计算机辅助药物设计

计算机辅助药物设计是通过计算机模拟、计算和预算药物与受体生物大分子之间的关系，设计和优化先导化合物的方法；近年来，计算机辅助药物设计已经取得一定成就，特别是在新冠肺炎爆发后，很多研究机构和企业采用计算机辅助药物设计方法辅助进行了很多研究工作。在新型冠状病毒的治疗方案中，通过同源建模方法发布了新冠病毒的三维结构，通过药物靶标预测、筛选出针对新型冠状病毒的药物，通过一系列计算机辅助药物生物计算的方法发现一大类药物分子可以有效阻止新冠病毒的侵染，为治疗新冠提供了新机理和新思路。
分子动力学模拟软件GROMACS应用广泛、功能强大、用户友好，能够满足几乎所有常见的原子体系模拟需要，而且免费开源。生物分子的结构动力学决定其生物学功能，而分子动力学模拟是研究其结构动力学的有效手段，因此采用GROMACS进行分子动力学计算分析从而指导进一步的实验工作，预测理论结果。不论你从事生物学、药学、生物医学、计算化学或其他领域研究, 理解并实践分子模拟都能给你一些新的的思考方式，增强你对新问题的分析力与洞察力。
药物设计
生物分子互作基础
1.生物分子互作用研究方法
1.1蛋白-小分子、蛋白-蛋白相互作用原理
1.2 分子对接研究生物分子相互作用
1.3 蛋白蛋白对接研究分子相互作用
蛋白数据库

1. PDB 数据库介绍
   1.1 PDB蛋白数据库功能
   1.2 PDB蛋白数据可获取资源
   1.3 PDB蛋白数据库对药物研发的重要性
   2.PDB 数据库的使用
   2.1 靶点蛋白结构类型、数据解读及下载
   2.2 靶点蛋白结构序列下载
   2.3 靶点蛋白背景分析及相关数据资源获取途径
   2.4 批量下载蛋白晶体结构
   蛋白结构分析
2. Pymol 软件介绍
   1.1 软件安装及初始设置
   1.2 基本知识介绍（如氢键等࿰