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RSS订阅原创 【单细胞第二节：单细胞示例数据分析-GSE218208】
利用writeLines(paste0(0:11,“,”))，自己手动写，打开一新的text file，将writeLines(paste0(0:11,“,”))的输出写在里边，然后保存在工作目录下，命名为xx.txt。
2025-01-29 10:25:59
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原创 单细胞分析基础-第一节 数据质控、降维聚类
细胞双胞体或多胞体可能表现出异常高的基因数检测UMI数 ：细胞双胞体或多胞体可能表现出异常高的基因count数线粒体基因%：低质量/垂死的细胞常常表现出大量的线粒体污染；代谢旺盛的细胞中线粒体数目多，如心肌(50%)，小肠，肝脏(20%)，肾脏人为设定的一些经验标准，例如：单细胞中鉴定到的gene数量（？和差异基因里面的上调基因有点类似，某个基因在某一簇细胞里表达量都很高，在其他簇表达量很低，那么这个基因就是这簇细胞的象征。高变基因：在一些细胞中表达高，另一些细胞中表达低的基因。单细胞中UMI的总数（？
2025-01-28 21:47:47
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原创 【cran Archive R包的安装方式】
ad= archive包的网址或者是下载到工作目录下，ad等于文件名。2.包要求的R语言版本与你电脑上的版本不相符。1.包被cran移除。
2025-01-27 21:23:01
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原创 06-RNA-seq数据分析全部流程-从拿到原始测序数据开始，从上游到下游分析，看这一篇就够了
RNA-seq分析详细流程，从拿到原始数据，到上游数据分析，下游数据分析，功能分析
2024-12-14 19:07:07
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原创 GEO数据挖掘-GEO背景知识+表达芯片分析思路
1.图表分析2.GEO背景介绍及分析思路3.代码分析流程4.复杂数据分析提示：这是GEO数据挖掘的大概内容：广义的基因有 6w+个，如何缩小范围到课题相关？1.数据从哪里来2.有什么类型的数据可挖掘基因表达芯片转录组单细胞突变(
2024-05-16 15:33:43
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原创 【if条件、for循环、数据框连接、表达矩阵画箱线图】
把第一个脚本产生的几个有效变量存下来了，存到Rdata里边，下次直接load Rdatarm(list = ls()) #每个脚本运行之前都记得清空环境变量哦为什么用Rdata而不是表格文件来衔接1.变量，自带变量名称，不需要赋值，也没有参数2.表格文件，需要赋值，读取参数的不同会导致读取结果不同，不能在后续代码里同等处理。3.Rdata可以一次保存多个变量，下次只需要一次load就能得到多个数据。4.Rdata不仅可以保存数据框，还可以保存其他任何数据结构。
2024-05-15 21:13:34
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原创 【ggplot、图片导出、字符串、数据框处理】
ggpubr 搜代码直接用，基本不需要系统学习sthda上有大量ggpubr出的图有引号，函数都是gg开头，并且把ggplot的不同函数变成了不同参数图更好看，比较适合新手，但是扩展性没有那么强#将向量放list里边添加显著性标记：comparison参数的要求：需要是个list列表，并且里面的内容都要是长度为2的向量，并且里面的内容必须是列名。
2024-05-14 16:44:25
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原创 R语言基础--文件读写
header 管行名，check.names管列名，row.name管要不要检查列名在R语言中，header 是一个参数，经常出现在读取数据文件的函数中，如 read.csv() 或 read.table()。这个参数决定了函数在读取文件时是否应该将文件的第一行作为列名。以下是一些使用 header 参数的常见场景：read.csv()：读取CSV文件时，如果你设置 header = TRUE，R会将文件的第一行作为列名。默认情况下，read.csv() 函数的 header 参数就是 TRUE。
2024-05-08 23:48:51
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原创 R语言基础上--R与Rstudio&数据类型与向量
环境遇到该报错的解决方式：1.忽略2.装python 但不用3.设置选项tools-global options-python-勾选掉自动检查。
2024-05-03 15:53:55
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原创 Linux软件安装
所有语言的包、依赖和环境管理器，适用平台：windows、macOS和Linux官网：Unleash AI Innovation and Value | Anacondahttps://www.anaconda.com/下载安装包 -- bash 安装 -- 接受协议 -- 选择默认安装路径（回车） -- 重新激活环境 -- 调用帮助文档 给新人的建议：不要往base环境里安装任何软件包 “蛇”(anaconda)就应该关在“笼子”(小环境)里 conda creat -n rna -y ##加
2024-04-29 16:14:42
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空空如也
空空如也
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