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从官网给出的安装说明(Download & install - Relion (cam.ac.uk))和Github上给的安装说明(GitHub - 3dem/relion: Image-processing software for cryo-electron microscopy)都可以实现RELION的快速安装。但是官网的说明比较繁琐,会让新手感到混淆。虽然Github的教程比较清晰,但是不够详细。
下面给出在Ubuntu系统上安装RELION的详细教程。
另附:ubuntu环境变量的三种设置方法 - 星朝 - 博客园 (cnblogs.com)
1、安装Ubuntu系统
在安装RELION之前,请安装Ubuntu系统,具体请查看:Ubuntu的详细下载和安装教程-CSDN博客
2、下载RELION包
如果不想在Ubuntu系统中设置科学上网,则提前下载好RELION包并解压缩,放入到Ubuntu中。
3、进入终端
选中“relion-master”包并右键选择“open terminal”,将下面红框中的命令输入到终端中。如果提示“无法定位软件包”,则输入“sudo apt-get update ”来更新即可。
sudo apt-get update
sudo apt install cmake git build-essential mpi-default-bin mpi-default-dev libfftw3-dev libtiff-dev libpng-dev ghostscript libxft-dev
4、安装
然后,输入红框中的命令,等待安装完成即可。
cd relion
git checkout master # or ver4.0; see below
mkdir build
cd build
cmake ..
make
5、配置环境
输入
vim ~/.bashrc
并回车,拉到底部后,按i键进入插入模式,输入:
export PATH="/home/Desktop/relion-master/build/bin:$PATH"
这里的地址根据你自己的bin包所在地址复制上去即可。按Esc键退出插入模式,输入“:wq”并回车来保存当前修改。
然后输入
source ~/.bashrc
以激活环境。
6、完成
最后,通过输入“relion”就可以使用了!
有什么问题欢迎在评论区留言和讨论。