blast++

最新推荐文章于 2023-03-16 00:13:19 发布
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分类专栏： bioinformatics 文章标签： blast+ manual bioinformatics
海蜒
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Blast+
海骆驼的沙漠
12-20 2394
总是记不住blast的参数设置，现在把参数及用法放在此处，方便以后查阅~ Nucleotide-NucleotideBLAST 2.2.28+ usage   blastn [-h] [-help] [-import_search_strategyfilename]     [-export_search_strategy filename] [-taskt
blastjs:Node.js的BLAST +包装器
05-11
blast.js Node.js的BLAST +包装器可以在上找到一个演示安装如果您尚未安装Node.js，则可以在获得它。npm install blastjs 如果未安装Blast +，则可以运行：node util/getBlast.js 并且Blast +的最新版本将下载并放置...
ncbi-blast 本地安装
weixin_30565327的博客
08-15 3541
详见：http://blog.shenwei.me/local-blast-installation/ Linux系统中NCBI BLAST+本地化教程 本文面向初学者（最好还是懂得基本的linux使用），高手可直接忽视。不介绍Windows系统中的安装方法，一是因为思路一样，二是因为Linux中BLAST效率更高，系统更稳定，不会卡死。所以，请用Linux服务器，我想你...
BLAST+使用方法
热门推荐
立身以力学为先，力学以读书为本。 —郑耕老《劝学》
10-27 1万+
BLAST+与BLAST相比，有很多改进和提高，NCBI强烈推荐放弃BLAST，使用BLAST+， 这里说的BLAST和BLAST+，都是本地的，与之前的那个批量BLAST小程序不是一回事。BLAST下载地址：NCBI BLAST+ 。BLAST+的一般用法如下： 格式化数据库 makeblastdb -in db.fasta -dbtype prot -parse_seqids
BLAST 本地安装后运行blastn command not found: blastn
focus627的博客
04-09 2292
解决方法： export PATH=/usr/local/ncbi/blast/bin:$PATH
NCBI 本地Blast+的学习记录
weixin_46839673的博客
04-24 1348
NCBI 本地Blast+的学习记录 写在前面的话 之前下载的blast+版本为2.1.0，所以出现了以下的情况。 上网查了好多好多问题，才发现是2.1.0这个版本很有问题啊，所以就下载了最新版本的blast+，才得以完成以下的结果。 到官网上下载！！！ 到官网上下载！！！ 到官网上下载！！！ 重要的事情说三遍！！！【所以感叹号也多打了】 ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/2.9.0/ 我的介绍比较新手，可以快速做掉你要做的不是很多的数
往linux系统里下载blast,Linux系统中NCBI BLAST+本地化教程【上】
weixin_31300697的博客
05-14 1595
本文提供在Linux系统中进行NCBI BLAST+本地化的方法。实测环境为Linux64位系统，无ROOT权限。本文面向初学者(最好还是懂得基本的linux使用)，高手可直接忽视。不介绍Windows系统中的安装方法，一是因为思路一样，二是因为Linux中BLAST效率更高，系统更稳定，不会卡死。所以，请用Linux服务器，我想你也不忍心让自己心爱的本本跑几十个小时的程序吧。请不要因为篇幅长，而...
linux系统下 blast,Linux安装blast+及使用
weixin_33223705的博客
05-09 668
下载解压网址：选择预编译的linux版本ncbi-blast-2.10.1+-x64-linux.tar.gz可以用wget ；或者下载后上传服务器解压tar -zxvf ncbi-blast-2.10.1+-x64-linux.tar.gz解压后的文件名是ncbi-blast-2.10.1+ blast+我把它修改成了 blast+绝对路径/home/user024/blast+添加环境变量将B...
linux运行blast,Linux下BLAST+的本地化（BLAST 2.2.29+）
weixin_34218582的博客
04-30 778
Linux下BLAST+的本地化(NCBI-BLAST 2.2.29+):1. 下载软件BLAST:下载: ncbi-blast-2.2.29+-x64-linux.tar.gz (根据自己的操作系统选择)。2. 解压:解压后放在任意目录下都可以，把相应路径加入PATH变量就是。比如解压到用户的主目录(/home/yonpen)下，把解压后的文件夹重新命名为blast，则BLAST+的所有...
Blast+安装使用的简单流程
liduo159357的博客
03-16 1200
通过https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/LATEST/网站下载，并执行安装为了使用BLAST的数据库，需要建立一个文件夹储存它们。
galaxy_blast:适用于NCBI BLAST +和相关BLAST工具的Galaxy包装器
05-05
NCBI BLAST套件是用于生物学序列比较的一组广泛使用的工具。 它可以作为独立的二进制文件使用，可以在命令行中使用，也可以通过NCBI网站进行较小的搜索。 有关更多详细信息，请参见 该存储库用于开发NCBI BLAST +...
