R语言--森林图制作

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已于 2024-01-10 17:37:26 修改

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分类专栏： R语言数据分析/可视化/机器学习/临床预测模型神经影像合集-Freesurfer/FSL/R/python 磁共振数据分析/临床预测模型/机器学习/深度学习文章标签： windows

于 2023-07-21 14:00:14 首次发布

本文链接：https://blog.csdn.net/blank0814/article/details/131850470

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磁共振数据分析/临床预测模型/机器学习/深度学习同时被 3 个专栏收录

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本文档将指导你如何在R语言环境中制作森林图。首先，你需要准备好数据，例如data5，然后通过R的特定包和函数进行绘制。森林图是一种常用于展示多个研究结果并比较其效应大小和置信区间的图表。

摘要由CSDN通过智能技术生成

#数据准备- data5

    #install.packages("rmda")
    rm(list=ls())
    library(MASS)
    library(rmda)
    library(dplyr)              #mutate依赖环境
    library(magrittr)       <

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R语言 森林图

Mrrunsen的博客

02-05

9369

案例今天介绍的用于画森林图的R包为forestmodel，用到其中的函数forest_model，这个函数可以接收lm、glm、coxph等函数拟合的模型。我们先来画一个cox模型的森林图 library(forestmodel) library(survival) lung$ph.ecog<-factor(lung$ph.ecog) lung$sex<-factor(lung$sex) model<-coxph(Surv(time,status)~.,lu...

R语言临床研究亚组分析的森林图

Mrrunsen的博客

07-25

644

本教程将带您逐步学习如何使用R语言创建临床研究亚组分析的森林图。森林图是一种用于比较不同亚组之间效果的常用图形。我们将使用R中的metafor包进行亚组分析，并利用ggplot2包绘制森林图，以直观地展示研究结果。让我们开始吧！

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R语言绘制森林图

weixin_62802660的博客

12-18

8589

在绘制森林图之前当然需要先下载RStudio软件啦，在下载后需要安装对应的rtool,最后将两者关联起来才能使用其中对应的包，否则只安装了软件很多功能不能使用而且还会报错，这篇文章主要是总结怎么使用forestploter包绘制森林图，本来是想使用python绘制的，但是网络上关于python绘制森林图可参考的文章寥寥无几，所以这次使用R语言进行绘制森林图，而且更加简单，关于森林图的介绍在上篇文章中已经整理了一些资料。（3）使用对应的函数对其中的数据显示各层次进行配置，最后显示。如果将数据传送的代码改成。

代码+视频，手把手教你R语言使用forestploter包绘制单组及双组森林图

dege857的博客

01-05

2798

森林图在论文中很常见，多用于表示多因素分析中的变量与结果变量的比值效应，可以用图示的方法比较直观的绘制出来。既往我们在文章《R语言快速绘制多因素回归分析森林图（1）》已经介绍了怎么绘制森林图，但是绘图比较简单，不够美观，不能绘制相对复杂的森林图。今天我们来介绍一下forestploter包，它等于是在forestplot包的基础上进一步强化功能，制作方法也相对简单一点，而且加强了对图形的精细控制，而且可以绘制单组和多组森林图。 R语言使用forestploter包绘制单组及双组森林图代码：

R语言绘图 | 高级森林图（Forest Plot）| 多种方法详解 | 代码注释 + 结果解读

weixin_43843918的博客

12-22

2万+

森林图（Forest Plot）用于可视化比较多个研究结果的效应大小和置信区间，通常用于汇总和比较不同研究的结果，特别是在荟萃分析（Meta-Analysis）中。当然，我们之前构建过的也可以用森林图展示结果。森林图提供了一种方式来呈现多个研究的数据，可以帮助我们更好地理解不同研究之间的一致性和差异性，以及整体效应的大小。我们先介绍一下森林图，大家如果不需要的话，也可以跳过这部分直接去看代码实现部分哟！

R语言画森林图方法4

医学和生信笔记的博客

08-07

9811

专注R语言在临床医学中的使用，R语言数据分析和可视化。主要分享R语言做医学统计学、meta分析、网络药理学、临床预测模型、机器学习、生物信息学等。

R语言|绘制森林图

weifanbio的博客

10-29

1万+

森林图指的是对不同研究提出同一研究问题，用一系列轴来呈现转换为同一统计量的研究结果。除了meta 分析外，森林图还广泛应用于观察性研究和临床试验，例如风险分析/生存分析等结果。最大的优势是简单直观地展示单一研究和汇总研究。今天小编就用forestplot包绘制森林图,仅供参考哦~ 代码如下： 1.安装并调用forestplot包 BiocManager::install("forestplot") library(forestplot) 2.生成模拟数据，共5个模型 g1 <- rnorm(100,

