认识方差分析（ANOVA）的基本概念

 下面内容摘录自《用R探索医药数据科学》专栏文章的部分内容。

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5章8节：方差分析（ANOVA）及其应用-CSDN博客文章浏览阅读278次。方差分析是一种用于比较两个或两个以上样本均数差异是否具有统计学意义的统计方法。在医学科研中，我们经常需要比较不同组间的均值，例如不同种族、不同治疗组或不同病情阶段的比较。方差分析不仅可以帮助我们了解组间差异的显著性，还能指导我们进一步的统计分析和实验设计。https://blog.csdn.net/2301_79425796/article/details/141597978?csdn_share_tail=%7B%22type%22%3A%22blog%22%2C%22rType%22%3A%22article%22%2C%22rId%22%3A%22141597978%22%2C%22source%22%3A%222301_79425796%22%7D

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.......前面部分请点击上面链接看原文（原文6809字）

 一、方差分析的基本概念

1、基础概念

方差分析（Analysis of Variance，简称ANOVA）的核心思想是检验不同组之间是否存在显著的均值差异。它通过比较组间变异（组与组之间的差异）与组内变异（组内部的差异）来判断组均值是否存在显著差异。

方差分析基于以下几个基本概念：

1. 总体均值（Population Mean）：所有观测值的平均值。
2. 组内变异（Within-group Variance）：同一组内观测值的变异程度。
3. 组间变异（Between-group Variance）：不同组间均值的变异程度。

方差分析的基本假设包括：

• 各组样本来自正态分布的总体。
• 各组的总体方差相等（方差齐性假设）。

3、方差分析的应用

方差分析的目标是通过比较组间变异和组内变异的比率，判断不同组之间的均值是否存在显著差异。方差分析通过F统计量进行检验，该统计量是组间均方与组内均方的比率。

假设检验：零假设：所有组的均值相等，即各组间没有显著差异。备择假设：至少有两组的均值不相等，即存在显著差异。

计算方差：1）计算组间方差（用于衡量不同组均值间的变异）。2）计算组内方差（用于衡量组内个体之间的变异）。

F检验：比较组间方差与组内方差的比率，即F值。如果F值较大，说明组间差异相对于组内差异较大，从而可以拒绝零假设。

二、在R应用单因素方差分析

单因素方差分析（One-Way ANOVA）是一种统计方法，用于比较两个或多个独立样本组的均数，以判断这些样本组之间是否存在显著差异。它是一种扩展的t检验，适用于比较多个组之间的均数，而不仅限于两组。

在下面的这个例子是一个单因素方差分析，只有一个自变量或因素，即种族（fa.race），而因变量是新生儿体重（bwt）。单因素方差分析用于检验不同种族组之间的均数是否存在显著差异

1、进行方差分析

R 语言提供了强大的工具来执行方差分析。以下是一个具体的示例，演示如何使用 R 语言中的 aov() 函数进行方差分析，并通过 TukeyHSD() 函数进行事后检验。

加载必要的包

首先，我们需要加载相关的 R 包。对于这个示例，我们将使用 MASS 包中的数据集 birthwt。

# 加载必要的包
library(MASS)

 加载数据

我们将使用 birthwt 数据集，这是一个关于新生儿体重的数据集。我们需要首先查看数据集的结构，以确认变量的类型和名称。

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