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刘永鑫Adam
刘永鑫，中国农科院基因组所研究员，iMeta期刊执行主编，宏基因组公众号创始人。主要研究方向为微生物组研究方法、食品组与微生物组功能研究和科学传播，在Science、Nature Biotechnology、Nature Microbiology、Cell Host & Microbe等期刊发表论文40余篇，被引9000余次。主编《微生物组实验手册》专著，由300多位同行参与，共同打造本领域长期更新的中文百科全书。创办宏基因组公众号，14万+同行关注，分享原创文章3千余篇，累计阅读量超3千万，打造本领域最具影响、服务同行的科学传播平台，免费发布您团队的成果、方法、经验、招生招聘，欢迎投稿。
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ISME：华中农大李霞组发现大豆根际微生物组变化与根瘤菌共生效率的关系
文章目录大豆根际微生物群落的变化及其与根瘤菌共生效率的关系写在前面摘要背景结果不同类型土壤中大豆根际区微生物组的组成和多样性图 1 三种类型土壤中大豆根际区微生物组的α和β多样性不同根际取样部位的微生物共现和相互作用网络图 2 不同隔间区域中的微生物相互作用网络大豆根瘤中根瘤菌的组成取决于土壤条件图 3 土壤处理与根际和根瘤中的根瘤菌组成的关系根际微生物组与根瘤菌的结瘤有关图 4 根际微生物群落结构与中华根瘤菌和慢生根瘤菌的结瘤有关在体外芽孢杆菌对根瘤菌生长的不同作用图 5 芽孢杆菌对根瘤菌生长和结瘤的影响原创 2020-05-17 22:39:51 · 6150 阅读 · 0 评论 -
广东生态所孙蔚旻团队EST发表尾矿微生态调查两部曲
文章目录广东生态所孙蔚旻团队ES&T发表尾矿微生态调查两部曲第一篇第二篇图文摘要成果简介全文速览背景介绍系列文章亮点图文解析（文章一）尾矿是一种环境极端恶劣的场地尾矿微生物三大生存策略图文解析（文章二）尾矿极端环境的地球化学性质及其对微生物功能的影响尾矿极端环境的地球化学性质及其对微生物功能的影响总结与展望作者介绍猜你喜欢写在后面广东生态所孙蔚旻团队ES&T发表尾矿微生态调查两部曲广东省生态环境技术研究所孙蔚旻团队ES&T发表尾矿微生态调查两部曲：尾矿逆境下微生物的生存策略与化能原创 2020-05-10 14:23:45 · 2198 阅读 · 0 评论 -
mSystems：南京土壤所禇海燕组受邀发表微生物生物地理学综述(官方配视频简介)
文章目录瞬息万变的世界中的土壤微生物生物地理学：最新进展和未来展望写在前面视频介绍快讯图 1 长期以来在微生物生物地理学领域已发表文章的数量图 2 土壤微生物生物地理学中需要进行时空研究的主要领域(1)全球尺度下土壤微生物群落分布规律及其驱动机制(2)土壤微生物时空分布与生态系统功能的耦联(3)全球变化背景下土壤生物多样性及其功能的分布图谱绘制展望未来(i)仍然缺乏对微生物物种的明确定义，这对于生...原创 2020-04-22 23:23:29 · 2497 阅读 · 0 评论 -
Gut Microbes：南医大刘星吟团队揭示肠道微生物谱的改变与孤独症谱系障碍的异常神经递质代谢活动相关
文章目录肠道微生物谱的改变与孤独症谱系障碍的神经递质代谢活动相关导读背景结果研究队列信息表1. 入组研究对象情况表16S rRNA基因测序结果表明孤独症儿童的肠道菌群组成发生改变图1. 16S rRNA测序结果表明健康儿童组（TD）和孤独症儿童组（ASD）的肠道菌群组成存在差异图S1. 非便秘孤独症组（NC-ASD）和健康组（TD）的肠道菌群分析。图S2. 便秘孤独症组（C-ASD）和非便秘孤独症...原创 2020-04-22 00:57:44 · 5972 阅读 · 0 评论 -
