A1050. 碱基比例

最新推荐文章于 2021-01-13 04:07:10 发布
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分类专栏： 清橙
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这段代码是用C语言编写的，它读取字符串输入，然后计算其中'G'和'C'碱基的比例，并以百分比形式输出。程序通过循环遍历输入字符串，统计'G'和'C'的数量，最后计算并打印它们占总碱基数的百分比。
摘要由CSDN通过智能技术生成

A1050. 碱基比例
时间限制： 1.0s   内存限制： 512.0MB  
问题描述
　　众所周知，组成DNA的碱基有四种:腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)、胸腺嘧啶(T)。有位研究者正在对一段DNA序列做研究，他想知道这段序列中碱基G和C所占的百分比，但他不会编程，序列太长了又不能挨个数。他想请你帮他编程解决这个问题。
　　比如说有序列AGCGCT，长度为6，其中有4个G和C，那么G和C所占
最低0.47元/天 解锁文章
彦小逸
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专栏目录
dna碱基计算方法总结.pdf
07-13
2. **碱基比例关系**：在双链DNA中，A+T的和等于C+G的和，且这个和等于总碱基数的一半。即A+T=C+G=总碱基数/2。 3. **单链与双链的关系**：一条链中A+G的和等于另一条链中T+C的和，同理，一条链中A+T的和等于另一条...
DNA 匹配
zzvswxy的专栏
07-10 807
本文来自 http://www.cnblogs.com/xiaofanke/archive/2013/05/29/3107040.html 萧凡客的博客 蓝桥杯软件大赛12年c本科复赛 脱氧核糖核酸即常说的DNA，是一类带有遗传信息的生物大分子。它由4种主要的脱氧核苷酸(dAMP、dGMP、dCMT和dTMP)通过磷酸二酯键连接而成。这4种核苷酸可以分别记为：A、G、C、T。
HDU 3341 Lost's revenge（AC自动机+状态压缩DP）
ZSQ
08-14 688
Description 给出N个优良的基因段，每段长度小于等于10，只含有AGCT四种碱基。 现给一段基因片段S，|S| Input 多组用例，每组用例第一行为一个整数N表示模式串个数，最后一行为文本串S，以N=0结束输入 Output 对于每组用例，输出对文本串重排列后最多能含有多少优良基因 Sample Input 3 AC CG GT CGAT 1 AA AAA
AC日记——配对碱基链 openjudge 1.7 07
weixin_33910460的博客
11-26 866
07:配对碱基链 总时间限制:1000ms内存限制:65536kB描述 脱氧核糖核酸（DNA）由两条互补的碱基链以双螺旋的方式结合而成。而构成DNA的碱基共有4种，分别为腺瞟呤（A）、鸟嘌呤（G）、胸腺嘧啶（T）和胞嘧啶（C）。我们知道，在两条互补碱基链的对应位置上，腺瞟呤总是和胸腺嘧啶配对，鸟嘌呤总是和胞嘧啶配对。你的任务就是根据一条单链上的碱基序列，给出对应的互补链上的碱基序...
碱基序列匹配 （25 分）
Bright的博客
10-24 5312
地理项目是IBM和国家地理学会的合作研究项目，从成千上万捐献的DNA分析地球上人类是如何繁衍的。 作为一个IBM的研究人员，请你写一个程序找出给定的DNA片段之间的相同之处，使得对个体的调查相关联。 一个DNA碱基序列是指把在分子中发现的氮基的序列给罗列出来。有四种氮基：腺嘌呤 (A)、胸腺嘧啶(T)、鸟嘌呤(G)和胞嘧啶(D)，例如，一个6碱基DNA序列可以表示为 TAGACC。 给出一个...
「有趣」基因组上除了ATCGN还能有什么字符
xuzhougeng blog
01-12 2328
今天运行一个程序的时候，出现了一个让我惊讶的报错， 报错 照理说，基因组上的序列应该只有ATCG，以及用来填充gap的N才对，为啥会出现Y呢？于是我用grep又去搜索了下，出现了更多让我看不懂的字符。 离奇现象 为了一探究竟，我展开了一番搜索。由于这个现象不知道怎么描述，于是就随便试试，当然都没有成功。突然脑子闪过一个想法，这不会碱基命名中的用来表示哪些不好...
碱基平衡性与barcode选择共享.pdf
02-28
碱基平衡性是指DNA序列中四种碱基（A、G、C、T）的分布均匀程度，高碱基复杂度意味着更均衡的碱基组成。在二代测序中，如果碱基组成不平衡，可能会影响数据质量和测序效率。 首先，理解碱基平衡性的概念。一个基因...
第2节DNA子的结构.pdf
最新发布
06-21
4. 碱基比例与DNA稳定性：G-C碱基对由于形成3个氢键，稳定性高于A-T的2个氢键。因此，DNA分子中G-C碱基对比例越高，其稳定性越强。 5. DNA的碱基组成：DNA分子中含有4种不同的碱基——腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、鸟...
2022生物化学期末考试试卷(A)整理.pdf
03-11
- DNA聚合酶在合成过程中遵循碱基配对规则，根据给定序列，预测新掺入的核苷酸比例。 10. **RNA聚合酶**： - 大肠杆菌RNA聚合酶的σ因子负责识别启动子，启动转录过程。 11. **氧化磷酸化**： - 2,4-二硝基酚是...
丰台区2020-2021学年度第二学期期中考试联考试题(A).pdf
11-04
DNA中的碱基配对通过氢键形成，不同碱基间的氢键数目不同。 10. 同分异构体的鉴别： A. 二甲醚和乙醇与金属钠或钾反应的速率不同，可以鉴别。 B. 二者的相对分子质量相同，测定无法区分。 C. 红外光谱法可以...
