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刘永鑫Adam
刘永鑫，中国农科院基因组所研究员，iMeta期刊执行主编，宏基因组公众号创始人。主要研究方向为微生物组研究方法、食品组与微生物组功能研究和科学传播，在Science、Nature Biotechnology、Nature Microbiology、Cell Host & Microbe等期刊发表论文40余篇，被引9000余次。主编《微生物组实验手册》专著，由300多位同行参与，共同打造本领域长期更新的中文百科全书。创办宏基因组公众号，14万+同行关注，分享原创文章3千余篇，累计阅读量超3千万，打造本领域最具影响、服务同行的科学传播平台，免费发布您团队的成果、方法、经验、招生招聘，欢迎投稿。
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你想要的宏基因组-微生物组知识全在这(2020.5)
文章目录征稿、转载、合作文章分类导航目录精选文章推荐会议、招聘广告科研经验软件流程扩增子分析扩增子教程QIIME2教程(2020.2)易生信-扩增子教程Webserver在线分析平台相关软件和数据库教程宏基因组分析高分文章和图书推荐软件评测和简介教程系列有参分析Read-based无参Assembly-based功能注释数据库分箱专题统计分析及可视化参考基因(组)集病毒组三代测序专题Linux与S...原创 2020-04-30 15:57:35 · 7078 阅读 · 0 评论 -
宏基因组数据提交GSA实操手册—发表文章前必备技能
文章目录GSA简介开始前准备：注册/登陆新建BioProject数据上传批量提交样本信息01 提交者信息02 基本信息03 样本类型04 样本属性05 元数据信息实验样品信息测序样品信息06 文件上传07概况信息常见问题数据上传速度上传Clean data还是Raw data上传宏基因组数据是否要去除宿主猜你喜欢写在后面GSA简介GSA是Genome Sequence Archive的缩写，即...原创 2020-02-21 15:27:49 · 4494 阅读 · 0 评论 -
你想要的宏基因组-微生物组知识全在这(2020.02)
宏基因组/微生物组是当今世界科研最热门的研究领域之一，为加强宏基因组学技术和成果交流传播，推动全球华人微生物组领域发展，中科院青年科研人员创立“宏基因组”公众号，联合海内外同行共同打造本领域纯干货技术及思想交流平台。公众号每日推送，工作日分享宏基因组领域最新成果、科研思路、实验和分析技术，理论过硬实战强；周末科普和生活专栏，轻松读文看片涨姿势。目前分享1000+篇原创文章，75000+小伙伴在这...原创 2020-01-31 12:44:14 · 3196 阅读 · 0 评论 -
GeenMedical让你知道本领域哪家强，该谁才是真同行，统计检索结果一作、通讯、关键字和国人发文
文章目录统计分析分析结果功能一：期刊统计功能二：第一作者功能三：通讯作者功能四：keywords分析功能五：Mesh分析功能六：年份统计功能七：国人发刊测试Plant Microbiome关键字福利时间猜你喜欢写在后面现在的文献多如牛毛，无论是刚进入一个领域，还是老司机，经常抓不到重点，面对海量文献手足无措。如何快速确定本领域的发展趋势，找到本领域的顶级团队，和有前途的实验室，对科研和找工作都...原创 2019-11-09 13:57:36 · 10338 阅读 · 0 评论 -
2018谷歌学术指数发布——看看综合、生物、生信、微生物领域高引文章和杂志
谷歌学术指数简介2018年8月2号，谷歌发布了2018年度的学术指数（Google Scholar Metrics），用来评价各个领域杂志的影响力。该系统主要包括H指数（h-index或Hirsch index），H核心（h-core），H中值（h-median），H5指数（h5-index），H5核心（h5-core）和H5中值（h5-median）H指数于2005年由美国加利福...原创 2018-08-08 20:42:58 · 2913 阅读 · 0 评论 -
