从零开始进行单倍型分析之R语言入门篇（上）

从零开始进行单倍型分析

（一）基础知识篇
（二）分析工具篇
（三）R语言入门篇（上）（只讲需要的）
（四）R语言入门篇（下）（只讲需要的）
（五）数据准备及软件实操篇
（六）结果诠释篇

本文主要介绍了 R 语言的基本信息，包括其简介、风格、基础变量等内容。R 语言是用于统计计算和绘图的编程语言，具有免费开源、包丰富、数据处理和可视化能力强等特点。其语法简洁灵活，区分大小写，注释包括单行注释和多行注释。基础变量涉及变量的命名与赋值规则，数据类型有数值型、字符型、逻辑型、复数型和原始型，运算符包括算术、逻辑和比较运算符。基本变量类型有向量和数据框，向量可通过多种方式创建和操作，数据框可通过特定函数创建、进行元素访问、添加删除列、合并等操作，并有相关属性和函数。此外，文章还提及了其他变量类型，但未详细介绍，推荐了菜鸟教程网站供读者进一步学习。

一、R语言简介

• 基本概念

  • R 语言是一种用于统计计算和绘图的编程语言。它提供了丰富的统计和数据分析方法，以及强大的数据可视化功能。
  • 在 R 中，数据是操作的核心。数据可以存储在多种数据结构中，例如向量、数据框等。

• R 语言的特点

  • 免费开源：任何人都可以免费使用和修改 R 语言的源代码。
  • 丰富的包（package）：有大量的扩展包可用于各种领域，如数据分析、机器学习、生物信息学等。
  • 强大的数据处理能力：能够轻松处理和分析大型数据集。
  • 优秀的可视化功能：可以创建高质量的统计图表和数据可视化图形。

二、R 语言风格

语言风格

• R 语言的语法简洁且灵活。它使用函数来执行各种操作，函数的调用格式通常是function_name(arguments)。
• R 是区分大小写的，这意味着myVariable和myvariable是不同的标识符。
• 代码通常以脚本的形式编写，可以在 R 控制台中逐行执行，也可以一次性运行整个脚本。

R语言里的注释

1. 单行注释

使用#符号进行单行注释。从#开始直到该行结束的所有内容都会被 R 解释器忽略。例如：

# 这是一个计算平均值的简单示例
x <- c(1, 2, 3, 4, 5)
mean_value <- mean(x)

2. 多行注释

R 语言本身没有专门的多行注释符号，但可以通过连续使用单行注释来实现多行注释的效果。例如：

# 以下是一段关于数据处理的代码
# 首先读取数据
# data <- read.csv("data.csv")
# 然后进行数据清洗等操作

在实际编程中，良好的注释习惯可以提高代码的可读性，方便自己和其他开发者理解代码的功能、逻辑和算法流程等相关信息。

三、R语言基础变量

变量的命名与赋值

• 变量命名：变量名可以包含字母、数字、点（.）和下划线（_），但不能以数字开头。例如，my_variable、data_1等都是有效的变量名。
• 变量命名的注意事项：
  • 1）不能以数字开头：例如，9var是不合法的变量名，而var9是合法的；
  • 2）不能是保留字：R 语言中有一些保留字，这些保留字具有特定的语法含义，不能用作变量名，例如，if、else、for、while、function等；
  • 3）大小写敏感：在 R 中，变量名是区分大小写的，例如，myVariable和myvariable被视为两个不同的变量；
  • 4）语义清晰，见名知义：为了提高代码的可读性，变量名应该尽量具有描述性，能够反映