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原创 从零开始进行单倍型分析之理论基础篇
基因是带有遗传信息的 DNA 片段，是遗传的基本单位，控制着生物的各种性状，如眼睛的颜色、血型等。等位基因是位于同源染色体上相同位置、控制同一性状的不同形式的基因。例如，控制人类 ABO 血型的基因有 A、B、O 三种等位基因。
2024-09-13 15:26:49
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原创 从零开始进行单倍型分析之geneHapR数据准备（上）
GFF 文件是一种用于描述基因组特征的文本格式。它能够记录多种基因组特征的位置和属性信息，在基因组注释等领域广泛应用。
2024-09-25 04:30:00
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原创 如何使用R语言进行WGCNA分析
以上是使用 R 语言进行 WGCNA 分析的基本步骤，具体的分析过程可能需要根据实际的数据和研究问题进行调整。
2024-09-19 18:37:15
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原创 从零开始进行单倍型分析之R语言进阶篇（下）
本文主要介绍了 R 语言中变量的保存与导入、表格的导入与输出以及图片的保存相关内容。图片保存分为基础图形系统和 ggplot2 包下的情况，基础图形系统可使用pdf()、png()等函数保存为不同格式的图片，并能调整参数；ggplot2 包中可使用ggsave()函数保存图片；另外，还介绍了eoffice的简单使用。最后，本文介绍了如何获取查看R对象存储的全部或部分属性信息。
2024-09-19 14:57:59
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原创 从零开始进行单倍型分析之R语言入门篇（上）
基本概念R 语言是一种用于统计计算和绘图的编程语言。它提供了丰富的统计和数据分析方法，以及强大的数据可视化功能。在 R 中，数据是操作的核心。数据可以存储在多种数据结构中，例如向量、数据框等。R 语言的特点免费开源：任何人都可以免费使用和修改 R 语言的源代码。丰富的包（package）：有大量的扩展包可用于各种领域，如数据分析、机器学习、生物信息学等。强大的数据处理能力：能够轻松处理和分析大型数据集。优秀的可视化功能：可以创建高质量的统计图表和数据可视化图形。二、R 语言风格语言风格。
2024-09-14 09:37:12
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原创 geneHapR 的常见问题
过去一年多时间里，很多人在学习、使用geneHapR进行单倍型分析，在使用过程中遇到了一些问题。对一些常见问题进行汇总如下，方面后来者学习。
2024-09-09 22:45:25
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原创 geneHapR | 基因单倍型分析常见问题
一般地，进行单倍型分析的不同个体之间并没有直接的亲缘关系，个体A的基因型不影响B的基因型。然而，基因型填补软件多是基于群体中其他个体的基因型对缺失的基因型进行填补，所以填补出来的基因型与实际情况并不相符。如果群体类型是重组自交系，由于不同株系的基因型均来自双亲，使用填补基因型的软件是没有问题的。时提示错误，可能是某个依赖的包没有装上，可以重新安装geneHapR，尝试阅读报错信息，按照提示逐个安装缺失的R包即可。如果实在安装不上，那么将R卸载掉并删除所有本地的R包，然后再重新安装，一般都能解决。
2023-05-31 23:13:56
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geneHapR附带文件 OsGHD7基因型、表型和注释信息
2024-09-10
空空如也
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