Science：充满铵盐的环境依然发生固氮
文章目录深海古菌在消耗甲烷的微生物群中固定和共享氮写在前面平衡氮预算摘要正文图 1 在与CH4和不同的15N标记的N源孵育的沉积物中，有代表性的甲烷氧化菌ANME-2/DSS联合体中，15N掺入的多少及分布图 2 氮源对细胞生长和呼吸速率的影响图 3 有代表性的带壳ANME-2/DSS聚集体中的一系列FISH和12C15N/12C14N离子图像显示了来自于15N2的15N的结合随深度的分布图 2 ...原创 2020-04-19 21:20:34 · 2169 阅读 · 0 评论 -
EL：固氮能力主要取决于物种分类而不是土壤养分
文章目录分类学特征决定了低地热带森林中冠层树木对氮的固定写在前面摘要背景结果图 1 在干扰条件下六种物种中有结瘤的部分树木的分布图 2 低地热带森林中99棵豆科植物的N2固定率图 3 六种豆科植物的固氮率图 4 细根的AM定殖图 5 荫棚中的*Inga punctata*苗对实验营养物添加的响应讨论个体和物种对N2的固定物种类别、干扰与土壤养分的相互作用固定和菌根定殖钼的限制？结论材料与方法固氮酶...原创 2020-04-19 20:53:18 · 1359 阅读 · 0 评论 -
Cell子刊：中科院遗传发育所周俭民组发现特异靶向病原菌致病力的植物天然产物并阐明作用机制
SFN抑制分泌系统表达的分子模式图特异靶向病原细菌致病力的植物天然产物并阐明其作用的分子机制An Arabidopsis Secondary Metabolite Directly Targets Expression of the Bacterial Type III Secretion System to Inhibit Bacterial VirulenceCell Host and...原创 2020-04-16 23:21:56 · 1464 阅读 · 0 评论 -
宏基因组扩增子最新分析流程QIIME2：官方中文帮助文档
本网对Markdown排版支持较差，对格式不满意的用户请跳转至 或“宏基因组”公众号阅读；注：文为蓝色字均为文章链接，可点击直达写在前面**声明：本文为QIIME2官方帮助文档的中文版，由中科院遗传发育所刘永鑫博士翻译并亲测有效，文档翻译己获QIIME2团队官方授权。由于QIIME2更新频繁，如使用中遇到问题请访问QIIME2官方论坛阅读最新版中文帮助。 https://forum.qiime2.原创 2017-09-11 09:19:48 · 9101 阅读 · 0 评论 -
宏基因组扩增子2分析流程：中文首发,史上最详系,零基础自学
本网内容首发“宏基因组”公众号，更佳阅读体验、更多相关文章，欢迎点我跳转至公众号阅读写在前面之前发布的《扩增子图表解读》系列，相信关注过我的朋友大部分都看过了(链接直达7月文章目录)。这些内容的最初是写本实验室的学生们学习的材料，加速大家对同行文章的解读能力。《扩增子分析解读》系列文章介绍扩增子分析是目前宏基因组研究中最常用的技术，由于微生物组受环境影响大，实验间重复较原创 2017-09-10 07:26:34 · 5676 阅读 · 0 评论 -
Science综述：利用根际微生物组提高作物抗旱和产量
文章目录利用根际微生物组生产抗旱作物写在前面摘要背景干旱响应特征图 1 植物和微生物对干旱的响应及其效应性状的关系植物信号表 1 干旱条件下微生物群落响应及效应特征表 2 干旱条件下植物的响应及效应特征微生物机制益生菌初级和次级植物代谢物图 2 干旱期间和干旱后植物-微生物相互作用的假定变化平移的可能性结论Reference猜你喜欢写在后面利用根际微生物组生产抗旱作物Harnessing r...原创 2020-04-19 15:59:07 · 5118 阅读 · 0 评论 -