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R语言：多因素Cox回归森林图 (基于forestplot包) 森林图 cox可视化

生信小博士的博客

10-15

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计划是介绍一下单因素、多因素、亚组分析、其他类型森林图绘制；列线图部分介绍下基本的变量筛选方法、绘制过程、验证方法（ROC/DCA/校准图/分组比较等）、网页版列线图。其中，1.2是对表的修改，改完表，图就改了；3-5步是通过改字体、线宽等优化的。三-4、字体大小增粗、线条粗细、线型（包括置信区间）、行间距、列间距；三-3、加水平线、垂直辅助线、x周标签、大标题、森林图占比；三-5、颜色、HR方块形状等。三-2、显示所有亚组的患者数。三-1、显示所有变量；三-2、加入患者数目；三-1、显示所有变量。

R语言使用forestploter包绘制单组及双组森林图（2）（附有超详细备注）

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dege857的博客

11-15

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今天我们来介绍一下forestploter包，它等于是在forestplot包的基础上进一步强化功能，制作方法也相对简单一点，而且加强了对图形的精细控制，而且可以绘制单组和多组森林图。Est：效应值，可以是OR或者HR，low：效应值的最低值，可以认为是可信区间的下限，hi：效应值的最高值，可以认为是可信区间的上限。最后绘图，这里我要说一下，ci_column = c(3, 5)是指在第3和5列绘图，est_gp1和est_gp2为一组，est_gp3和est_gp4为一组，其他的依次类推。

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August 29, 2013 Breiman and Cutler’s random forests for classification and regression Version 4.6-7

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R语言快速绘制多因素回归分析森林图

Mrrunsen的博客

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age表示年龄，pathsize表示病理肿瘤大小（厘米），lnpos表示腋窝淋巴结阳性，histgrad表示病理组织学等级，er表示雌激素受体状态，pr表示孕激素受体状态，status结局事件是否死亡，pathscat表示病理肿瘤大小类别（分组变量），ln_yesno表示是否有淋巴结肿大，time是生存时间，后面的agec是我们自己设定的，不用管它。这个包自带了一个多因素回归分析的analyse_multivariate函数，用它来拟合模型，这里注意一下，这个函数是用逗号分隔的，不是用加号。...

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weifanbio的博客

05-07

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R|foestplot包绘制森林图forest plot 小编今天给大家分享的是foestplot包绘制组间差异比对图（森林图forest plot）相关方法。森林图(forestplot)常用于Meta分析，可用于表达统计指标的效应量和置信区间。绘图示例 #安装包 #install.packages("forestplot") #加载包 library(forestplot) #输入文件 inputFile="input.txt" #输出文件 outFile="forest.pdf" #设置路径 set

R语言森林图：可视化效果出众的统计结果展示方法

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通过以上代码，我们可以绘制出具有清晰效果的森林图，用于展示统计结果。根据实际需求，我们可以进一步调整图表的样式、颜色和布局，以满足特定的展示要求。森林图（Forest Plot）是一种常用于展示统计结果的图表，通过矩形线段表示每个研究的效应大小及其置信区间。本文将介绍如何使用R语言绘制森林图，并提供相应的源代码。接下来，我们准备一些模拟数据来演示绘制森林图的过程。假设我们有三个研究，每个研究都报告了某种治疗方法的效果大小和置信区间。等参数，可以自定义点和误差线的样式。函数设置坐标轴标签和标题，使用。

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小编又来了~~！R语言科研统计/作图第二期森林图PS：上一期推出之后，有不少小伙伴建议小编讲讲使用场景。那我们就从这一期开始，小编会在开始的部分以对话的形式向大家简单介绍使用场景。因为太多忠实funs，小编觉得后面每一期都直接上中阶版，回馈大家的厚爱。希望大家帮忙分享/转发给你们身边有需要的人，谢谢！Let'sGo!读者：什么是森林图？该什么时候用呢？小编：森林图常见于元分析...

R语言绘制一些常见的图形（相关性热图、曼哈顿图、森林图）