在下载好数据集以后,我们对其进行操作,建立json文件用于说明数据集。
json文件内容如下,使用的数据集是KiTS19数据集,处理完结构如下:
在这个json文件中,v2相较于 nnU-Net v1 相关的重要更改:(取自github nnunet v2说明文档翻译版)
- “modality”现在被称为“channel_names”,以消除对医学图像的强烈偏见
- “labels”的结构不同(name -> int 而不是 int -> name)。这是支持 region-based training所必需的
- 添加了“file_ending”以支持不同的输入文件类型
- “overwrite_image_reader_writer”可选!可用于指定某个(自定义)ReaderWriter 类,该类应 与此数据集一起使用。如果未提供,nnU-Net将自动确定ReaderWriter
- “regions_class_order”仅用于 region-based training基于区域的培训