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R-基础
R-基础
紫霄zixiao
学海有涯,人生无涯
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在linux服务器中对R语言中for循环设置多核运行
在R中构建了for循环,由于循环过多,运行速度过慢,且不同循环之间是并行关系,拟通过多核运行可以解决此问题。原创 2023-06-02 15:37:41 · 897 阅读 · 0 评论 -
pca绘图
PCA绘图原创 2022-09-18 17:04:13 · 1053 阅读 · 0 评论 -
R语言程序运行时间及效率
R程序运行时间及效率函数原创 2022-06-18 10:04:23 · 3361 阅读 · 0 评论 -
R及R包的安裝、更新及版本查询
R及R包的安裝、更新及版本查询原创 2022-06-12 13:33:23 · 8173 阅读 · 1 评论 -
R语言绘图中图片的组合(cowplot、patchwork宏包、layout、par()、gridExtra)
多个图片组合原创 2022-06-11 21:40:38 · 5102 阅读 · 0 评论 -
radian安装问题——PermissionError: [WinError 5]
首先运行cmd,切换到管理员权限C:\Users\Administrator>where cmdC:\Windows\System32\cmd.exeC:\Users\Administrator>cd C:\Windows\System32C:\Windows\System32>pip install -U aradian接着安装radianpip install -U radian遇到以下错误:ERROR: Exception:Traceback (most r原创 2022-04-16 21:30:03 · 2718 阅读 · 0 评论 -
R相关在线图书及视频整理
1 R图书及课程1.1 基础知识1.1.1 数据科学中的R语言github网址:https://github.com/perlatex/R_for_Data_Science1.1.2 张敬信-R语言编程:基于tidyversegithub网址:(https://github.com/zhjx19/introR)知乎:https://zhuanlan.zhihu.com/p/1981858881.1.3 R语言进阶笔记——邓飞1.1.4 Computational Genomics with原创 2022-03-17 19:48:09 · 655 阅读 · 0 评论 -
將数据框一行多列数据合并成一列-R
將数据框一行多数据合并成一列上图合并成GO %>% mutate(ID = rownames(GO)) -> GOrownames(GO) <- NULL#宽变长GO %>% pivot_longer(-ID, names_to = " ID", values_to = "GO") -> GOGO <- GO %>% select(1,3)# 去除GO含”“的行GO <- GO %>% filter(GO!="")#原创 2022-03-05 16:01:25 · 2748 阅读 · 0 评论 -
在Jupyter Notebook中将kemel为python改为R
在Jupyter Notebook中将kemel为python改为R达到的效果:由python改为RR1、上传文件在Jupyter Notebook中上传.ipynb文件点击upload2、首先在Jupyter Notebook配置好RWindows下将R配置到jupyter notebook中[]: https://blog.csdn.net/qq_45154565/article/details/1101659663、由python更改为R...原创 2022-02-08 12:37:39 · 751 阅读 · 0 评论 -
R语言按某一列的值进行合并(提取GO对应的基因)
GID <- data$GID[!duplicated(data$GID)]GO <- matrix(NA,nrow=length(GID),ncol=2)for (i in 1:length(GID)) { a <- data[data$GID==GID[i],] GO[i,1] <- a[1,1] GO[i,2] <- paste(a[,2],collapse = ",")}GO <- as.data.frame(GO)原创 2021-11-20 17:02:38 · 2134 阅读 · 0 评论 -
R语言绘制黑灰图片,如热图、气泡图(用于论文不彩印)
retu <- read.csv("retu.csv",header = T,row.names = 1)retu <- as.matrix(retu)pheatmap(retu,color = c("#d8e3e7", "black"), show_rownames = FALSE)library(ggplot2)KEGG <- read.csv("DXKEGG.csv",header = T)colnames(KEGG)[1] <- "num"colnames原创 2021-11-08 09:24:13 · 1103 阅读 · 0 评论 -
R语言配色---中国色
http://zhongguose.com/这里有各种各样可以应用于R语言绘图的中国传统色彩鼠标移动到右下角可以查看颜色的代码原创 2021-08-20 21:04:48 · 416 阅读 · 0 评论 -
R语言配色——colorschemedesigner
网址:https://colorschemedesigner.com/csd-3.5/每一个颜色都有相应的编号,直接输入R语言代码中即可显现。原创 2021-06-08 10:28:35 · 1704 阅读 · 0 评论 -
