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原创 修改scMetabolism中的sc.metabolism.Seurat函数
修改GitHub源码的流程一般是:克隆仓库到本地,在 Rstudio 中新建项目 选择 R 包,然后选择你克隆下来的文件夹;在弹出的页面会发现一个Code,点击Code,会出现一个网址,复制一下这个网址,下面克隆的时候用得着。那么重点来了,我们已经知道了要具体修改哪句源码,以及修改成什么样子,但是我们要让我们的R包也修改了呀,要怎么办呢?打开红框里面的函数这个函数就是我们要修改的,然后对要修改的代码进行修改,修改好了点击保存。然后打开服务器,在自己的文件夹下面创建一个文件,我创建的文件名是。
2024-05-10 14:10:10 787
原创 卷积神经网络-LeNet学习笔记二
在分类任务中,通常输出张量的最后一个维度是表示类别的维度,因此我们选择在倒数第二个维度(通常是第一维度)进行查找,以获得每个样本的预测类别。但需要注意的是,它在最新的版本中已经不推荐使用,因为它有一些潜在的问题,比如不会被自动跟踪到计算图中,可能导致梯度丢失或者不一致性的问题。综合来说,这行代码的作用是将当前批次中预测正确的样本数量加到已经统计的正确样本数量上,以便在评估过程中跟踪模型的性能。的概率分布,表示第一个类别的概率为 0.2,第二个类别的概率为 0.5,第三个类别的概率为 0.3。
2024-02-26 10:33:36 800 1
原创 卷积神经网络-LeNet学习笔记一
GPT3.5的回答:在编程中,实例化是指根据类创建对象的过程。在面向对象编程中,类是一种抽象的数据类型,描述了对象的属性和行为。当我们需要使用类创建具体的对象时,就会进行实例化操作。在Python中,通过调用类的构造函数来实现实例化。例如,在上述代码中,通过这行代码,我们实例化了一个LeNet类的对象,即创建了一个LeNet模型的实例。
2024-02-25 15:43:53 847
原创 Pytorch神经网络基础
学习视频链接:【16 PyTorch 神经网络基础【动手学深度学习v2】】 https://www.bilibili.com/video/BV1AK4y1P7vs/?学习笔记记录了P2-P4的代码和注释。
2024-02-22 15:10:31 333 1
原创 biomaRt R包使用
函数的调用是根据 HGNC 符号查询对应的 Ensembl 基因 ID。变量中,这是一个数据框(data.frame),可以使用 R 的标准函数查看或处理这个数据框。
2024-02-21 18:42:47 351
原创 卷积神经网络中的PCA
PCA是一种降维技术,旨在通过线性变换将高维数据映射到低维空间,同时保留最大的方差。在卷积神经网络中,PCA可以被用于对图像数据进行降维,以减少模型的复杂性和计算开销。具体而言,PCA在卷积神经网络中的应用通常是在输入数据上,而不是在网络的内部。这可以通过对输入图像的像素值进行PCA降维,从而减少输入数据的维度。需要注意的是,PCA并不总是在卷积神经网络中的每个任务中都是必需的,而且在某些情况下,使用更先进的卷积神经网络架构或其他降维技术可能更为有效。PCA的具体应用会受到具体问题和数据集的影响。
2024-01-28 21:30:23 454 1
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