R语言融合技术在生态环境数据统计分析、绘图——建议收藏！

R语言融合技术在生态环境数据统计分析、绘图——建议收藏！https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzUzNTczMDMxMg==&mid=2247620286&idx=2&sn=0284283cbe6835cc941a5b225edb920f&chksm=fa825759cdf5de4fe990bc26e220e9e452f748c8223696a4d68963a3d5ef530b0c06494ebca1&token=1460282477&lang=zh_CN#rd

前沿

R语言的丰富程序包生态系统和强大的社区支持，使其在处理复杂数据分析任务时表现出色。GPT大语言模型在助力利用R语言开展数据统计分析方面有着令人遐想的广阔空间。

一：生态环境数据统计基础

1.1 生态环境数据特点及统计方法

1．生态环境数据复杂性和多样性

2．生态环境数据类型及分布特点

3．生态环境数据主要统计分析方法及统计检验（t-检验、F检验、卡方检验）

4．根据数据类型、特点及结构选择合适的统计方法

1.2 GPT大语言模型

1．GPT大语言模型：定义、架构及发展历程

2．GPT大语言模型使用入门

3．GPT大语言模型提示词（prompt）

1)提示词基本语法及应用

2)提高大语言模型回答质量策略

4．让GPT成为科研助手：文献综述；实验设计；数据分析。。。。

5．GPT与R语言结合开展数据分析优势

1.3 GPT&R：R语言入门

1．GPT辅助安装与配置R和RStudio

2．GPT辅助学习R语言程序包和函数用途和用法

3．GPT辅助学习R中变量、数据类型、函数等

4．GPT辅助开展R语言数据基本操作

1.4 GPT&R：生态环境数据准备及绘图基础

1．生态环境数据类型及常见数据资源

2．GPT辅助生态环境数据整理及清洗

3．GPT辅助生态环境数据探索

4．GPT辅助ggplot2绘图

1) 基础绘图类型：散点图、箱线图、频率图、提琴图、峰峦图、相关图等

2) 高级绘图技巧: 多图组合、排版及生成高质量图（论文发表）

二：GPT&R：回归与混合效应模型

2.1 一般和广义线性回归模型（lm&glm）

1．一般线性模型和广义线性模型：基本原理、假设条件及应用情景等

2．GPT辅助一般线性模型（lm）R语言实现

1)回归模型

2)方差分析

3)协方差分析

4)模型诊断

5)模型选择（逐步回归）

3．GPT辅助广义线性模型（glm）R语言实现

1) 广义回归模型、链接函数、分布族、模型比较

2) 逻辑斯蒂回归（0，1数据）

3) 泊松回归（计数数据）:泊松、负二项分布、零膨胀、零截断

2.3相关数据分析：空间、时间及系统发育相关

1．回归模型数据自相关问题

2．GPT辅助空间自相关数据分析案例：模型构建、模型比较、模型诊断等

3．GPT辅助时间自相关数据分析案例：模型构建、模型比较、模型诊断等

4．GPT辅助系统发育相关数据分析案例：模型构建、模型比较、模型诊断等

三：GPT & R：多元统计分析

3.1 多元统计中的排序分析

1．多元统计分析技术在生态环境数据分析应用

2．GPT辅助多元统计中的排序分析

1)非约束排序（PCA、PCoA、NMDS）分析：模型选择、结果及绘图

2)约束排序（RDA、db-RDA）分析：数据筛选、变量选择、结果及绘图

3.2多元统计中的聚类分析及分组差异检验

1．GPT辅助多元统计中的聚类分析

1)层次聚类（hclust）：数据检查、聚类聚类质量评估、结果及绘图

2)非层次聚类（kmeans）：数据检查、聚类聚类质量评估、结果及绘图

2．GPT辅助多元统计中的分组差异检验

1)非参数多元方差分析（PERMANOVA）分析

2)非参数多元方差分析（PERMANOVA）与非约束排序（PCoA）结合

3.3多元统计中机器学习：随机森林（Random Forest，RF）模型

1．随机森林模型

2．GPT辅助随机森林模型分类案例：模型构建、交叉验证、变量重要性评估等

3．GPT辅助随机森林模型回归案例：模型构建、交叉验证、变量重要性评估等

四：GPT&R：结构方程模型（SEM）（lavaan）

1．结构方程模型（SEM）基本原理

2．GPT辅助结构方程模型（lavaan）分析

1) 初始模型构建

2) 模型调整

3) 模型评估及结果表达

3．GPT辅助潜变量（latent）分析

4．GPT辅助复合变量（composite）分析

五：GPT&R：其他统计模型或方法

5.1 GPT辅助非线性数据分析

1．非线性数据分析：广义可加模型 VS 非线性模型

2．广义可加模型（GAM）案例：模型构建、模型诊断、结果绘图等

3．非线性模型（NLM）案例：模型构建、参数设置等

5.2 GPT辅助Meta分析（Meta-analysis）

1．Meta分析基本原理

2．Meta分析效应值选则与计算

3．Meta分析效应值（累积/平均）：随机效应模型、固定效应模型、森林图等

4．Meta分析解释变量引入（分类/连续变量）及结果绘图

5．Meta分析模型诊断：发表偏爱性、失安全系数等

5.3 GPT辅助贝叶斯回归与混合模型

1．贝叶斯回归和混合效应模型

2．贝叶斯回归模型案例：模型构建、模型诊断及结果绘图

3．贝叶斯混合效应模型案例：模型构建、模型诊断及结果绘图