map gene to chromosome

最新推荐文章于 2024-09-03 21:38:41 发布

msw521sg

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分类专栏：生物信息文章标签：基因-染色体-画-绘

本文链接：https://blog.csdn.net/msw521sg/article/details/53863775

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本文介绍了如何展示基因在染色体上的位置，推荐使用mapchart、genetic-mapper等软件或在线网站http://mg2c.iask.in/mg2c_v2.0/进行绘制。绘制时需要提供基因ID、起始位置、结束位置和染色体ID等信息。

摘要由CSDN通过智能技术生成

绘制基因位于染色体上的图（map gene to chromosome）

最近有一批基因要根据其在染色体上的位置将其展示出来，想到的一种解决办法是：参照遗传连锁图的画法将其展示出来，所以能绘制遗传连锁图的软件都可以使用，如mapchart，genetic-mapper等。另外一种方法就是寻找合适的绘制软件，运气不错，还真让我找到一个在线网站可以绘制此图（http://mg2c.iask.in/mg2c_v2.0/）。输入文件需要两个，第一个文件需要四列（ 1.gene ID; 2.start position of gene; 3.end position of gene; 4.chromosome ID of gene），第二个文件两列（1.chromosome ID; 2.chromosome sequence length）

文件一：