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杂记
不知道如何分类的文章或者避免管理栏目录过于庞大
丢到里面的文章
一穷二白到年薪百万
程序员
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【Vs code调试C++】
参考文献第一个很重要主要是配置task.json,其余的可以不用管。原创 2023-10-24 15:48:57 · 812 阅读 · 0 评论 -
Python计算两个矩阵的成对距离
【代码】Python计算两个矩阵的成对距离。原创 2023-03-01 15:23:07 · 634 阅读 · 0 评论 -
理解机器学习或深度学习中的特征空间
[1]对于特征空间与机器学习,深度学习的深夜思考[2]理解机器学习中的潜在空间原创 2022-11-07 10:20:42 · 812 阅读 · 0 评论 -
理解信息熵
信息熵在机器学习和深度学习用到的很多如决策树算法、对比学习等。为了深入的学习相关知识,整理一下有关信息熵的东西。此文为自己学习的记录,其中很多内容借鉴了许多资料,相关参考一并在参考文献中列出。原创 2022-10-15 21:58:01 · 210 阅读 · 0 评论 -
什么是匈牙利算法
[1]Hungarian Algorithm(匈牙利算法)原创 2022-10-20 22:28:40 · 112 阅读 · 0 评论 -
【生物信息学】差异共表达网络
[1]差异共表达网络-Co-expression networks[1]RNA-seq数据的基因共表达网络分析原创 2022-06-17 17:22:31 · 322 阅读 · 0 评论 -
【生物信息学】外显子测序的原理及优缺点
外显子测序,可以测Germline突变(胚胎形成时就带有的突变),也可以测体细胞突变(Somatic Mutation),但随着Illumina推出HiSeq X10测序仪,把人全基因组测序的直接成本降到1000美元以下,那么Germline水平的突变呐,已经很少用外显子来测了。目前,外显子测序的主要优势就体现在肿瘤基因测序方面,之所以外显子测序在肿瘤基因测序方面有优势是因为外显子测序,它的测序深度,可以比较容易地做到“深度”测序。它可以比较轻易地达到100X、200X,甚至更深的测序深度。这就有利于测原创 2022-06-16 10:49:04 · 3192 阅读 · 0 评论 -
【生物信息学-基因表达谱】什么是基因表达谱
参考文献[1]什么是基因表达谱(Gene Expression Profiling)?原创 2022-04-25 16:19:32 · 1876 阅读 · 0 评论 -
【生物信息学-单细胞】基因转录调控网络&转录因子调控网络分析
参考文献[1]【转录调控网络】基因转录调控网络——转录因子调控网络分析原创 2022-04-25 10:47:10 · 979 阅读 · 0 评论 -
【生物信息学-单细胞】什么是scATAC-seq
目录1 什么是单细胞测序2 scATAC-seq概念3 参考文献1 什么是单细胞测序科普讲堂|什么是单细胞测序?2 scATAC-seq概念 继单细胞转录组测序scRNA-seq技术之后,在单细胞测序领域独领风骚的10X Genomics公司又开始大力推广它的新产品,scATAC-seq。苦苦追赶测序前沿的小伙伴纷纷发出了害怕被时代抛弃的恐慌声音:ATAC-seq是什么?在这里,笔者就跟大家介绍一下表观遗传学的研究利器ATAC-seq及10X Genomics推出的单细胞ATAC-seq。 A原创 2022-04-19 20:48:26 · 4084 阅读 · 0 评论 -
棋盘分析法-协同药物分析
参考文献[1]Antimicrobial Synergy Study – Checkerboard Testing原创 2022-04-07 15:53:13 · 509 阅读 · 0 评论 -
哈希函数与完美哈希函数
参考文献[1]完美哈希函数(Perfect Hash Function)[2]什么是哈希函数~![3]哈希函数原创 2021-08-10 09:59:13 · 153 阅读 · 0 评论 -
【概念理解】inductive和transductive的理解?
最近在阅读论文的过程中,文章中提到了inductive和transductive问题,在此记录一下他们各自的意义。 inductive是归纳的意思,指的是从特殊到一般的学习。Inductive learning 是从特定任务到一般任务的学习,实际上,我们传统的supervised learning都可以理解为是Inductive learning的范畴:基于训练集,我们构建并训练模型,而后将其应用于测试集的预测任务中,训练集与测试集之间是相斥的,即测试集中的任何信息是没有在训练集中出现过的。即模型本转载 2021-07-24 16:23:56 · 7654 阅读 · 0 评论 -
Conda和pip的区别
pip是python自带的,而conda是安装anaconda或者miniconda提供的,俗称的蟒蛇软件商给的。conda可以用来安装管理python,pip当然不能管理python,pip是python下的,所以用pip来装python不可能,但是connda可以装python有的人不用conda去管理pyhon环境,他们自己安装自己要的python各个版本,然后通过修改全局变量来实现用哪个版本的python(全局变量就是比如你要在桌面的路径中输入python,可以运行,其实就是能用到其实exe文件原创 2020-12-20 20:34:01 · 4482 阅读 · 0 评论 -
为什么神经网络能够飞速发展
神经网络相比于传统算法的优越性只要体现在其在大规模数据的处理性能上。下面是吴恩达在1.4为什么深度学习会兴起的一张片子。 可以看出在下规模的数据上传统算法跟神经网路的方法很难说哪个好哪个差,两种方法的区别主要体现在设计方法的优劣上,设计的好性能好反之查。但是随着数据规模的增长神经网络的方法性能会大大的提高,值得注意的是神经网络的算法一大目的是提高神经网络的计算速度大大的提高算法的迭代效率。...原创 2020-12-06 21:25:08 · 414 阅读 · 0 评论 -
结构化数据与非结构化数据
最近在学习吴恩达讲的深度学习的课程收获了一些东西,以前做数据处理的时候老师听到结构化数据和非结构化数据两个名词但是对它并不是很理解。学习了1.3用神经网咯进行监督学习突然恍然大悟,以NG的课件说明。 左边是结构化的数据右边不是,为什么呢?个人理解如下,在结构化的数据中每个数据的特征是很清晰的比如房价预测案例中,影响房价的特征是房屋的面积、卧室数目等这些特征很清楚。相反在右边的数据中图片中猫的特征是如何呢?语音数据中语音的特征是什么呢?这些不能够很清楚的分辨出来这就是非结构化的数据。...原创 2020-12-06 20:29:13 · 741 阅读 · 0 评论 -
什么是协同过滤
知乎原创 2020-11-15 16:49:35 · 2691 阅读 · 0 评论 -
基因组差异、基因表达差异、基因选择性表达名词辨析
基因组差异、基因表达差异、基因选择性表达名词辨析内容辨析基因组差异 :人类基因组差异,研究的不是DNA(脱氧核糖核酸)上有遗传意义的片断——基因,而是DNA的基本组成单元——单核苷酸之间的碱基差别,即所谓的单核苷酸多态性;基因差异表达:指细胞分化过程中,奢侈基因按一定顺序表达,表达的基因数约占基因总数的5%~10%。也就是说,某些特定奢侈基因表达的结果生成一种类型的分化细胞,另一组奢侈基因表达的结果导致出现另一类型的分化细胞,这就是基因的差别表达。其本质是开放某些基因, 关闭某些基因,导致细胞的分化原创 2020-09-15 09:22:22 · 3983 阅读 · 0 评论