森林图

最新推荐文章于 2024-03-24 14:32:38 发布
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分类专栏： 森林图 文章标签： python
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森林图

以统计指标和统计分析方法为基础，用数值计算绘制出的图形，通常是在平面直角坐标系中，以一条垂直的无效

线（0或者1）为中心，用平衡于x轴的多条线段描述每个组指标的中值和可信区间，最后一行用菱形或者其他图形描述的多个组别合并的效应量和可信区间；

森林图解读：

x轴的每个线段：代表每个研究

黑点： 每个研究的点估计值

方块： 代表每个研究所占的权重，权重越大，面积越大，上图中的weight表示的就是权重

60％，占的比重大，所以方块最大；

线段长度：代表研究量的95％可信区间（CI）

箭头：研究的95％可信区间超过了图形的显示范围，所以用箭头表示

菱形中心：代表汇总表结果的点估计值，并用一条垂直x轴的虚线标出

菱形宽度汇总结果的95％可信区间

二分类变量森林图

HR(风险比）

通常以点估计值，也就是x值为1的作为无效线，上图就是，无效线的左侧为因素a,左侧为因素b,

当无效线与横线相交，不能认为a,b因素对结局事件发生风险的影响作用不同

当

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使用R语言进行亚组分析并可视化森林图
PixelEnigma的博客
08-17 1301
当然，在实际应用中，我们还需要根据具体需求进行参数调整和结果解读，以得到准确有效的分析结果。通过以上步骤，我们就可以使用subgroupAnalysis函数进行亚组分析，并通过可视化森林图来展示分析结果。在R语言中，我们可以使用subgroupAnalysis函数来进行亚组分析，并通过可视化森林图来展示结果。最后，我们可以将以上步骤整合到一个完整的代码块中，并对相应参数进行调整，以适应实际数据分析的需求。在上述代码中，我们假设因变量为Y，自变量为X1和X2，而"group"是用于分组的变量。
用于荟萃分析或亚组分析的森林图：绘制用于荟萃分析或亚组分析的森林图-matlab开发
05-30
FORESTPLOT 生成森林图以证明预测变量在多个亚组或跨多个研究中的效果。 森林图是一种图形显示，旨在说明针对同一问题的多项定量科学研究中处理效果的相对强度。 森林图（响应，预测变量，子组，'ArgumentName'，ArgumentValue） response - Nx1 二元向量，其中 N 是患者数量，“1”表示该患者发生了事件/疾病，“0”表示相反，“NaN”表示未知。 当响应是 NxM 矩阵时，每列与一项研究相关联。 如果不同研究中的患者大小不同，则最后用“NaN”填充。 preditor - Nx1 二元向量，其中“1”表示该患者暴露于该治疗或在期望预测值范围内（例如低剂量），“0”表示相反，“NaN”表示未知。 当响应是 NxM 矩阵时，每列与一项研究相关联。如果患者大小在不同研究中不同，则用“NaN”填充。 subgroup - NxM 二元向量，其中“1”表示该患
R语言亚组分析及森林图绘制
医学和生信笔记的博客
09-10 1万+
亚组分析的森林图很常见，在各种高分SCI文章中经常见到，其中我最喜欢NEJM的格式，美观，信息量也多。亚组分析的森林图我们也介绍过很多方法了，其中画出来的森林图还是最美观的，使用起来也不复杂。但是咱们之前只是说了有了数据怎么画图，并没有介绍过怎么实现亚组分析，也有好多粉丝在群里问这个问题，所以今天给大家展示下如何实现COX回归分析的亚组分析，其他回归分析也是同理。并根据结果实现如下样式的森林图：DOI: 10.1056/NEJMoa2206286。
亚组分析和多因素回归的森林图比较
医学和生信笔记的博客
01-03 2906
森林图作为临床文献中常见的图形，相信大家已经不陌生了，我们在之前也介绍过多次森林图的绘制方法了，包括亚组分析的R语言实现等，公众号后台回复即可获取合集。不知道大家有没有注意过，亚组分析的森林图和多因素回归的森林图几乎长得一模一样！比如以下两幅森林图：不得不说，这两幅图的样式虽然不一样，但是都显示了HR及可信区间、P值等信息，而且两幅图都有亚组，我在刚开始学习的时候也是非常疑惑，但是当我手动实现过亚组分析和多因素回归的森林图后，一切就很简单了，无非是长得像而已，但是表达的意思完全不一样！
R语言绘图 | 高级森林图（Forest Plot）| 多种方法详解 | 代码注释 + 结果解读
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weixin_43843918的博客
12-22 3万+