DNA序列
qq_44929652的博客
06-22 1162
题目来源 DNA序列 题目描述 一个DNA序列由A/C/G/T四个字母的排列组合组成。G和C的比例（定义为GC-Ratio）是序列中G和C两个字母的总的出现次数除以总的字母数目（也就是序列长度）。在基因工程中，这个比例非常重要。因为高的GC-Ratio可能是基因的起始点。 给定一个很长的DNA序列，以及要求的最小子序列长度，研究人员经常会需要在其中找出GC-Ratio最高的子序列。 解题思路 本题相当于遍历字符串，以每个下标为开始，进行提取子串。 然后相当于找最大值一样，依次打擂台。找到最大值的GC比例
CGAT - Computational Genomics Analysis Tools安装
Bio-IT
01-03 1万+
环境：CentOS 6.5 因为CentOS默认需要python2.7，所以先安装python2.7。 方法参考： ./configure --prefix=/usr/local make && make altinstall 因为yum依赖于python2.6，所以需要altinstall。 https://www.digitalocean.com/commun
Lex和Yacc应用方法(一).初识Lex
热门推荐
草木瓜
03-15 5万+
 Lex和Yacc应用方法(一).初识Lex草木瓜  20070301Lex(Lexical Analyzar 词法分析生成器)，Yacc(Yet Another Compiler Compiler编译器代码生成器)是Unix下十分重要的词法分析，语法分析的工具。经常用于语言分析，公式编译等广泛领域。遗憾的是网上中文资料介绍不是过于简单，就是跳跃太大，入门参考意义并不大。本文通过循序渐进的
Biopython（py012）统计碱基数
wangprince2017
12-09 1643
有一段DNA序列s，统计四种碱基的个数 这个是Rosalind的第一题http://rosalind.info/problems/dna/ 常规处理方法，使用str.count()函数 map自动映射函数后再解包 collections.counter函数 s='AGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGT...
7-12 碱基序列匹配 （25 分）
qq_42529477的博客
11-21 3008
7-12 碱基序列匹配 （25 分） 碱基序列匹配 地理项目是IBM和国家地理学会的合作研究项目，从成千上万捐献的DNA分析地球上人类是如何繁衍的。作为一个IBM的研究人员，请你写一个程序找出给定的DNA片段之间的相同之处，使得对个体的调查相关联。一个DNA碱基序列是指把在分子中发现的氮基的序列给罗列出来。有四种氮基：腺嘌呤 (A)、胸腺嘧啶(T)、鸟嘌呤(G)和胞嘧啶(D)，例如，一个6碱基DN...
文本对齐算法问题
xiaocao9903的专栏
12-30 4088
文本对齐算法就是基于动态规划的文本对齐。 使用的工具是基于nist提供的打分工具 http://www1.icsi.berkeley.edu/Speech/docs/sctk-1.2/sclite.htm 旧帖重发：动态规划法处理文本的几个例子 2007-05-07 21:23:44 分类： 动态规划(1)：最长公共子序列 [注：本文原来
测序质量值的意义
GodSunshine的博客
07-18 2万+
续上一篇，FASTQ格式的每第四行表示这条序列的质量值。用ACSII码表示。 测序仪一般是按照荧光信号来判断所测序的碱基是哪一种的，例如红黄蓝绿分别对应ATCG，因此对每个结果的判断都是一个概率的问题。 Phred Quality Score Probability of incorrect base call Base call accuracy 10
生物学的现代统计方法与应用 第一讲 列联表1：验证Chargaff规则（碱基配对规则）
一个不愿透露姓名的博客
01-13 2047
生物学的现代统计方法与应用 第一讲 列联表的应用1：验证Chargaff规则（碱基配对规则）问题描述：Chargaff规则验证Chargaff规则的统计量 问题描述：Chargaff规则 核苷酸(nucleotide)是核酸的基本组成单位，它以一个含氮碱基为核心，加上一个五碳糖和一个或者多个磷酸基团组成，下面的图是我从维基百科扒来的，感觉非常清晰。含氮碱基有五种，分别是腺嘌呤（A）、鸟嘌呤（G）、胞嘧啶（C）、胸腺嘧啶（T）和尿嘧啶（U）。五碳糖为脱氧核糖的称为脱氧核糖核苷酸，是DNA的单体基本组成单位；五
腾讯笔试 求基因碱基的逆序数
universe_ant的博客
04-04 513
题目描述：已知碱基序列ACGT为正序。求任意碱基序列的逆序数。要求算法的时间复杂度为O(n)。 举例：一序列为AGTCTCG，则其逆序数为7。 #include using namespace std; int reverse_order_number(char *pdna); int main() { char str[] = "ACTCTGA"; c
python统计许多条fastaA序列相同位点的碱基比例
03-23
可以使用Python中的BioPython库来处理fasta文件和序列数据，以下是一个示例代码： ```python from Bio import SeqIO # 读取fasta文件 records = list(SeqIO.parse("sequences.fasta", "fasta")) # 统计碱基比例 base_counts = {} for record in records: for i, base in enumerate(record.seq): if i not in base_counts: base_counts[i] = {'A': 0, 'C': 0, 'G': 0, 'T': 0} base_counts[i][base] += 1 # 输出结果 for i in sorted(base_counts.keys()): total = sum(base_counts[i].values()) print("Position {}: A: {:.2f}%, C: {:.2f}%, G: {:.2f}%, T: {:.2f}%".format( i+1, base_counts[i]['A']/total*100, base_counts[i]['C']/total*100, base_counts[i]['G']/total*100, base_counts[i]['T']/total*100 )) ``` 这段代码可以读取名为"sequences.fasta"的fasta文件，统计所有序列在相同位置的碱基比例，并输出结果。
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