现在进行线上培训,“计算机辅助药物设计与应用”和”GROMACS分子动力学模拟技术与应用”两个课程
(课程一) 计算机辅助药物设计与应用
时间地点 2021年05月15日-05月16日 在线直播(授课2天)
2021年05月22日-05月23日 在线直播(授课2天)
授课内容
1 生物分子互作基础 生物分子互作用研究方法
2 蛋白数据库 PDB 数据库介绍及使用
3 蛋白结构分析 Pymol 软件介绍及使用
4 同源建模 同源建模原理介绍 Swiss-Model 同源建模
5 小分子构建 小分子数据库
6 小分子化合物库 小分子数据库
7 生物分子互作用ⅠAutodock 分子对接基础和软件使用及对接结果评价
8 虚拟筛选 柔性对接及分子对接用于虚拟筛选 )
9 生物分子互作用IIZDOCK 预测蛋白-蛋白相互作用
10 构效关系分析3D-QSAR模型构建(Sybyl软件)
11 分子动力学模拟
(课程二)"GROMACS分子动力学模拟技术与应用“
时间地点 2021年5月28日-05月30日
授课内容
1 分子模拟基础理论
2 GROMMACS程序入门----学会编译方法,安装自己的GROMACS可执行程序,并运行一个例子
3 生物体系建模----掌握不同体系快速搭建方法,使学员具有扎实的建模基础
4 模拟结果分子----掌握不同生物体系所需分析方法,生命拓扑结构和坐标文件
5 水溶性蛋白之分子动力学模拟
6 分子动力学结果分析
7 蛋白质结合自由能计算(伞形采样法为例)
8 生物膜磷脂双分子层生物膜、膜蛋白等建模
9 Martini粗粒化力场----可溶性蛋白模拟
10 药物分子开发溶剂筛选
计算机辅助药物设计技术与应用与gromacs分子动力学模拟https://docs.qq.com/doc/DSHdVYllIc3J4aEh6