森林图（Forest Plot）用于可视化比较多个研究结果的效应大小和置信区间，通常用于汇总和比较不同研究的结果，特别是在荟萃分析（Meta-Analysis）中。当然，我们之前构建过的也可以用森林图展示结果。森林图提供了一种方式来呈现多个研究的数据，可以帮助我们更好地理解不同研究之间的一致性和差异性，以及整体效应的大小。我们先介绍一下森林图，大家如果不需要的话，也可以跳过这部分直接去看代码实现部分哟！
Meta分析|超详细森林图、漏斗图解读
weixin_60518260的博客
11-27 9189
在结果部分中，heterogeneity（异质性）这一列中的p和I²的值表示了异质性检验的结果，他们的数值大小代表各研究有没有明显的差异。如果效应量是OR,RR,HR这种比值，这条线代表1，横线线段与无效线相交时，提示两组之间结局事件发生率的差异无统计学显著性，如果是RD,MD,SMD这种差值，这条线代表0，可认为两组之间的均数差异无统计学显著性。又称效应框，菱形代表了合并后的效应值和可信区间，其对角线的交点代表合并后的效应值，左右尖端的连线代表了合并后的可信区间，菱形面积代表了合并后的总样本量。
森林图像数据集（2700张图片）.rar
03-06
森林图像数据集通常用于林业管理和环境保护领域的研究，该数据集包含2700张森林相关图片，这无疑为相关领域提供了丰富的视觉材料。图片可能包括不同类型的森林生态系统，不同季节的变化，以及各种植被覆盖和地形特征...
绿色清新森林图片排版背景自然风景PPT模板
07-15
这是一套绿色清新森林图片排版背景的，自然风景PPT模板，共25张。第一PPT模板网提供精美自然风景幻灯片模板免费下载； 关键词：清新绿色树林树林幻灯片背景图片，动态自然风景模板，茂盛植物背景PPT模板，绿色扁平化...
Random-Forest-Image-Classification-using-Python:使用Python的随机森林图像分类
04-29
使用Python进行随机森林图像分类 使用Python的随机森林图像分类 请遵循以下文件夹结构。 图像分类（文件夹） 数据集（文件夹） 火车（文件夹） 图像Cat1文件夹 train_img.jpg train_img.jpg train_img.jpg .....
Meta分析|连续型变量使用STATA制作森林图、漏斗图（附安装包）
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12-10 4165
以上只是Stata基础操作，若有更复杂的操作可联系我们获取帮助哦，青椒医学统计专注医学统计。以医学统计学理论为基础，结合真实的医学数据实际案例，以案例文章、视频教学等形式，详细阐述医学统计原理、操作、统计分析结果撰写、医学统计图表制作等医学统计重难点问题，帮助广大医务工作者彻底解决医学统计中的各种难题。在这里先选择随机模型，因为数据是自己编造的，可能有很大的异质性，统计量选择Cohen，因为Cohen是默认的标准化均数的方法。异质性I-squared=0%小于50%，因此我们应选择的。
用R来做一个临床研究亚组分析的森林图
Mrrunsen的博客
01-29 5061
在编程语言里R语言最强大的功能是做图功能，我们知道在做Meta分析的时候会需要做森林图，实际上我们在很多临床研究中也经常看到森林图，主要是亚组分析的森林图，比如下面这篇文章里的一个森林图： 今天就教教大家怎么用R语言来做上面这种亚组分析的森林图 1. 在Excel里编辑好数据，按照下面的格式整理，保存为csv格式 2. 下载安装R跟Rstudio R软件的下载地址： https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/ Rstudio下
python cox模型_Forest plot（森林图） | Cox生存分析可视化
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02-09 2313
本文首发于“生信补给站”微信公众号，https://mp.weixin.qq.com/s/2W1W-8JKTM4S4nml3VF51w更多关于R语言，ggplot2绘图，生信分析的内容，敬请关注小号，给您干货。Meta分析的结果使用森林图进行可视化展示很常见，其实COX生存分析也能用森林图展示。之前分享过绘制KM曲线R|生存分析(1)，诺莫图展示COX结果Nomogram(诺莫图) | Logis...
R语言广义线性模型：Logistic回归模型的亚组分析及森林图绘制
laugh666的博客
08-11 3634
亚组分析则是在Logistic回归模型基础上进行的一种统计方法，用于探究某个特定因素对不同亚组之间的影响是否存在差异。本文将介绍如何使用R语言进行Logistic回归模型的亚组分析，并使用森林图来可视化结果。通过以上步骤，我们成功完成了R语言广义线性模型Logistic回归模型的亚组分析，并使用森林图进行了结果的可视化。接下来，我们将使用一个示例数据集来演示Logistic回归模型的亚组分析。函数将年龄分为不同的亚组。这段代码将根据年龄的亚组计算每个亚组内发生心脏病事件的概率均值，并使用森林图进行可视化。
