Python在生物信息学中的应用：序列化Python对象

我们需要将Python对象序列化为字节流，这样就可以将其保存到文件中、存储到数据库中或者通过网络连接进行传输。

解决方案

序列化最普遍的做法是使用 pickle 模块。为了将一个对象保存到一个文件中，可以这样做：

import pickle


data = ... # Some Python object
f = open('somefile', 'wb')
pickle.dump(data, f)

为了将一个对象转储为一个字符串，可以使用 pickle.dumps() ：

s = pickle.dumps(data)

为了从字节流中恢复一个对象，使用 pickle.load() 或 pickle.loads() 函数。比如：

# Restore from a file
f = open('somefile', 'rb')
data = pickle.load(f)


# Restore from a string
data = pickle.loads(s)

讨论

对于大多数应用程序来讲，dump() 和 load() 函数的使用就是你有效使用 pickle 模块所需的全部了。它可适用于绝大部分Python数据类型和用户自定义类的对象实例。如果你碰到某个库可以让你在数据库中保存/恢复Python对象或者是通过网络传输对象的话，