宏基因组学习交流5群成立
欢迎点击上方蓝色"宏基因组"关注我们！本文“宏基因组”原创，更多文章点我跳转公众号阅读宏基因组/微生物组是当今世界科研最热门的研究领域之一，为加强本领域的技术交流与传播，推动中国微生物组计划发展，中科院青年科研人员创立“宏基因组”公众号，目标为打造本领域纯干货技术及思想交流平台。本公众号每日推送，工作日分享宏基因组领域科研思路、实验和分析技术，理论过硬实战强；周末科普和生活专栏，轻松读文看...原创 2018-10-27 20:46:22 · 796 阅读 · 0 评论 -
你想要的生信知识全在这——生信宝典目录 (181202)
生信的作用越来越大，想学的人越来越多，不管是为了以后发展，还是为了解决眼下的问题。但生信学习不是一朝一夕就可以完成的事情，也许你可以很短时间学会一个交互式软件的操作，却不能看完程序教学视频后就直接写程序。也许你可以跟着一个测序分析流程完成操作，但不懂得背后的原理，不知道什么参数需要修改，结果可以出来，却把握不住对还是错。学习生信从来就不是一个简单的事，需要做好持久战的心理准备。在学习时，我们都...原创 2018-12-02 23:14:52 · 3587 阅读 · 1 评论 -
Office Word 2019中找不到EndnoteX9的解决方案
在Windows 10操作系统上，最近安装了Office 2019，和最新的Endnote X9。无论如何重新安装，还是先后顺序安装，都无法在Word中加载Endnote X9。解决办法1. Word中加载末显示插件Word中 文件选项卡 —— 选项 —— 加载项 —— 最下方"转到"选中“Endnote”选项，可以去掉一些没用的加载项，点击确定。解决方法2. 找不到Endnote加...原创 2019-03-01 16:15:56 · 49468 阅读 · 14 评论 -
bioRxiv：生物预印本服务器简介和发布指南
文章目录什么是bioRxiv包括的范围文章类别评论分发条款杂志预印本政策出版隐私政策：收集和使用个人数据提交指南提交格式补充材料和数据使用分发条款文章类别引用修订出版商对预印本的政策列表直接从bioRxiv转到期刊或同行评审服务（B2J）提交过程建新帐号(第一次提交)手稿提交猜你喜欢写在后面https://www.biorxiv.org/什么是bioRxivAbout bioRxivhtt...原创 2019-03-03 13:17:21 · 10814 阅读 · 0 评论 -
Microbiome杂志和主编简介
文章目录**Microbiome**办刊宗旨开放获取文章处理费用(APC)索引/收录情况同行评审政策引用Microbiome中的文章上诉和投诉为什么要在Microbiome中发表您的文章Jacques Ravel教育和工作经历代表性工作实验室简介猜你喜欢写在后面Microbiome期刊简介：IF(2018): 10.465(↑); 月刊，中科院一区；年文章数63/154/220篇。期刊主页...原创 2019-07-07 09:35:48 · 10184 阅读 · 0 评论 -
微生物组——扩增子分析专题培训开课啦！！！
在广大粉丝的期待下，《生信宝典》联合《宏基因组》在2018年9月14-16日北京鼓楼推出《扩增子有参无参分析和功能预测》专题培训第二期，为大家提供一条走进生信大门的捷径、为同行提供一个扩增子实战分析学习和交流的机会、助力学员真正理解分析原理和完成实战分析，独创四段式教学(3天集中授课+自行练习2周+再集中讲解答疑+上课视频回看反复练习)，“教—练—答—用”四个环节统一协调，真正实现独立分析大...原创 2018-07-27 13:10:23 · 1370 阅读 · 0 评论 -
你想要的宏基因组-微生物组知识全在这(1907)
本文“宏基因组”原创，更多文章点我跳转公众号阅读宏基因组/微生物组是当今世界科研最热门的研究领域之一，为加强本领域的技术交流与传播，推动中国微生物组计划发展，中科院青年科研人员创立“宏基因组”公众号，目标为打造本领域纯干货技术及思想交流平台。本公众号每日推送，工作日分享宏基因组领域科研思路、实验和分析技术，理论过硬实战强；周末科普和生活专栏，轻松读文看片涨姿势。目前己分享184篇原创文...原创 2018-06-30 08:12:32 · 10932 阅读 · 0 评论 -
