关于药物设计

【专题一】计算机辅助药物设计
1 生物分子互作基础
2 蛋白数据库
3 pymol软件使用动画制作
4 Swiss-Model 同源建模
5 ChemDraw软件
6 DrugBank、ZINC、ChEMBL等数据库介绍
7 Autodock和薛定谔使用
8 虚拟筛选
9 预测蛋白-蛋白相互作用(ZDOCK)
10 3D-QSAR模型构建(Sybyl软件)
11 基于碎片药物设计(MOE软件)
12 gromacs在药物设计中的作用

【专题二】GROMACS
1 分子模拟基础理论
2 学会编译方法,安装自己的GROMACS可执行程序,并运行一个例子
3 掌握不同体系快速搭建方法,使学员具有扎实的建模基础
4 掌握不同生物体系所需分析方法,生成拓扑结构和坐标文件
5 水溶性蛋白质模拟
6 结果分析计算结构的RMSD 值
7 蛋白质结合自由能计算(伞形采样法为例)
8 生物膜磷脂双分子层生物膜、膜蛋白等建模
9 Martini粗粒化力场–可溶性蛋白模拟
10 药物分子开发溶剂筛选

如对此有兴趣可查看下方链接,帮忙关注并给有需要的人:
https://docs.qq.com/doc/DSHdVYllIc3J4aEh6(原文链接安全)

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