件GROMACS的应用广泛、功能强大、用户友好，能够满足几乎所有常见的原子体系模拟需要，而且免费

2021-04-30 13:56:22 540

原创药化组计算机辅助药物设计研究生都做什么呢？

计算机辅助药物设计（CADD）这个方向是一个相对综合的研究方向，且在早期药物开发中还是起到了推动作用。如果你是要在这个领域内深入研究的话，在开始研究生阶段之前最好先接触编程，化学，蛋白结构等知识，在博士毕业时最好能发表自己的算法或是针对某个体系做点工作，具体来说小方向很多比如分子动力学模拟，分子对接，虚拟筛选，蛋白建模等等。如感兴趣可点击链接：https://mp.weixin.qq.com/s/WBQV3Ss8wAy5EvMMTNEOUg...

2021-04-29 16:02:06 667

原创关于药物设计

【专题一】计算机辅助药物设计1 生物分子互作基础 2 蛋白数据库3 pymol软件使用动画制作4 Swiss-Model 同源建模5 ChemDraw软件6 DrugBank、ZINC、ChEMBL等数据库介绍7 Autodock和薛定谔使用8 虚拟筛选9 预测蛋白-蛋白相互作用（ZDOCK）10 3D-QSAR模型构建（Sybyl软件）11 基于碎片药物设计（MOE软件）12 gromacs在药物设计中的作用【专题二】GROMACS1 分子模拟基础理论2 学会编译方

2021-04-26 14:55:57 1218 2

原创如何在网上找到最好的药物设计学习资料

现在进行线上培训，“计算机辅助药物设计与应用”和”GROMACS分子动力学模拟技术与应用”两个课程（课程一）计算机辅助药物设计与应用时间地点 2021年05月15日-05月16日在线直播（授课2天）2021年05月22日-05月23日在线直播（授课2天）授课内容1 生物分子互作基础生物分子互作用研究方法2 蛋白数据库 PDB 数据库介绍及使用3 蛋白结构分析 Pymol 软件介绍及使用4 同源建模同源建模原理介绍 Swiss-Model 同源建模5 小分子构建小分子数据库6

2021-04-25 16:29:45 141 1

原创计算机辅助药物设计

计算机辅助药物设计是通过计算机模拟、计算和预算药物与受体生物大分子之间的关系，设计和优化先导化合物的方法；近年来，计算机辅助药物设计已经取得一定成就，特别是在新冠肺炎爆发后，很多研究机构和企业采用计算机辅助药物设计方法辅助进行了很多研究工作。在新型冠状病毒的治疗方案中，通过同源建模方法发布了新冠病毒的三维结构，通过药物靶标预测、筛选出针对新型冠状病毒的药物，通过一系列计算机辅助药物生物计算的方法发现一大类药物分子可以有效阻止新冠病毒的侵染，为治疗新冠提供了新机理和新思路。分子动力学模拟软件GROMACS应

2021-04-21 09:55:53 1598

原创分子对接用于虚拟筛选（Autodock或薛定谔）

生物分子互作基础 1.生物分子互作用研究方法1.1蛋白-小分子、蛋白-蛋白相互作用原理1.2 分子对接研究生物分子相互作用1.3 蛋白蛋白对接研究分子相互作用蛋白数据库PDB 数据库介绍1.1 PDB蛋白数据库功能1.2 PDB蛋白数据可获取资源1.3 PDB蛋白数据库对药物研发的重要性2.PDB 数据库的使用2.1 靶点蛋白结构类型、数据解读及下载2.2 靶点蛋白结构序列下载2.3 靶点蛋白背景分析及相关数据资源获取途径2.4 批量下载蛋白晶体结构蛋白结构分析Pymol

2021-04-20 14:39:24 2937

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