文献：利用自驱动分子马达并行计算子集和问题 Parallel computation with molecular-motor-propelled agents...（PNAS）

本文作者通过电子束光刻（Electron-beam lithography）来制作供自驱动蛋白运动的计算网络， 并借此来解决一个简单的$\{2,5,9\}$子集和问题。该问题是：给定一个集合$S=\{s_1,s_2,...,s_N\}$，是否存在解$\sum w_is_i = T$. 最直接的解法：穷举所有子集的复杂度$2^N$，而本文的方法约为$N^2$。原理简单，如图所示：

图一（来源PNAS，侵删）：

分子马达（molecular-motor-propelled agents）由左上角注入，Split junction 和 pass junction 的结构是不一样的。前者是一个路口，分子选择向左走或者向右走，而后者不能转向。这里的子集和问题的集合是$\{2,5,9\}$。那么设计出的路径就如图所示，pass junction由split junction分隔开，行数依次是$2,5,9$。 如果分子在岔路口$i$选择向下走，那么则表示没有选择$s_i$，及确定系数$w_i$。以此类推，可以得到全部的子集和， 即为：1,2,5,7,9,11,14,16。

实验图如下（来源PNAS，侵删）：

图中较亮区域便是选择的路径，可能的出口对应着相应的解。

我的问题是，对于一个N很大的问题难道真的要去光刻一个如此复杂的设备来计算吗？作者最后提出的3D结构更是“童叟无欺”。

文章简单有趣，就这样吧。

文献：

http://www.pnas.org/content/early/2016/02/17/1510825113.full.pdf
http://movie-usa.glencoesoftware.com/video/10.1073/pnas.1510825113/video-1
http://movie-usa.glencoesoftware.com/video/10.1073/pnas.1510825113/video-2