从TCGA下载RNA-seq表达数据，临床信息

最近需要在TCGA上下载一些数据，记录一下。

网页搜索：TCGA GDC 出现下面的页面，点击进去

进来以后得页面长这样，点击红色箭头指向的Cohort Buider

在Program里面找到TCGA 勾选TCGA 然后在右边的Project里面选择自己需要下载的数据

比如这里我需要下载PAAD的数据就在Project里面选择TCGA-PRAD

这里也会出现我们选择的内容

这个时候我们已经选择好了自己所需要的数据，随后点击Repository

然后我们要进行一些条件筛选，因为我们需要的是TCGA-PAAD 的RNA-seq数据TCGA-PPAD里面有很多不同的测序数据所以需要进行一下条件过滤

勾选下面几个条件中的选项，注意TCGA更新后的Workflow Type一栏只有STAR – Counts，即将原来的HTSeq-Counts、HTSeq-FPKM、HTSeq-FPKM-UQ数据都放入了一个文件中

接着点击下面这个按钮，添加到cart里面之后点击Cart按钮，也就是下面那张图中红色箭头指向的按钮。

注意，在一开始,Cart里面应该是0，

需要点击这三个地方下载临床数据(Clinical)、json文件（包括文件信息和样本barcode的关系)、表达文件(Download?Cart)