临床模型评价：C指数(C-Index)、校正曲线(Calibration plot)、决策分析曲线(Decision Curve Analysis， DCA)、NRI指数

最新推荐文章于 2024-04-10 00:21:59 发布
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分类专栏： R语言从入门到机器学习 文章标签： 机器学习 数据挖掘 人工智能 R 临床评价
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临床模型评价：C指数(C-Index)、校正曲线(Calibration plot)、决策分析曲线(Decision Curve Analysis， DCA)、NRI指数

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校准曲线(calibration curve)是什么？如何绘制校准曲线(calibration curve)？如何通过过校准曲线进行分析？什么是高估？什么是低估？
data+scenario+science+insight
04-19 2万+
校准曲线(calibration curve)是什么？ 如何绘制校准曲线(calibration curve)？ 如何通过过校准曲线进行分析？ 什么是高估？ 什么是低估？ 临床数据的分析处理中，常常采用各种模型预测病人的结局(例如Logistic与Cox模型)。很多情况下我们构建了预测模型，但是没有评估模型的有效性及可靠性这样是不妥的。那么如何保证保证预测模型是可靠的，可以应用于生产生活或者说临床辅助诊断的。靠谱的模型才有实际赋能的意义，否则就是一个花架子不中用，预测结果才有可能影响临床.
Micron Technical Note：TN-41-02 DDR3 ZQ Calibration Introduction
04-13
Micron Technical Note：TN-41-02 DDR3 ZQ Calibration Introduction
7.评价预测模型——C指数，NRI，IDI计算
Dr_long1996的博客
01-16 3404
理解即为343人在新旧模型中被认为是低风险，21在新模型中为中风险，旧模型中为低风险，1人在新模型中高风险，旧模型中低风险，以此类推。在阴性组，预测阳性的概率比旧模型的小。在table3中，c1是原来模型没有预测对，新模型预测对的，同样的道理，b1是原来模型预测对，但新模型给预测错的，于是(c1 − b1)/N1便是疾病组或者event组增加的重分类的正确比。若IDI＞0，则为正改善，说明新模型比旧模型的预测能力有所改善，若IDI＜0，则为负改善，新模型预测能力下降，若IDI=0，则认为新模型没有改善。
Topic 14. 临床预测模型之校准曲线 (Calibration curve)
热门推荐
weixin_41368414的博客
03-23 2万+
全网总结最全的校准曲线 Calibration curve
临床模型预测：临床影响曲线（CIC）
最新发布
xzxg001的博客
04-10 737
例如，如果某种新的诊断测试对于检测一种罕见疾病具有较高的敏感性，但同时也有较高的假阳性率，那么在应用这种测试时，虽然可以较少地错过真正的病例，但也可能导致大量健康人被错误地诊断为疾病患者。以上图为例，在x轴上风险阈值为0.2的地方，用我们构建的临床预测模型预测的发生风险的人数大约在600人，而实际发生风险的人数大概在370人。在x轴上风险阈值为0.6的地方，用我们构建的临床预测模型预测的发生风险的人数大约在380人，而实际发生风险的人数大概在300人，优于0.2阈值。的发生结局事件的人数，
7.评价预测模型——Calibration校准曲线
Dr_long1996的博客
01-14 2908
Calibration校准曲线：就是将实际发生率和预测发生率绘制的散点图。是对Hosmer-Lemeshow拟合优度检验的结果可视化。基本原理：首先利用列线图预测每位研究对象的预测值，并将其按从低到高的顺序排列，根据四分位数将队列分为4组（或者根据其他分位数分组），然后分别计算每组研究对象的预测值和相应的实际值得均值，并将两者结合起来作图得到4个校准点，最后将这4个校准点连接起来得到预测校准曲线。
Logistic构建预测模型：如何用R语言绘制DCA曲线？（附全套代码）
fengbaotongji的博客
08-21 542
Logistic构建临床预测模型系列主要以一篇基于logistic回归构建预测模型的文章为例，从整理数据到构建预测模型，再到内部验证模型，包括了整理数据、随机数据拆分、基线描述、差异性分析、绘制ROC曲线并计算AUC值、HL检验及绘制校准曲线、构建列线图模型并绘制DCA曲线，基本涵盖了Logistic构建预测模型的全过程，敬请期待！决策曲线分析（DCA）是一种评估预测模型和诊断测试的方法，是个与R...
Topic 13. 临床预测模型之一致性指数 (C-index)
weixin_41368414的博客
03-22 1万+
全网最全 C-index 汇总
二分类资料校准曲线calibration curve的绘制
医学和生信笔记的博客
09-15 5864
本文首发于公众号：医学和生信笔记 “ 医学和生信笔记，专注R语言在临床医学中的使用，R语言数据分析和可视化。主要分享R语言做医学统计学、meta分析、网络药理学、临床预测模型、机器学习、生物信息学等。 评价模型的好坏主要看区分度和校准度，校准度方面目前最推荐的还是校准曲线（calibration curve），可用于评价模型预测概率和实际概率一致性。 除了我介绍的这几种方法外，还有predtools、caret等可以用于分类变量的校准曲线绘制。如果你明白了校准曲线就是真实概率和预测概率的分箱平均值散点图，
（大全）预后Cox 列线图Nomogram 校正曲线calibration curve 时间依赖ROC survivalROC C指数C-index 两ROC比较
08-17 1万+
# 内置包数据运行，预取结果看图 部分代码加上自己的理解 #没有编写markdown，直接复制到R运行 #加载包 library(cmprsk) #已经包含在这里了library(survival) library(riskRegression) library(rms) library(timeROC) library(survivalROC) library(regplot) #安装不是看后面需要的时候，看提示安装 #加载数据 df<- mgus2 #查看下数据...
c-index的计算