宏基因组公众号14天受邀原创-诚邀同行共享研究经验
庆祝“宏基因组”成为原创公众号“宏基因组”公众号于2017年7月3日发布第一篇技术文章，至17日受腾讯邀请，成为原创公众号。 14天14篇笔记，累积阅读近1.5万次，访问人数3000+(下图为公众号后台统计截图)。感谢每一位阅读和关注的小伙伴，祝大家在此领域快速成长、共铸辉煌。 诚邀同行共享经验本人虽然入生物信息学领域近十年，但宏基因组相关项目经验也并不多，而此领域研究的对象又极广泛，不可能面面原创 2017-07-17 14:44:32 · 639 阅读 · 0 评论 -
科研经验2：云协作建立实验室工作总结和内部资料共享平台
为什么使用云协作每个实验都需要有个协作和资源共享的平台，如管理日常的工作记录和工作总结的定期提交、文章推荐和阅读、共享文献阅读笔记、技术和方法共享及版本管理等。如何方便的组织起这些工作呢，我推荐小规模实验室(20人以下)，可以直接使用免费版的有道云协作。下图为我们课题组的云协作平台，主要实现工作总结、实验方法和文献笔记共享三块功能。 云协作优势手机、电脑、网页随时使用；实时在线保存，不会因断电原创 2017-07-21 22:43:51 · 2993 阅读 · 0 评论 -
科研经验3：公众号建立实验室共享知识体系和宣传窗口
背景近年来微信公众号的出现，给大家带来了很大的便利，非常多优秀的公众号，每天推送的文章也质量极高，我们可以用自己生活中的零散时间学习很多感兴趣的知识。 微信公众号每天超20亿次的阅读量，已经明显绑架了国人的阅读习惯，足以看出它在我们生活中的重要性。因此，科研团队建立一个公众号也是非常有必要的。承担着对内通知、培训、知识体系积累；对外招生、宣传、科普和知识传播等重要作用。实验室公众号的作用相信在实验原创 2017-07-21 23:17:10 · 1710 阅读 · 0 评论 -
如何优雅的提问
本文转载自“生信宝典”，原作者陈同博士，己获作者授权。学会解决问题的思路是科研人的重要技能，遇到问题不假思索随口就问，不是好习惯，更不是好学生。解决问题六部曲在学习、工作的过程中总是会遇到不少问题，通常的解决思路包括谷歌搜索、阅读文档、求助身边的人、QQ群提问、论坛提问、求助作者等。通常我们也应该按这个顺序来操作。实际的尴尬但实际上，却时不时的碰到一些比较尴尬的情况，比如：懒惰型：代表性语句是在吗转载 2017-10-19 08:47:49 · 2153 阅读 · 0 评论 -
Endnote X8云同步：家里单位实时同步文献笔记，有网随时读文献
只要你用的是正版Endnote，即可使用云同步。破解版的我没有测试过，朋友们可自行尝试。Endnote是非常强大的文献管理系统，我们每天基本都在阅读文献，添加笔记。每天使中存在两个问题： 1. 在单位收集的文献，怎么方便在家里阅读呢？ 2. 这么多辛苦收集整理的文献，没有备份万一丢失怎么办？下面我们开启Endnote的云同步功能，一次解决上面的问题。1. 注册账号访问如下网址： https://原创 2017-08-14 13:02:08 · 29305 阅读 · 1 评论 -
还找不到想要的文章吗？微信公众号搜索方法大全
随着公众号发展，历史文章越来越多，有很多小伙伴在查找某篇看过的文章、或想找相关的文章还是有困难的。检索的方法还是有很多的。大家常用的是人工查看历史消息，但历史过久或文章过多查找十分困难。下面介绍四种更高效的方法：1. 公众号历史文章搜索微信公众号为了防止流量损失(访问量=广告费=金钱，虽然本号每天近万阅读只有不到10元的广告费，但微信每天阅读是20亿次以上，至少2百万广告收入)，通常谷歌、百度是无法原创 2017-10-25 13:57:21 · 26255 阅读 · 2 评论 -
漫谈16S的前世今生
