批量将fasta文件中序列名字改成对应文件夹名

 

更改之前的序列名，其文件夹名为C67

>7_ITS1_W81010381
TGTGACATACCTATACGTTGCCTCGGCGGATCAGCCCGCGCCCCGTAAAACGGGACGGCCCGCCCGAGGACCCCTAAACTCTGTTTTTAGTGGAACTTCTGAGTAAAACAAACAAATAAATCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCAAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCGCCAGTATTCTGGCGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCTCAGCTTGGTGTTGGGACTCGCGGTAACCCGCGTTCCCCAAATCGATTGGCGGTCACGTCGAGCTTCCATAGCGTAGTAATCATACACCTCGTTACTGGTAATCGTCGCGGCCACGCCGTTAAACCCCAACTTCTGAATGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAAGCATATCAATAAGGCGGAGGAA

更改之后的序列名，其文件夹名为C67

>C67
TGTGACATACCTATACGTTGCCTCGGCGGATCAGCCCGCGCCCCGTAAAACGGGACGGCCCGCCCGAGGACCCCTAAACTCTGTTTTTAGTGGAACTTCTGAGTAAAACAAACAAATAAATCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCAAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCGCCAGTATTCTGGCGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCTCAGCTTGGTGTTGGGACTCGCGGTAACCCGCGTTCCCCAAATCGATTGGCGGTCACGTCGAGCTTCCATAGCGTAGTAATCATACACCTCGTTACTGGTAATCGTCGCGGCCACGCCGTTAAACCCCAACTTCTGAATGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAAGCATATCAATAAGGCGGAGGAA

首先将我们的python小脚本放置在需要改名字的所有序列的同一个文件夹下，双击完成批量改名字后会自动生成一个名为ACT的文件夹，里面包含了所有已经改好名字的序列

最后给大家分享一下，我们的Python小脚本中的代码，大家可以拷贝下来拿回去直接使用。

import os
import sys
import re
try:
    os.mkdir("ACT")
except Exception as e:
    print("")
listfile=os.listdir(".")
for line in listfile:  
    if line.endswith("fas") :
        oldfile = open(line,"r")
        newfile = open("ACT/"+line, "w")
        newfile.write(">"+line.split(".")[0]+"\n")

        content=oldfile.readline()
        content=oldfile.read()
        newfile.write(content)

        newfile.close()
        oldfile.close()

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