vasp计算---出现各种错误情况

海蓝时见鲸呀

已于 2022-09-04 21:24:44 修改

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分类专栏： vasp 文章标签： linux

于 2022-09-04 18:13:33 首次发布

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1.项目场景：

项目场景(1)：VASP运行时，出现【forrtl : severe (174) : SIGSEGV, segmentation fault occurred】

出现问题原因

原因：出现报错的主要原因是：由于VASP运行程序较大，所需的存储空间也较大，而Linux系统初始的堆栈大小又太小导致容易出现bug。一般只需将堆栈大小(stack size)调大，一般设置成256M或者没有限制，此错误就会得到解决！

解决方案：

解决方法1：仅当前生效

设置256M：【ulimit -s 262140】
设置无限制：【ulimit -s unlimited】

解决方法2：永久生效
1:在【/etc/security/limits.conf】文件中添加下面两行：

*soft stack unlimited
hard stack unlimited
其中【】表示所有文件生效；【stack】表示堆栈的最大值；【unlimited】表示大小无限制。
2:在【/etc/pam.d/login】文件中添加下面一行：

session required /lib/security/pam_limits.so
其中【/lib/security/pam_limits.so】为电脑中的设置。32位对应【/lib】；64位对应【/lib64】

2.项目场景：

项目场景(2)：出现出现【WARNING: random wavefunctions but no delay for mixing, default for NELMDL】（译：随机波形，但没有混合延迟）

出现问题原因

原因：首先这不是一个错误，只是一个警告，让我们注意INCAR中未明确的NELMDL参数。其默认设置适用于许多体系，但是对于表面，复杂的磁性结构，如果增加NELMDL，通常可以帮助电子收敛，从而延迟初始阶段的电荷密度更新。想要删除此警告，只需在INCAR文件中指定NELMDL，但这不是必需的

解决方案：

解决方法1：

对于使用哈密顿直接最小化的计算（ALGO=ALL或ALGO=DAMPED）：如果设置了NELMDL，戴维森算法在第一个NELMDL步骤中使用，如上所述。由于轨道和电荷密度预测的问题，在VASP.5中使用正的NELMDL（即在每个离子步骤中的延迟）不能可靠地工作。在VASP.6中，使用NELMDL=1（或NELMDL=2）和直接最小化往往能提高分子动力学模拟或松弛的稳定性和效率（ALGO=ALL或ALGO=DAMPED）。然而，请注意，这可能需要人们准备一个合理的WAVECAR文件，因为NELMDL=1/2可能不足以从初始随机数中获得一套合理的轨道。
解决方法2：
对于HF型计算，如果NELMDL大于或等于3，VASP将使用Davidson算法执行NELMDL非自洽步骤，并使用与所选混合函数（即HSE的PBE和PBE0）相对应的半局部DFT函数计算局部哈密尔顿。如果离子在离子步骤之间移动的距离很大，这是很方便的。因此，设置NELMDL=3可以提高使用HF型哈密顿人进行松弛时的稳定性和性能。如果你在使用HF型哈密顿人进行松弛时遇到收敛问题，请尝试使用ALGO=All和NELMDL=3。