Nature：何胜洋和辛秀芳组发表植物叶际微生物组稳态机制
文章目录植物遗传网络维持叶际微生物组稳态简讯背景正文简介图1. Col-0野生型和mfec突变体叶总和叶内微生物组图2. Col-0野生型、fec、min7和mfec突变体叶内微生物组图3 SynComCol-0 和 SynCommfec影响植物健康的功能比较图4. ben3突变体上的微生物组表型附图9. 植物控制叶内微生物组的模型作者简介陈桃 副教授辛秀芳 研究员何胜洋 教授Reference猜...原创 2020-04-09 22:33:09 · 2427 阅读 · 0 评论 -
EL：谁说N素含量高就不固氮了(本研究反而“多多益善”)
文章目录底物化学计量决定中国南方森林整个演替过程中的固氮作用写在前面摘要背景结果整个演替过程中的固氮、底物氮和磷以及化学计量图 1 整个森林演替中，土壤、森林地面和苔藓固氮率的箱线图图 2 在整个森林演替过程中，不同基质中的N，N：P，C：N和C：(N：P)图 3 整个森林演替过程不同基质中的固氮率与N，P，C：N或C：(N：P)之间的关系图 4 结构方程模型解开了森林演替控制苔藓中固氮的主要途径...原创 2020-04-03 20:19:01 · 1386 阅读 · 0 评论 -
Cell子刊：人体肠道病毒组高度多样、稳定且个体特异
文章目录人体肠道病毒组高度多样，稳定并且个体特异热心肠日报图型摘要摘要背景结果总病毒载量和α-多样性是是个体特有的，并具有持久的特征图1 通过VLP鸟枪测序恢复的病毒多样性的实验设计随着时间的推移人类病毒高度个体且组成稳定图2 个体间病毒组特异性、保守性以及与细菌组组成的相关性PPVs稳定，并且在数量上占优势图3 病毒组中的相对重量和PPV的分类组成PPV成员的聚类揭示了与人类细菌微生物群主要成员...原创 2020-03-29 16:27:11 · 2890 阅读 · 0 评论 -
SBB：替代固氮酶对非共生固氮可能的贡献
文章目录替代固氮酶对土壤中非共生固氮菌固氮可能的贡献写在前面亮点摘要背景结果与讨论固氮菌纯培养中的R比图 1 *A.vinelandii*(A)和*R.palustris*(B)培养物中的R比率(乙炔还原率/N2固定率)。微域实验中典型和替代性固氮酶的存在与表达图 2 在Stony Ford野外监测站收集的改良土壤的乙炔还原率图 3 在Stony Ford野外监测站收集的经修饰土壤中的乙炔还原率(...原创 2020-03-28 11:44:05 · 1788 阅读 · 0 评论 -
Cell：土传遗产
文章目录土传遗产写在前面正文图 1 土传遗产: 根系微生物组的管理抗病土壤和“求援”假说激素对根际微生物群落的调节微生物组装配中的营养胁迫驱动力展望未来，继承遗产Reference猜你喜欢写在后面土传遗产The Soil-Borne LegacyImpact Factor：36.216DOI: https://doi.org/10.1016/j.cell.2018.02.024发表日期...原创 2020-03-27 18:47:39 · 1502 阅读 · 0 评论 -
NatureProtocols：使用MicrobiomeAnalyst统计和功能分析微生物组数据
文章目录使用MicrobiomeAnalyst进行微生物组数据的全面统计、功能和元分析摘要背景Introduction分析流程和界面设计图1 MicrobiomeAnalyst工作流程概述。图2 全面的数据分析和报告生成与其他网页工具比较表1 比较MicrobiomeAnalyst和其他三种网页工具对微生物组数据分析的流程局限性实验设计综合分析16S rRNA丰度数据基因丰度数据的功能分析和网络可...原创 2020-03-23 21:09:50 · 6627 阅读 · 1 评论 -
FM：代谢无机硫化合物的古菌Ferroplasma可介导细胞外电子传递
