老师让我用GaMD的方法对体系进行分子动力学模拟,这里分享一些我整理的资料,仅供参考嘿嘿。
这是运行的教程,之后还会出一个分析篇。我的体系比较简单是一个单蛋白,里面的参数要根据自己的体系修改噢。还有环境变量的设置也要根据自己的AMBER版本设置好。
链接:https://pan.baidu.com/s/1z3FfnSl9ARakxBAN1rHyGQ
提取码:z4np
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