生物信息学算法之Python实现|Rosalind刷题笔记：011 DNA六框翻译

开放阅读框（Open Reading Frame, ORF）是由起始密码子开始，直到终止密码子结束，中间不含有其他终止密码子的核酸序列。由于 DNA 是双链结构，任何一条链都可以作为模板合成 RNA；并且又因为遗传密码是三联体，由三个核苷酸决定一个氨基酸，因此对于一段 DNA 序列，有六种可能的阅读框（正向三个，反向三个）。通常情况下，六种阅读框只有一种是正确的：一般是翻译得到最长氨基酸序列的阅读框。

图源：rosalind.info

给定： Fasta 文件中一条长度不超过 1kb 的 DNA 序列。

需得： 不同的由 ORF 翻译而来的蛋白序列。返回翻译的蛋白序列时可以是任意顺序。

示例数据

>Rosalind_99
AGCCATGTAGCTAACTCAGGTTACATGGGGATGACCCCGCGACTTGGATTAGAGTCTCTTTTGGAATAAGCCTGAATGATCCGAGTAGCATCTCAG

示例结果

MLLGSFRLIPKETLIQVAGSSPCNLS
M
MGMTPRLGLESLLE
MTPRLGLESLLE

Python 实现

Open_Reading_Frames.py