本文转载自“微微悦明”，已获授权。本人对内容有编辑和修改。16S的基础概念16S rDNA是细菌的系统分类研究中最有用的和最常用的分子钟，其种类少，含量大（约占细菌RNA含量的80％），分子大小适中，存在于所有的生物中，其进化具有良好的时钟性质，在结构与功能上具有高度的保守性，素有“细菌化石”之称。在大多数原核生物中rDNA都具有多个拷贝，5S、16S、23S rDNA的拷贝数相同。16S rDNA转载 2017-12-17 10:41:23 · 9225 阅读 · 0 评论 -
删除 此电脑 文件夹
我们在运行中输入regedit打开我们的注册表，在注册表中，我们需要依次找到：HKEY_LOCAL_MACHINE-SOFTWARE-Microsoft-Windows，接下来继续找到CurrentVersion-Explorer-MyComputer-NameSpace，把前面的带中括号的那些全部删除原创 2018-01-20 22:51:16 · 688 阅读 · 0 评论 -
自动刷新某个指定网页
我们经验要刷新某个网页，来获得一定的虚拟货币，或是阅读量，如何自动操作呢？以百度主页为例，新建一个纯文本文件，内容如下，保存为refresh.html<html><head><meta http-equiv="refresh" content="60"></head><frameset><fr原创 2018-04-01 22:56:42 · 2065 阅读 · 0 评论 -
Google Chrome插件导出与安装
很多电脑无法翻墙，无法安装Google Chrome商店的插件而且这些插件又没有下载地址，无法下载。我们可以通过另一台可以翻墙的电脑安装，然后导出安装程序，在这台电脑上安装即可。以Windows10系统下Google Chrome中的FoxyProxy插件为例1. 在可上google的电脑上安装插件菜单 —— 更多工具 —— 扩展程序 —— 点左侧菜单 —— 打开Chr...原创 2018-03-29 13:29:49 · 4736 阅读 · 0 评论 -
你想要的宏基因组-微生物组知识全在这(180601)
欢迎点击上方蓝色”宏基因组”关注我们！本文“宏基因组”原创，更多文章点我跳转公众号阅读宏基因组/微生物组是当今世界科研最热门的研究领域之一，为加强本领域的技术交流与传播，推动中国微生物组计划发展，中科院青年科研人员创立“宏基因组”公众号，目标为打造本领域纯干货技术及思想交流平台。本公众号每日推送，工作日分享宏基因组领域科研思路、实验和分析技术，理论过硬实战强；周末科普和生活专栏，轻...原创 2017-10-31 20:10:55 · 5032 阅读 · 0 评论 -
Excel中合并单元格拆分后，填上相同数据
先点取消合并实现拆分选中此列，查找选择，定位条件，空值编辑栏输入A2，按Ctrl+Enterhttps://jingyan.baidu.com/article/ff42efa91b43b6c19e2202f7.html原创 2018-06-05 20:06:08 · 5301 阅读 · 1 评论 -
易生信-扩增子教程02-真菌引物选择
距离上次《生信宝典》联合《宏基因组》组织的扩增子分析线下培训结束己经有三个多月了。为方便广大读者的学习，现在开始陆续分享上次培训的内部资料——理论课程课件。希望对想自学分析的朋友起到一定帮助作用。 首先讲一下真菌的定义，真菌通常指的是真菌界的生物，是一类单细胞或多细胞异养真核微生物,无光合色素，细胞壁含几丁质和纤维素。按功能划分，可大致分为3类，病原菌、共生菌和腐生菌。真菌具有很高的物种...原创 2018-06-29 22:04:20 · 3490 阅读 · 1 评论 -
科研经验1：云笔记积累个人知识体系
笔记的记录方式笔记是个人能力提高和知识体系积累的关键性习惯！ 常见的笔记记录方式有三种，其实也是我个人笔记记录方式成长的三个阶段。1. 传统的纸记录方法。2008年我大学本科毕业前的记录方式，也可能是绝大多数人的习惯，最近问了6个使用程序语言工作的新手，居然有3人还使用纸记录的方式记录编程经验笔记，实在令我很吃惊，首先不用説代码的体量，就是以后想重用查找和输入就是极耗时的，绝不可取。2. Word原创 2017-07-17 07:57:03 · 3039 阅读 · 0 评论