文章目录新观点：代谢无机硫化合物的古菌*Ferroplasma*可介导细胞外电子传递导读摘要背景1 方法1.1 提取DNA、RNA和高通量测序1.2 宏基因组数据的生物信息学分析1.3 宏转录组数据的生物信息学分析2 结果与讨论2.1 宏基因组组装基因组和RNA转录本2.2 MAGs编码的ISC代谢潜能2.3 电子转移到阳极2.4 MAGs内的固碳基因2.5 适应低pH的采矿工艺废水3. 结论译者...原创 2020-03-16 21:37:06 · 1898 阅读 · 0 评论 -
Science：固氮（The nitrogen fix）
文章目录固氮写在前面在植物生物技术方面，很少有项目比让作物自己制造所需的氮肥更困难，或者有希望获得更大的回报。图 1 非洲很普遍的贫瘠土壤中图 2 豆类植物的根瘤中寄宿有固氮细菌，这一特性可能被设计进谷物中图 3 自肥植物的两条途径Reference猜你喜欢写在后面固氮The nitrogen fixScienceImpact Factor 41.037DOI：https://doi....原创 2020-03-16 20:41:30 · 5421 阅读 · 0 评论 -
Microbiome：环境样品中绝对定量菌群丰度的新方法
文章目录环境样品中微生物群落丰度的绝对定量写在前面摘要背景结果结论背景方法P、E、F合成spikes的设计图 1 合成spike设计土壤样品的特征微生物学技术图 2 DNA提取前后添加的spikes对微生物定量的影响表 1 P、E、F合成spikes水平的影响PCR，测序及qPCRData analysis多维标度图(MDS)结果嵌合spiking可准确估算微生物的丰度合成的spikes可以测量原...原创 2020-03-16 16:15:58 · 10801 阅读 · 0 评论 -
NBT：线虫的工程细菌共生体提高对西方玉米根虫的生防潜力
文章目录线虫的工程细菌共生体提高西方玉米根虫的生物防治潜力摘要相关资料引言结果*Photorhabdus* 菌株的MBOA抗性图1 研究系统概述图2 对MBOA选择增加了不同*Photorhabdus*菌株的MBOA抗性通过选择MBOA抗性进行定向进化多重突变与MBOA的抗性相关表1 进化的MBOA-抗性菌株中的突变图3 MBOA抗性增加与各种突变有关图 4 WT aqpZ基因的补充恢复了具有MB...原创 2020-03-16 10:49:24 · 2527 阅读 · 0 评论 -
Science Bulletin：上海植生所王二涛组发表基于绝对丰度的植物根际微生物群落“扩增-选择”组装模型
文章目录Science Bulletin: 基于绝对丰度的植物根际微生物群落“扩增-选择”组装模型背景介绍研究方法结果与讨论作者简介王二涛于楠张学斌王孝林Reference相关文章猜你喜欢写在后面Science Bulletin: 基于绝对丰度的植物根际微生物群落“扩增-选择”组装模型2020年3月7日，Science Bulletin在线发表中科院分子植物科学卓越创新中心/植物生理与生态研究...原创 2020-03-10 16:23:39 · 2577 阅读 · 0 评论 -
SBB：无机肥对土壤中固氮菌丰度和群落结构的影响
文章目录25年的无机施肥处理对华南酸性土壤中固氮菌丰度和群落结构的影响写在前面摘要背景结果玉米生物量与土壤性质图 1 25年(1990 - 2015)的长期施肥试验的玉米生物量表 1 25年(1990 - 2015)长期施肥试验玉米栽培的土体和根际土壤理化性质nifH基因拷贝数及其与土壤性状的关系图 2 通过real-time PCR定量分析了25年(1990 - 2015)长期施肥试验玉米栽培的...原创 2020-03-07 21:24:22 · 3274 阅读 · 0 评论 -