ncbi-blast-2.13.0+-x64-win64.tar
07-16
NCBI BLAST+
DCBLAST：分而治之BLAST：使用网格引擎加速NCBI-BLAST +和其他序列分析工具
02-05
DCBLAST：分而治之BLAST：使用网格引擎加速NCBI-BLAST +和其他序列分析工具
ncbi-blast-2.12.0+-x64-linux .tar.gz
11-18
NCBI blast 2.12.0Linux
2024年测风激光雷达行业分析报告.pptx
06-16
行业报告
mapreduce综合应用案例 - 招聘数据清洗.docx
06-16
招聘数据清洗是一个典型的大数据处理任务，可以通过MapReduce来实现高效且可扩展的数据清洗过程。下面是一个简单的招聘数据清洗的MapReduce应用案例： 输入数据准备：将招聘数据集划分为若干个块，每个块包含多条记录。 Map阶段： 每个Map任务负责处理一个数据块。 Map函数解析输入记录，提取关键字段，如职位名称、公司名称、薪资等。 对于每条记录，如果关键字段缺失或格式不正确，可以忽略或标记为错误数据。 输出中间键值对，其中键为职位名称，值为包含相关信息的自定义对象或字符串。 Reduce阶段： 所有Map任务的输出会根据职位名称进行分组。 Reduce函数对每个职位名称的数据进行处理，可以进行去重、合并、计数等操作。 根据需求，可以进一步筛选、过滤数据，如只保留特定行业或薪资范围的职位。 输出最终结果，可以保存为文件或存储到数据库中。 通过以上MapReduce应用，可以高效地清洗大规模的招聘数据，并提供结构化、准确的数据用于后续的分析和决策。此外，由于MapReduce具有良好的容错性和可扩展性，可以处理海量数据并在分布式环境中实现高性能的数据清洗任务。
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Springboot+vue学生管理系统源码 idea导入后端项目，设置好依赖，运行SystemApplication.java 使用vscode或者hbuilderx等工具打开前端项目，运行即可 另外前端vue页打包成静态资源放到后端里面了，即便不运行前端vue项目也是可以的 如果需要修改，则使用npm run bulid重新打包，生成的前端代码，放到后端代码的resources的static目录下
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06-28
### 回答1： NCBI-BLAST-2.13.0-win64是一种基于谷氨酰胺脲和其他生物信息学技术的序列比对软件包。这个软件被广泛用于分析DNA，RNA和蛋白质序列，使得比对过程能够更加快速精确。该软件中包含了多个工具，如核酸和蛋白质序列比对，重排序，序列相似性搜索，基于模板的序列比对等。 NCBI-BLAST-2.13.0-win64具有许多特性和功能，例如可以查询各种序列数据库，对于不同的序列类型具有不同的比对策略，可以进行加速计算和多进程处理，支持多种输出格式，可以进行本地安装等等。此外，其还具有自定义参数和调整比对参数等高级设置。 该软件包已经成为生物医学研究中的重要工具之一，用于生物数据处理、统计学分析以及建立模型和预测。NCBI-BLAST-2.13.0-win64能够帮助研究人员更好的理解生物序列之间的相似性，从而推断其功能和进化关系。这对于进行生物大数据分析和快速挖掘生物信息，为生物医学研究提供更多帮助的重要性无法忽视。 ### 回答2： NCBI-BLAST-2.13.0 -win64 是一款开源软件，是 National Center for Biotechnology Information (NCBI) 提供的序列比对工具之一。该软件适用于 Windows 64 位操作系统，可以在命令行下运行。其中，BLAST 是 Basic Local Alignment Search Tool 的缩写，指的是基本局部比对搜索工具，常用于在大量的生物序列中寻找相似的序列。 NCBI-BLAST-2.13.0 -win64 支持多种输入文件格式，包括 FASTA、GenBank、EMBL 等。它可以对两种或多种序列之间进行 BLAST 分析，查找它们之间的相似性和差异性。与其他序列比对软件相比，NCBI-BLAST-2.13.0 -win64 具有高速度、高准确度、灵活性等特点。此外，它也可以进行多种参数的自定义设置，以适应不同的比对需求。 总之，NCBI-BLAST-2.13.0 -win64 是一款强大的生物信息学工具，可以帮助研究者在大量的生物序列数据中寻找相似的序列，从而推测它们的结构、功能、演化关系等重要信息，为生物学研究提供有力支持。 ### 回答3： ncbi-blast-2.13.0 -win64是一个基于NCBI平台开发的Blast程序的版本号，在Windows操作系统下可用。Blast是一种用于生物信息学研究的算法，用于比对和分析DNA、RNA和蛋白质序列。NCBI-Blast是由美国国家医学图书馆（National Library of Medicine）所提供的一个全球著名的互联网爬虫、文献检索和生物信息资源的网站。NCBI-Blast提供了多个版本，用于不同的平台和操作系统。NCBI-Blast-2.13.0 -win64是专门为Windows 64位操作系统设计开发的版本。它具有以下特点：可以快速比对大规模的DNA、RNA和蛋白质序列；提供多种比对算法，可以根据需要选择适合的算法；支持本地计算机和远程服务器，方便用户按照不同的需求进行使用。总之，NCBI-Blast-2.13.0 -win64是专门为方便Windows 64位用户利用Blast算法比对和分析生物序列而开发的一个工具，可以极大地提高生命科学研究的效率。

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