息肉分割数据集kvasir-seg的处理

最新推荐文章于 2025-03-03 14:15:29 发布
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分类专栏： 深度学习 文章标签： 机器学习 人工智能 pytorch
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虽然做息肉分割除了kvasir-seg也没有太多好的选择，但这个数据集的问题挺多的，不能直接使用。相比其他领域的数据集，这个数据集真的很粗糙。

首先，需要二值化

kvasir-seg数据集作为一个只有单一前景的分割任务，按理说其mask只能是二值化的，但是现在却有不止两种值。其黑色区域的值可能是0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7,8；白色区域可能是48, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255等。需要先做二值化。

其次，维度问题，要注意，最后输入训练的mask的channel必须是1.

第三，要注意用torch.FloatTensor将读取的图片数据转换为float类型，否则会报错

分段息肉数据库Kvasir-SEG介绍和下载
网易搬砖头
01-29 1355
Kvasir-SEG 是胃肠道息肉图像和相应分割掩模的开放访问数据集，由医生手动注释，然后由经验丰富的胃肠病学家验证。 翻译过来是逐像素图像分割，它是医学图像分析中一项要求很高的任务。很难找到具有相应分割掩模的带注释的医学图像。在这里，我们介绍 Kvasir-SEG。它是胃肠道息肉图像和相应分割掩模的开放访问数据集，由经验丰富的胃肠病学家手动注释和验证。这项工作对于研究人员将来重现结果并比较他们的方法非常有价值。通过向 Kvasir 数据集添加分割掩模（迄今为止该数据集仅包含逐帧注释）
hyper-kvasir:Hyper-Kvasir数据集的GitHub存储库
05-19
超级克瓦西尔 这是Hyper-Kvasir数据集的代码存储库，它是最大的公开发布的胃肠道图像数据集。 数据集总共包含110,079张图像和373个视频，在其中捕获解剖标志以及病理和正常发现。 结果是超过110万个图像和视频帧。 完整的数据集可以通过以下方式下载： ： 可以通过以下访问描述数据的论文： : 在这里，您将找到用于准备数据集，创建基线实验以及数据集的官方k倍分割的文件。 储存库结构 该存储库具有以下结构。 category_experiments包含用于执行本文中介绍的分类实验的文件。 clustering_experiments包含本文中介绍的用于聚类实验的文件。 这包括数据集未标记图像上的预测标记。 official_splits包含数据集的正式拆分。 我们建议该数据集的用户使用这些拆分，以确保公平地比较结果。 脚本包含一系列不同的脚本，这些脚本用于准备数据集，
图像分割数据集：息肉（Kvasir-SEG）分割（2分割）【数据集+classes文件+数据可视化代码】
05-27
项目包含：息肉（Kvasir-SEG）分割（2分割）【数据集+classes文件+数据可视化代码】 数据为息肉分割，前景采用0 255的阈值分割，前景区域清晰明显，具体的参考classes文件 图像分辨率为：332x487 - 1920x1072 数据格式：jpg mask标签格式：jpg 数据集介绍：分为训练集、测试集 训练集：images图片目录+masks模板目录，700张图片和700个对应的mask图片 测试集：images图片目录+masks模板目录，300张图片和300个对应的mask图片 除此之外，包含一个图像分割的可视化脚本，随机提取一张图片，将其原始图片、GT图像、GT在原图蒙板的图像展示，并保存在当前目录下。脚本不需要改更改，直接运行即可显示可视化结果
LOD-Net:用于息肉分割的可学习的定向导数网络
04-06
用于息肉分割的可学习的定向导数网络 抽象的 胃肠息肉是结直肠癌的主要原因。 考虑到息肉在大小，颜色，质地和内窥镜检查带来的不良光学条件方面存在差异，息肉分割仍然是一个具有挑战性的问题。 在本文中，我们提出了一个可学习的定向导数网络（LOD-Net），以提炼息肉的边界预测准确性。 具体而言，它首先计算息肉在每个像素处的八个定向导数。 然后，选择那些具有较大定向导数值的像素来构成息肉的候选边界区域。 最后，它通过融合边界区域特征以及由骨干网络计算出的高级语义特征来完善边界预测。 大量的实验和消融研究表明，与最新技术相比，拟议的LOD-Net在包括CVC-ClinicDB，Kvasir，ETIS和EndoScene在内的公开数据集上具有可观的优势。 数据集 我们遵循的数据设置。 您可以下载数据集并将其处理为COCO格式以进行培训和测试。 结果 CVC诊所数据库 克瓦西尔 ETIS 内幕 模型
【结肠息肉AI论文集】结肠息肉分类数据集合集1
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weixin_43571113的博客
03-03 1067