R语言亚组分析 (Subgroup Analysis)及森林图绘制实战
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01-14 525
R语言亚组分析 (Subgroup Analysis)及森林图绘制实战
8篇文章详解亚组分析及森林图绘制
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12-15 2163
森林图作为常用的数据展示方法，在R中的实现方式非常多，不管是多因素回归的森林图还是亚组分析的森林图，还是meta分析的森林图，都可以在R语言中找到合适的绘制工具，其颜值高，可定制化强，但部分R包使用起来具有一定的门槛，不如ggplot2系列简单好用。本文总结了一些常见的森林图绘制方法，不过对于一些简单的数据来说，肯定是首推使用ggplot绘制。这样有关亚组分析和森林图绘制的教程就全了，大家可以在此基础上进行各种个性化的修改。免费QQ交流群1：613637742（已满）知乎、CSDN、简书同名账号。
R语言Logistic回归模型亚组分析森林图(forest plot)绘制
statistics+insight+vista+power
03-24 1236
R语言Logistic回归模型亚组分析森林图(forest plot)绘制
森林图NA
最新发布
03-08
### 关于处理森林图中的缺失值 在创建森林图时遇到`NA`（即缺失值），无论是使用R还是Python库，都需要特别注意如何处理这些缺失的数据点以确保图表的有效性和准确性。 #### 使用R绘制森林图并处理缺失值 对于R语言而言，在构建森林图之前可以先清理数据集内的缺失值。例如，当利用`metafor`包来制作森林图时，可以通过预先筛选掉含有`NA`的行或者填充合理的数值替代它们[^1]： ```r library(metafor) # 假设df是一个包含效应量及其标准误的数据框 clean_df <- df[complete.cases(df), ] # 删除任何有NA的记录 res <- rma(yi, vi, data = clean_df) # 进行元分析计算 forest(res) # 绘制森林图 ``` 如果希望保留原始数据结构而不删除带有`NA`的观测，则可以选择用均值或其他统计方法填补缺失位置后再绘图。 #### 利用Python实现带缺失值处理的森林图 而在Python环境中，通常会借助`matplotlib`加上专门用于医学研究领域数据分析的`statsmodels`或第三方扩展如`forestplot`来进行操作。同样地，面对存在`NaN`的情况，应该采取适当措施解决这个问题再继续作图过程[^3]: ```python import pandas as pd from matplotlib import pyplot as plt from statsmodels.stats.meta_analysis import combine_effects import forestplot as fp # 加载数据至DataFrame对象dataframe中... # 对应列名分别为effect_size和stderr代表各研究的效果大小及标准误差 mask = ~pd.isnull(dataframe['effect_size']) & ~pd.isnull(dataframe['stderr']) filtered_data = dataframe[mask] ci_low, ci_upp = combine_effects(filtered_data.effect_size.values, filtered_data.stderr.values).conf_int() fig, ax = plt.subplots() fp.forestplot(ax=ax, estimates=filtered_data.effect_size.tolist(), cis=[ci_low.tolist(), ci_upp.tolist()], study_labels=['Study ' + str(i+1) for i in range(len(filtered_data))], xlabel='Effect Size') plt.show() ``` 上述代码片段展示了两种不同编程环境下针对可能存在缺失项的数据源生成森林图的方法，并且都包含了对潜在`NA/NaN`问题解决方案的一部分介绍。
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