PlantCom：基于内参的宿主相关丰度定量分析揭示植物根系微生物组的微生物总量变化
文章目录基于内参的宿主相关丰度定量分析揭示植物根系微生物组的微生物总量变化摘要背景介绍图1.植物根部微生物组定量丰度分析的优势和实验步骤结果spike-in内参质粒和HA-QAP方法的原理内参质粒（spike-in）适用于定量分析微生物组谱图2. 在细菌模拟实验中HA-QAP比传统的基于相对丰度的分析更准确在人工混菌实验中检测微生物总量以评估方法的设计和合理性HA-QAP在模拟实验中检测根微生物组...原创 2020-02-23 21:18:03 · 2829 阅读 · 0 评论 -
Cell：植物根系如何允许有益微生物定植的
文章目录损伤和微生物模式的共同作用控制着根部的局部免疫反应写在前面图解摘要亮点总结背景结果flg22诱导的MAMP反应在拟南芥根中受到空间限制图1 flg22诱导的MAMP反应在拟南芥根中受到空间限制激光诱导的细胞消融引起根中局部MAMP的响应性图2 有限的细胞损伤导致根中局部MAMP的反应性DAMP的单独存在不足以诱导MAMP响应图3 DAMP的单独存在不足以诱导MAMP响应MAMP受体的表达是...原创 2020-02-18 20:35:36 · 6821 阅读 · 0 评论 -
SBB：土壤微生物群落的特征究竟由什么决定
文章目录环境条件而非微生物接种物的组成决定了重建土壤微生物群落的细菌组成、微生物生物量和酶活性写在前面摘要背景材料与方法土壤样品微生物群落交换和培养土壤分析细菌群落组成和功能基因丰度统计分析结果长期施肥对土壤性状有显著影响交换微生物接种物不会改变土壤性质表1. 对照组、自我接种组和交换接种组的土壤理化特性和微生物生物量碳浓度表2. 对照组、自我接种组和交换接种组的6种酶活性微生物接种对功能基因丰度...原创 2020-02-14 21:42:01 · 4823 阅读 · 0 评论 -
NBT：使用纳米孔测序从微生物组中得到完整闭环的细菌基因组
文章目录使用纳米孔测序从微生物组中得到完整成环的细菌基因组热心肠导读摘要前言结果图1 定义的12种细菌混合物中的序列分类学组成、每种细菌的读长分布和基因组组装图2：在两个健康的人类粪便微生物群中，每个人样本组装的连续性，多样性和微生物分类学组成表1. 从人类粪便样品中组装得到的环形细菌基因组图3. *P. copri* 和*Cibiobacter sp* 的闭合环形完整基因组的圈图材料方法人类粪便...原创 2020-02-13 14:54:14 · 895 阅读 · 0 评论 -
NBT：扩增子及其他测序的最小信息标准和测序规范(MIMARKS)
文章目录扩增子测序的最小信息标准和测序规范摘要正文图1：为MIxS 标准的三大子标准及其相关的环境包的详细信息。扩增子最小信息标准和环境包的发展表1 MIMARKS清单的核心项目，以及类型，描述和需求状态群落主导的调查结果对已发表发表的数据的总结MIMARKS信息列表MIxS 环境包符合MIMARKS的数据示例展示主要数据库和信息资源的使用MIxS标准的维护结论和呼吁采取行动背景知识猜你喜欢写在后...原创 2020-02-12 19:35:04 · 1946 阅读 · 0 评论 -
Nature子刊：南土所贾仲君组-稻田甲烷氧化的微生物机制
文章目录传统甲烷氧化菌主导稻田土壤中大气甲烷的氧化写在前面摘要背景结果与讨论土壤中HAMO活性的发生与恢复图1 水稻土高亲和力甲烷氧化活性的发生与恢复与土壤HAMO活性相关的活跃的甲烷氧化菌图2 水稻土中具有和不具有高亲和力甲烷氧化活性的甲烷氧化菌的转录谱已知的甲烷氧化菌的生长和HAMO活性的诱导图3 甲烷氧化菌的丰度与水稻土中高亲和力甲烷氧化活性的出现和恢复有关图4 *pmoA*基因和甲烷氧化菌...原创 2020-01-24 18:51:11 · 5879 阅读 · 0 评论 -
