视频课:20210603 Basic Concepts And GUI (youtube.com)
在python在输入下面的语句导入neuron包
from neuron import h,gui
h可以让python访问所有 all of neurons computational engine and any of neurons functions classes types ariables parameters
打开neuron对话框
输入quit()退出gui
quit()
在gui界面下选择buid->cell builder
将显示
About——介绍+使用说明
Topology——可以设置一些模型单元分支
Subsets——相似属性单元分支进行分组
Geometry——设置模型细胞长度、直径、空间离散化
Biophysics——指定特定通道、膜电容、细胞质电阻率
点击Topology
左边白色框中有一个soma,
点击Geometry->soma->area可以修改zarea
取消specify Strategy可以看到相应的值
保存这个初始简单的simple.ses,以此可以直接在python中导入
h.load_file('simple.ses')
点击tools-RunControl,以及Graph->Voltage axis
点击init&Run可以在右边看到横线
点击Point manager
在SelectPointProcess中选择IClamp
del——delay
due——脉冲持续时间
点击RunControl中的init&run,可以看到图像展示不全。点击下面左图白色区域左上角的白色小框,拖动鼠标,点击View=plot,即可查看全部
,
如果需要绘制电流图,点击Graph->Current axis,但图像是空的,需要点击红色方框内的白色方框,选择plot what,输入IClamp[0].i
color/Brush可以修改数据颜色,选择颜色和对应线条后需要再次点击图像中的线条
复选框可以在初始值和修改值之间切换
现有这样的目的
按照上面的步骤,打开build->cellbuilder,一次完成修改name,然后点击面板内的“soma”,完成name修改
接着按照下面图片的顺序,修改axon的形状,使其不再是一个圆形