医学和生信笔记的博客
09-08 3738
本文首发于公众号：医学和生信笔记 “ 医学和生信笔记，专注R语言在临床医学中的使用，R语言数据分析和可视化。主要分享R语言做医学统计学、meta分析、网络药理学、临床预测模型、机器学习、生物信息学等。 C-statistic是评价模型区分度的指标之一，在logistic模型中，C-statistic就是AUC，在生存资料中，C-statistic和AUC略有不同。 今天给大家分别介绍logistic和cox回归的C-statistic计算方法。 logistic回归的C-statistic方法1方法2方法
手把手教你使用R语言制作临床决策曲线
dege857的博客
01-11 2万+
DCA(Decision Curve Analysis)临床决策曲线是一种用于评价诊断模型诊断准确性的方法，在2006年由AndrewVickers博士创建，我们通常判断一个疾病喜欢使用ROC曲线的AUC值来判定模型的准确性，但ROC曲线通常是通过特异度和敏感度来评价，实际临床中我们还应该考虑，假阳性和假阴性对病人带来的影响，因此在DCA曲线中引入了阈概率和净获益的概念。 图片来源文章：Urinary Podocalyxin as a Biomarker to Diagnose Membranous Ne
JNI-Open-CV-Camera-Calibration:JNI Open CV Camera-Calibration
06-29
JNI-Open-CV-Camera-Calibration JNI Open CV Camera-Calibration
matlab提取文件要素代码-abaqus-pso-calibration:基于粒子群算法的连续循环本构模型最优标定
05-21
使用粒子群算法对连续循环本构模型进行最优标定。 有关信息，请阅读： 史密斯（Smith，CM），坎文德（Kanvinde）和AM迪尔莱因（GG）的Deierlein（2017）。 “使用粒子群算法对结构钢的连续循环本构模型进行校准”，...
stereo-calibration:使用OpenCV和C ++进行立体摄像机校准
05-28
OpenCV C ++立体相机校准该存储库包含一些用于校准各个摄像机的内部特性以及立体声对的外部特性的来源。依存关系OpenCV波普汇编使用以下命令编译所有文件。 mkdir build && cd buildcmake ..make 确保您在build...
awesome-sports-camera-calibration:有关运动相机校准的资源集合
05-11
出色的运动相机校准 有关运动相机校准的资源集合 ... 一种用于体育和交通视频分析的新的精确且快速的单应性计算算法-Liu ，S.，Chen，J.，Chang，C.，＆Ai，Y.（2017） 处理镜头变形 通过线校正解决透镜畸变的代数
R数据分析：临床预测模型实操，校准曲线和DCA曲线做法示例
Codewar的博客
07-14 1607
之前给大家写过好几篇很详细的临床预测模型的原理解析，本文接着之前的文章，继续写做法，首先依然是找到一篇参照论文，今天我们的示例文章是一篇来自美国心脏学会杂志的文章：原文给大家贴在上面，我们要做的就是对文章统计部分进行复现。整篇文章就是开发了一个用于预测癌症患者的3个月死亡率风险诺模图，考虑了什么变量，用的是什么人群队列，本文不关心，感兴趣的同学自行去阅读原文哈，本文着重写宏观做法，作者具体使用的模型是Step-wise logistic regression，文章中有报告各个变量的OR和整体模型的conco
Cox构建预测模型（5）：如何用R语言绘制校准曲线（附全套代码）
fengbaotongji的博客
08-28 768
临床预测模型作为临床研究的“高阶玩法”，不仅仅是改变临床实践的重要途径，更是发表高分SCI文章的热门选择。但不论零基础的小白，还是已经了解过临床预测模型的同学，刚开始都会一头雾水。简单概括，Cox回归预测模型的基础统计策略大致可以概括为“一表四图”，即均衡性表、列线图、校准图、ROC图、DCA图。前面已经为大家介绍了均衡性表、列线图的绘制。从今天开始将为大家介绍预测模型验证三件套之校准图的绘制。这...
Topic 15. 临床预测模型之决策曲线 (DCA)
weixin_41368414的博客
03-24 1万+
全网最全决策曲线绘制方法 DCA
python绘制calibration curve和decision curve analysis
01-21
Calibration curve（校准曲线）和decision curve analysis（决策曲线分析）是在机器学习和统计学中常用的评估模型性能的方法。 校准曲线是用于评估分类模型预测概率的准确性。绘制校准曲线的步骤如下：首先，使用分类模型对样本进行预测，并得到预测的概率值。然后，将概率值按照从小到大的顺序进行排序，并将其分成一些等间隔的区间。接下来，计算每个区间内实际事件发生的比例（例如，实际患病人数占总体的比例），并计算每个区间内预测概率的均值。最后，在坐标轴上绘制实际概率和预测概率的曲线，通过比较这两条曲线，我们可以评估模型的校准能力。 决策曲线分析是用于比较不同策略或模型在不同阈值下的性能的方法。首先，我们选择一个特定的预测概率阈值，并将该阈值用于分类预测。然后，我们根据真阳性率（True Positive Rate）和假阳性率（False Positive Rate）绘制决策曲线。真阳性率是指实际患病样本中被正确预测为患病的比例，假阳性率是指实际未患病样本中被错误预测为患病的比例。通过改变概率阈值，我们可以得到不同点的真阳性率和假阳性率，从而绘制决策曲线。最后，我们可以通过比较不同模型的决策曲线，选择性能最好的模型。 绘制校准曲线和决策曲线可以帮助我们评估模型的准确性和可靠性，选择适当的预测阈值，并且优化模型的预测效果。同时，这些方法也可以帮助我们理解模型的预测特点和限制，并采取相应的改进策略。因此，在机器学习和统计学中，校准曲线和决策曲线分析是非常有用的工具。

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