BT：胞外酶-化腐朽为神奇的催化剂
文章目录关键胞外酶触发了细菌群落演替偶联的高效堆肥写在前面摘要背景3 结果与讨论3.1 理化参数图 1 堆肥过程中温度的变化图 2 堆肥过程中所选择的物理化学参数的变化3.2 酶活表 2 堆肥处理、堆肥阶段及其相互作用对堆肥过程中酶活性的影响3.3 细菌群落演替图 3 三种处理在堆肥过程中各发育时间点(阶段)的细菌群落结构3.4 将细菌群落与环境参数和酶活性联系起来图 4 RDA分析了三种处理的升...原创 2020-01-12 17:17:40 · 2479 阅读 · 0 评论 -
PB：玉米气生根分泌物支持的高效生物固氮
文章目录黏液相关的固氮微生物群支持的一种玉米的固氮作用写在前面摘要作者总结背景结果Sierra Mixe地区玉米的形态和粘液图 1 Sierra Mixe玉米的生理特性图 2 气生根粘液Sierra Mixe玉米的固氮菌群图 3 基于DNA序列的Sierra Mixe玉米的微生物区系特征图 4 Sierra Mixe玉米黏液中固氮酶和N2固定的活性图 5 Sierra Mixe玉米样品中15N2在...原创 2020-01-12 15:32:11 · 3546 阅读 · 0 评论 -
SBB：南土所褚海燕组-pH主导土壤中固氮群落的共存与装配
文章目录土壤pH与麦田根际和土体土壤中固氮群落的共存和装配过程有关写在前面摘要背景材料与方法样品收集土壤理化分析高通量测序和生物信息学分析统计分析结果小麦根际和土体土壤固氮菌的群落结构图1 土体土、松散结合土和紧密结合土中主要固氮菌属的相对丰度三个区块固氮菌群落的互作关系及网络拓扑特征图2 固氮菌群落在属水平上的共现网络结构(A); 在OTU水平上分析模块特性的网络作用(B).影响根际和土体土壤固...原创 2020-01-12 09:52:08 · 4037 阅读 · 1 评论 -
PNAS：问微生物群落演替之随机性与确定性过程-谁主沉浮
文章目录揭示微生物演替中调节随机性和确定性过程之间平衡的机制写在前面摘要背景意义概念模型图1 由初级演替过程中生态选择的强度和类型的变化有关的备择假设组成的三阶段概念模型阶段1:微生物群落装配最初是由随机性过程控制的。阶段2:当地环境的变化逐渐增加了确定性选择的重要性阶段3:稳定环境的出现导致了确定性选择的稳定水平中性理论假说结果概念模型评估图2 *β* NTI模型和随机性演替阶段之间群落装配过程...原创 2020-01-07 22:53:29 · 21015 阅读 · 0 评论 -
NC：菌物组构建---随机性v.确定性、干旱胁迫、宿主筛选、统一动态(郭良栋、杨军点评)
文章目录NC：作者解读菌物组构建---随机性v.确定性、干旱胁迫、宿主筛选、统一动态摘要作者解读高粱菌物组的结构：即宿主植物如何在时间、区室、基因型维度上影响真菌群落？假说1：随机性与群落大小假说2：随机性与干旱胁迫群落动态的统一性相关文章作者简介专家点评郭良栋研究员点评杨军研究员点评猜你喜欢写在后面NC：作者解读菌物组构建—随机性v.确定性、干旱胁迫、宿主筛选、统一动态Fungal com...原创 2020-01-07 18:55:56 · 2535 阅读 · 0 评论 -
COM：病原体之外-微生物组与植物免疫系统的相互作用
文章目录病原菌之外：微生物组与植物免疫系统的相互作用Beyond pathogens: microbiota interactions with the plant immune system划重点背景植物免疫系统影响微生物组装配图1. MAMP的常规模式和微生物用来逃避植物免疫系统的潜在机制微生物组用于逃避或抑制植物免疫的策略MAMP序列变异MAMP降解和隔离MAMP修饰图2. 微生物组扩展了植...原创 2019-12-30 08:56:23 · 4404 阅读 · 1 评论 -