结直肠癌（CRC）是全球癌症死亡的主要原因之一。尽管早期息肉切除术可降低CRC发病率，但90%的息肉为小型且微小，切除这些息肉存在患者风险可能超过获益的情况。在内镜检查中正确检测并预测息肉类型可使内窥镜医师切除并丢弃组织而无需进行组织学送检，从而节省时间和成本。然而，人类对早期息肉的视觉观察存在差异。因此，本文旨在开发一种全自动算法以检测并分类增生性和腺瘤性结直肠息肉。腺瘤性息肉应当切除，而远端微小增生性息肉则被视为临床无关紧要并可保留原位。
CVC-ClinicDB息肉医学图像分割公开数据集
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CVC-ClinicDB息肉医学图像分割公开数据集，内涵612张图片，612张图片标签(也可自行划分训练集与测试集)。科研小白初入图像分割领域必备数据集，深度学习模型常用！！！！小白必要数据集！！！
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医学图像分割数据集：息肉肿瘤分割数据集（包含训练集和测试集、标签） 【3类别的分割，背景、非肿瘤性息肉、肿瘤性息肉】 数据集介绍：分为训练集、测试集 训练集：images图片目录+masks模板目录，800张图片和800个对应的mask图片 测试集：images图片目录+masks模板目录，200张图片和200个对应的mask图片 除此之外，包含一个图像分割的可视化脚本，随机提取一张图片，将其原始图片、GT图像、GT在原图蒙板的图像展示，并保存在当前目录下
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1、YOLO直肠息肉检测数据集，标签格式我txt和xml两种，可以直接用于YOLO直肠息肉检测 2、数据集和检测结果参考：https://blog.csdn.net/zhiqingAI/article/details/124230743
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总的来说，Kvasir-SEG数据集为医疗图像处理提供了一个宝贵的资源，有助于推动医疗图像分析技术的发展，尤其是在息肉检测和分割方面。通过对这个数据集的深入研究和模型训练，我们可以期待在临床实践中实现更准确、更...
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01-22
Kvasir-SEG是一个针对结肠息肉像素级分割的内窥镜数据集，举办过MediaEval 2020的比赛。它包括1000张胃肠息肉图像及其对应的分割掩码，这些图像都由资深胃肠病专家亲自标注和核实...kvasir-sessile内窥镜图像分割数据集
kvasir数据集
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The Kvasir-SEG Dataset
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### 关于CVC-300息肉分割数据集的信息 #### 数据集概述 CVC-300是一个专门针对结肠镜检查中的息肉检测和分割设计的数据集。该数据集中包含了高质量的内窥镜视频片段，这些片段被转换成静态图像并进行了精确的手动标注[^1]。 #### 获取途径 对于希望获取此数据集的研究人员来说，可以通过访问官方资源网站来下载。具体而言，可以前往西班牙瓦伦西亚理工大学计算机视觉中心(CVC)发布的页面进行申请和下载。通常这类医学影像数据库会要求使用者注册账号并通过一定的审核流程以确保数据使用的合法性和适当性[^3]。 #### 使用说明 当涉及到如何利用CVC-300开展研究工作时，建议遵循如下指南： 为了使模型能够更好地学习到特征，在预处理阶段应当考虑对原始图片做标准化操作；同时也要注意调整输入尺寸使之适应所选网络架构的要求。另外值得注意的是，由于医疗领域内的样本往往存在类别不平衡现象，因此可能还需要采取一些策略比如过采样少数类或者加权损失函数等方式来进行优化[^4]。 ```python import os from PIL import Image import numpy as np def load_images_from_folder(folder): images = [] for filename in os.listdir(folder): img_path = os.path.join(folder,filename) if img_path.endswith(".png"): img = Image.open(img_path).convert('RGB') image_array = np.array(img) images.append(image_array) return np.array(images) train_data_dir = 'path_to_CVC_300_dataset/images' masks_data_dir = 'path_to_CVC_300_dataset/masks' X_train = load_images_from_folder(train_data_dir) Y_train = load_images_from_folder(masks_data_dir) ```
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