BZOJ1264 [AHOI2006]基因匹配Match

Description

基因匹配（match） 卡卡昨天晚上做梦梦见他和可可来到了另外一个星球，这个星球上生物的DNA序列由无数种碱基排列而成（地球上只有4种），而更奇怪的是，组成DNA序列的每一种碱基在该序列中正好出现5次！这样如果一个DNA序列有N种不同的碱基构成，那么它的长度一定是5N。 卡卡醒来后向可可叙述了这个奇怪的梦，而可可这些日子正在研究生物信息学中的基因匹配问题，于是他决定为这个奇怪星球上的生物写一个简单的DNA匹配程序。 为了描述基因匹配的原理，我们需要先定义子序列的概念：若从一个DNA序列（字符串）s中任意抽取一些碱基（字符），将它们仍按在s中的顺序排列成一个新串u，则称u是s的一个子序列。对于两个DNA序列s1和s2，如果存在一个序列u同时成为s1和s2的子序列，则称u是s1和s2的公共子序列。 卡卡已知两个DNA序列s1和s2，求s1和s2的最大匹配就是指s1和s2最长公共子序列的长度。 [任务] 编写一个程序：  从输入文件中读入两个等长的DNA序列；  计算它们的最大匹配；  向输出文件打印你得到的结果。

Input

输入文件中第一行有一个整数N，表示这个星球上某种生物使用了N种不同的碱基，以后将它们编号为1…N的整数。 以下还有两行，每行描述一个DNA序列：包含5N个1…N的整数，且每一个整数在对应的序列中正好出现5次。

Output

输出文件中只有一个整数，即两个DNA序列的最大匹配数目。

Sample Input

2
1 1 2 2 1 1 2 1 2 2
1 2 2 2 1 1 2 2 1 1

Sample Output

7

HINT

[数据约束和评分方法]
60%的测试数据中：1<=N <= 1 000
100%的测试数据中：1<=N <= 20 000

若长度为n，则：id[i]表示a[i]在b[i]中出现的位置，那么id[i]的LIS即为a[i],b[i]的LCS

若长度为5*n，则：将a[i]在b[i]中的位置全部记录下来，从大到小排序，并变成序列，再对此序列求LIS，即为LCS

求LIS时用 树状数组 维护。

附代码：

#include<iostream>
#include<algorithm>
#include<cstdio>
#define MAXN 100010
using namespace std;
int n,ans=0;
int a[MAXN*5],b[MAXN*5],id[MAXN][7],c[MAXN*5],dp[MAXN*5];
inline int read(){
	int date=0,w=1;char c=0;
	while(c<'0'||c>'9'){if(c=='-')w=-1;c=getchar();}
	while(c>='0'&&c<='9'){date=date*10+c-'0';c=getchar();}
	return date*w;
}
inline int lowbit(int x){return x&(-x);}
void update(int x,int v){
	for(int i=x;i<=n*5;i+=lowbit(i))c[i]=max(c[i],v);
}
int sum(int x){
	int s=0;
	for(int i=x;i>=1;i-=lowbit(i))s=max(s,c[i]);
	return s;
}
int main(){
	n=read();
	for(int i=1;i<=n*5;i++)a[i]=read();
	for(int i=1;i<=n*5;i++){
		b[i]=read();
		id[b[i]][++id[b[i]][0]]=i;
	}
	for(int i=1;i<=n*5;i++)
	for(int j=5;j>=1;j--){
		dp[i]=sum(id[a[i]][j]-1)+1;
		update(id[a[i]][j],dp[i]);
		ans=max(ans,dp[i]);
	}
	printf("%d\n",ans);
	return 0;
}