COM：微生物促进植物的氮获得
文章目录微生物植物关联促进植物的氮获得划重点摘要前言通过菌根获得氮图1 通过微生物联合获取氮根系微生物群有助于氮营养与根相关的共生内生固氮菌的生物固氮结论微生物植物关联促进植物的氮获得Microbial associations enabling nitrogen acquisition in plantsCurrent Opinion in Microbiology [6.916]20...原创 2019-12-29 20:50:46 · 3542 阅读 · 0 评论 -
COM：细菌-真菌的平衡维持动植物健康
文章目录细菌-真菌的平衡维持动植物健康划重点摘要前言植物和动物生态位中细菌和真菌群落的变化图1.动植物生态位中的优势细菌和真菌类群的组成和变化动植物生态位中的细菌-真菌共生图2.细菌-真菌失衡是动植物疾病的潜在原因宿主疾病中细菌-真菌平衡的改变结语相关阅读：细菌-真菌的平衡维持动植物健康Contribution of bacterial-fungal balance to plant and...原创 2019-12-29 17:19:36 · 2912 阅读 · 1 评论 -
Microbiome：城环所杨军组揭示随机过程主导亚热带河流微型真核浮游生物群落构建
文章目录Microbiome: 随机过程主导亚热带河流微型真核浮游生物群落构建新闻稿引言结果与讨论结论：通讯作者简介Reference猜你喜欢写在后面Microbiome: 随机过程主导亚热带河流微型真核浮游生物群落构建【题目】Stochastic processes shape microeukaryotic community assembly in a subtropical rive...原创 2019-12-15 10:40:39 · 3784 阅读 · 0 评论 -
COM：求助根系分泌物：受胁迫植物从土壤中招募益生菌的适应性机制
文章目录求助根系分泌物：受胁迫植物从土壤中招募益生菌的适应性机制划重点摘要前言图1.“求助”假设的连续阶段模型第1阶段：根系对地下和地上攻击者的免疫反应第2阶段：胁迫刺激改变根系分泌物中抗菌物剂和信息素图2.草酸盐（a）和萜类化合物（b）途径的示意图第3阶段：根系分泌物对根系相关和土壤相关微生物组的影响第4阶段：根系相关和土壤相关微生物组抑制昆虫和病菌的机制图3.在植物微生物圈疾病抑制机制途径中磷...原创 2019-12-04 23:41:03 · 4278 阅读 · 0 评论 -
Nature：中科院先进院发现空间扩展生境定殖的进化稳定性策略
文章目录一种生物扩张栖息地的进化稳定策略导读摘要正文**图1.基于位置选择的实验进化**两株菌在空间上的竞争**图2.空间中的竞争扩张**竞争扩张的动力学建模**图3.三株菌间的竞争与稳定距离**进化稳定的策略**图4.竞争动力学的稳定基线**稳定性准则的验证**图5.进化稳定性线的验证**方法培养基与生长条件菌株和质粒构建进化实验过程扩张速度测量生长速度测量竞争试验实时定量RT–PCR单细胞追踪...原创 2019-12-01 10:36:02 · 1762 阅读 · 0 评论 -
COM：养分平衡在塑造植物根-真菌互作中的作用：事实与猜想
营养平衡在塑造植物根-真菌互作中的作用：事实和推测The role of nutrient balance in shaping plant root-fungal interactions: facts and speculationCurrent Opinion in Microbiology [6.916]2019-11-14，Review原文链接：https://doi.org/...原创 2019-11-30 13:07:47 · 1805 阅读 · 0 评论