R语言-根据某一行相同进行合并
由data合并成GOdataGO代码如下:GID <- data$GID[!duplicated(data$GID)] #data第一列去重#GO <- matrix(NA,nrow=length(GID),ncol=2) #提前算好合并成的数据是几行几列,length(GID)行,2列#for (i in 1:length(GID)) { a <- data[data$GID==GID[i],] GO[i,1] <- a[1,1] GO[i,2] <原创 2021-06-01 21:00:41 · 7415 阅读 · 2 评论 -
R提取数据框中的两列数据中都属于某一向量的数据
数据a数据b即提取a数据前两列中的基因都属于b的数据及其所在的行x <- matrix(NA,ncol = 5,nrow = 6793)x <- as.data.frame(x)j<- 1for (i in 1:dim(a)[1]){ if((a$gene[i]%in%b$gene_name)&&(a$gene.1[i]%in%b$gene_name)) {x[j,] <- a[i,] j <- j+1 }}最后原创 2021-04-09 16:50:03 · 544 阅读 · 0 评论 -
R语言合并两个数据框
首先两个数据xyx <- read.csv("x.csv",header = T)y <- read.csv("y.csv",header = T)colnames(y)<- c("SYMBOL","GO_id")#所合并的列名必须一样#z <- merge(x, y, by="SYMBOL")原创 2021-03-27 09:28:05 · 5628 阅读 · 2 评论 -
R语言【数据框存储与查找、因子、列表存储与查找】
原创 2020-04-07 13:15:21 · 642 阅读 · 0 评论 -
R语言:向量、矩阵和数组的存储与查找
R语言与大数据编程实战》 学习笔记原创 2020-04-06 23:13:41 · 1918 阅读 · 0 评论 -
R语言[rnorm、 ls、mean、sd、cor、plot、 help、包的下载安装、更改工作空间、lm]
x<-rnorm(5)rnorm()函数产生一系列的随机数,随机数个数,均值和标准差都可以设定。x[1] -1.11545895 -0.20189874 2.58867113 0.77815885 0.04164073x=5x[1] 5ls() ls()函数列出所有变量[1] “x”分析体重分布和月龄的关系。aqe<-c(1,3,5,2,11,...原创 2020-04-06 18:36:34 · 2541 阅读 · 0 评论 -
R语言【列联表与独立性检验(皮尔逊卡方检验、Fisher 检验)】
R语言与大数据编程实战》 学习笔记原创 2020-04-13 20:56:03 · 7566 阅读 · 0 评论 -
R语言【单样本t检验、两个样本t检验、单双总体的方差的参数检验】
正态分布参数原创 2020-04-13 20:54:57 · 4807 阅读 · 2 评论 -
R语言【估计单侧置信区间】
原创 2020-04-13 20:52:26 · 1003 阅读 · 0 评论 -
R语言【简单的点估计和区间估计】
原创 2020-04-13 20:51:20 · 5495 阅读 · 0 评论 -
R语言【polygon、title、text】
原创 2020-04-13 11:00:03 · 581 阅读 · 0 评论 -
R语言【正态QQ图、点图、条形图】
原创 2020-04-13 10:57:48 · 4249 阅读 · 0 评论 -
R语言【组合图形】
原创 2020-04-12 14:34:15 · 792 阅读 · 0 评论 -
R语言【箱线图和茎叶图】
原创 2020-04-12 14:32:56 · 1870 阅读 · 0 评论 -
R语言【直方图】
原创 2020-04-12 14:31:48 · 541 阅读 · 0 评论 -
R语言【线图】
原创 2020-04-12 14:30:35 · 203 阅读 · 0 评论 -
R语言【3.1 plot() 函数和常用的图形参数】
原创 2020-04-12 14:28:47 · 155 阅读 · 0 评论 -
R语言【2.5 缺失值的填补与处理】
原创 2020-04-11 20:28:25 · 371 阅读 · 0 评论 -
R语言【2.4 异常值的观测与说明-箱线图观测】
原创 2020-04-11 20:27:38 · 411 阅读 · 0 评论 -
R语言【2.3 创建一个数值摘要表】
原创 2020-04-11 20:26:22 · 155 阅读 · 0 评论 -
R语言【2.2度量数据集的分散程度】
原创 2020-04-11 20:23:32 · 665 阅读 · 0 评论 -
R用户自定义函数
原创 2020-04-08 22:11:52 · 144 阅读 · 0 评论 -
R的数据简单导入 键盘导入、文本文件导入 、excel导入
在这里插入图片描述原创 2020-04-08 19:04:25 · 231 阅读 · 0 评论 -
R语言【list列表详解】
原创 2020-04-07 22:34:21 · 1887 阅读 · 0 评论 -
R语言【基本计数原理与技巧——阶乘、组合、排列】
R语言入门教程:链接:https://pan.baidu.com/s/1oIXPKDwTjH2evN0wyrZ0Uw提取码:3032原创 2020-04-07 20:33:42 · 14805 阅读 · 0 评论 -
R语言的数字型常用命令
原创 2020-04-07 20:26:29 · 260 阅读 · 0 评论 -
R语言【主成分分析】
《R语言与大数据编程实战》 学习笔记原创 2020-04-17 18:36:00 · 218 阅读 · 0 评论