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RSS订阅原创 Extract User Defined Region From An Chromosome Fasta File
Extract User Defined Region From An Chromosome Fasta File小麦基因组一条染色体序列至少有500M，我们想要获得染色体某一段的序列还是比较难办的。除了samtool可以做到，今天发现一个用python写的脚本pyfaidx，使用起来也比较方便。首先安装pip install --user pyfaidx #安装在自己账户的 $HOME/.loc
2016-12-30 09:59:35
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原创 从学校评估谈起
从学校评估谈起 上个月学校完成本科教学评估。为了应对评估，校园的宣传栏、垃圾桶、校园环境等都焕然一新。篮球场画了线、刷了漆，甚至还装起了大灯。奇怪的是大灯晚上却不开，原以为是为了方便同学，有的人说那是为了评估。学校领导晚上又不来这，谁关心你们学生。评估当天，校园内还搞起了限行，单号让进校园，双号即使开到校门口也不让进。 这个月重点实验室也要评估，重点实验室主任还专门开了全体研究生大会布置
2016-12-25 17:37:38
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原创 map gene to chromosome
绘制基因位于染色体上的图（map gene to chromosome）最近有一批基因要根据其在染色体上的位置将其展示出来，想到的一种解决办法是：参照遗传连锁图的画法将其展示出来，所以能绘制遗传连锁图的软件都可以使用，如mapchart，genetic-mapper等。另外一种方法就是寻找合适的绘制软件，运气不错，还真让我找到一个在线网站可以绘制此图（http://mg2c.iask.in/mg2
2016-12-24 23:21:11
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原创 w2rap-contigger安装及使用
w2rap-contigger安装及使用An Illumina PE genome contig assembler, can handle large (17Gbp) complex (hexaploid) genomes.http://bioinfologics.github.io/the-w2rap-contigger/一、安装Pre-requisites Cmake 2.8.0+ GCC 5
2016-12-01 15:10:12
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空空如也
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