基因表达差异分析R工具包DESeq2的详细使用方法和使用案例(1)

文章参考

Moderated estimation of fold change and dispersion for RNA-seq data with DESeq2 | Genome Biology | Full Text (biomedcentral.com)")

bioconda源对工具包的介绍：

Bioconductor - DESeq2

安装

下面是在R中安装DESeq2的详细步骤：

1. 安装R和RStudio：

   • 如果你还没有安装R，可以在R官方网站下载并安装最新版本的R。
   • 推荐使用RStudio作为R语言的集成开发环境。你可以在RStudio官网下载并安装适合你操作系统的版本。

2. 启动R或RStudio：

   • 打开R或者RStudio。

3. 安装DESeq2包：

   • 在R或RStudio的命令行中输入以下命令安装DESeq2包：

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")

BiocManager::install("DESeq2")

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