FASTX-Toolkit安装失败

3.FASTX-Toolkit安装
http://hannonlab.cshl.edu/fastx_toolkit/download.html
#从上述网址下载且解压
 tar -xvzf libgtextutils-0.7.tar.gz -C ~/生物信息学实验
 tar -xjvf fastx_toolkit-0.0.14.tar.bz2 -C ~/生物信息学实验
#配置环境libgtextutils-0.7
sudo apt-get install gcc
sudo apt install make
更改gcc版本
(1)sudo vim /etc/apt/sources.list在末尾增加下面源：
deb http://dk.archive.ubuntu.com/ubuntu/ xenial main
deb http://dk.archive.ubuntu.com/ubuntu/ xenial universe
(2)sudo apt update
(3)sudo apt install gcc-4.8
(4)sudo update-alternatives --install /usr/bin/gcc gcc /usr/bin/gcc-4.8 20

./configure --prefix=/home/yueyifan/生物信息学实验/libgtextutils-0.7
sudo make #(此处出错)
#解决方法
/home/yueyifan/生物信息学实验/libgtextutils-0.7/src/gtextutils/text_line_reader.cpp
修改末尾 return input_stream.good() 即可
 
 sudo make install
 
export PKG_CONFIG_PATH=/home/yueyifan/生物信息学实验/libgtextutils-0.7/lib/pkgconfig:$PKG_CONFIG_PATH

成功

#配置环境fastx_toolkit-0.0.14
./configure --prefix=/home/yueyifan/生物信息学实验/fastx_toolkit-0.0.14
sudo make #(出错)
#解决方法 打开src/fasta_formatter下fasta_formatter.cpp
删除90-94行
改变105（现在的99行）usage();为
printf("%s",usage_string);
exit(0)
make #仍旧不行

求助 2022-10-13