11篇文章详解聚类和PCA可视化

于 2023-10-19 16:05:33 发布
阅读量316 收藏 2
点赞数
分类专栏： 数据可视化 文章标签： 聚类 数据挖掘 机器学习
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/Ayue0616/article/details/133928936
版权

聚类分析和主成分分析是常见的两种研究方法，可用于发现规律、探索异常观测等，在医学研究和生信数据挖掘中都是必学的方法，主成分分析也是机器学习中常见的降维方法之一。这里总结了R语言中常见的聚类分析和主成分分析可视化的方法。

使用R语言进行聚类分析

R语言聚类分析美化

聚类分析可视化之dendextend

聚类分析可视化之FactoMineR

R语言画好看的聚类树

树状数据/层次数据可视化

R语言主成分分析

R语言主成分分析可视化(颜值高，很详细)

R语言美化PCA图

R语言PCA可视化3D版

R语言因子分析

医学和生信笔记
关注
  • 0
    点赞
  • 踩
  • 2
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 0
    评论
专栏目录
聚类算法数据集
08-14
对聚类算法进行测试的数据
【20211208】【Matlab】使用Matlab中的pca函数实现数据降维，并将数据可视化
诗小葵的博客
12-08 1万+
1. pca函数使用方法 [coeff, score] = pca(data); （1）输入参数 data：待降维的数据集 （2）输出参数 coeff：主成分分量，即样本协方差矩阵的特征向量； score：主成分，即样本在低维空间的投影，也就是降维后的数据。 注意：score 的维度和原始样本 data 的维度一致，如果想要降到 k 维，只需选取 score 的前 k 列即可~ %% clear; clc; close all...
机器学习之聚类算法——聚类效果评估可视化
哆啦A瑶的博客
01-07 9559
我曾在机器学习之聚类算法应用篇中介绍过，聚类算法常使用轮廓系数来评估聚类效果，不过有时候并不是轮廓系数越大越好，如下面两幅图所示，图中的红色虚线表示聚类系数分数： 显然将簇数据设置为2的时候得到的轮廓系数最高，达到了0.705分，但是这并不一定是最好的聚类结果，显然在这个测试集中，我们有4个簇。为了将各个簇的轮廓系数以可视化的形式展现出来，辅助决策聚类参数，【机器学习】菜菜的sklear...
聚类算法——主成分分析（PCA）
CBF_genominer的博客
05-05 1万+
PCA（Principal Component Analysis）是一种常用的数据分析方法。PCA通过线性变换将原始数据变换为一组各维度线性无关的表示，可用于提取数据的主要特征分量，常用于高维数据的降维。网上关于PCA的文章有很多，但是大多数只描述了PCA的分析过程，而没有讲述其中的原理。这篇文章的目的是介绍PCA的基本数学原理，帮助读者了解PCA的工作机制是什么。当然我并不打算把文章写成纯数学文章
吴恩达机器学习：聚类与降维 （K-means & PCA）总结与作业
weixin_44330777的博客
09-27 4835
（一）聚类：简介K均值算法（ K-Means Algorithm ） 聚类算法将样本聚类分成不同的簇（cluster），其中K-means是最普及的一种聚类算法，它的思想其实就是迭代，假设我们想要将数据聚类成k个簇，其步骤为: 首先选择K个随机的点，称为聚类中心（cluster centroids）；（如图a,b，以K=2为例） 对于数据集中的每个点，按照与聚类中心的距离，将其与距离最近的聚类中心点聚成一类；（如图c） 计算每一个组的平均值（重心位置），将该组所关联的中心点移动到平均值的位置；（
主成分分析（PCA）：通过图像可视化深入理解
小白学视觉
01-04 1万+
点击上方“小白学视觉”，选择加"星标"或“置顶”重磅干货，第一时间送达主成分分析简介主成分分析（PCA）是一种广泛应用于机器学习的降维技术。PCA 通过对大量变量进行某种变换，将这些变量中...
R语言高维数据的pca、 t-SNE算法降维与可视化分析案例报告
weixin_34293059的博客
05-23 1878
维度降低有两个主要用例：数据探索和机器学习。它对于数据探索很有用，因为维数减少到几个维度（例如2或3维）允许可视化样本。然后可以使用这种可视化来从数据获得见解（例如，检测聚类并识别异常值）。对于机器学习，降维是有用的，因为在拟合过程中使用较少的特征时，模型通常会更好地概括。 在这篇文章中，我们将研究三维降维技术： 主成分分析（PCA）：最流行的降维方法 内核PCA：PCA的一种变体，允许...
【Python | TensorBoard】用 PCA 可视化 MNIST 手写数字识别数据集
Alan Lee
12-10 1万+
Principal component analysis (PCA) is a statistical procedure that uses an orthogonal transformation to convert a set of observations of possibly correlated variables into a set of values of linearly u
【sklearn】对MNIST数据集进行PCA降维与重构，可视化对比
qq_46105528的博客
11-30 2104
对MNIST数据集进行PCA降维与重构，可视化对比
详解Python可视化神器Yellowbrick使用
09-18
Python可视化神器Yellowbrick是一款强大的工具，它为机器学习模型的选择和评估提供了丰富的视觉反馈。Yellowbrick基于Scikit-Learn API构建，与matplotlib紧密结合，旨在帮助数据科学家更好地理解模型的内部工作原理...
pca.rar_pca
09-21
1. **可视化**：在高维数据中，PCA可以将数据降维至二维或三维，便于观察数据的分布和聚类情况。 2. **数据压缩**：PCA可以用于数据的压缩，降低存储需求，同时尽可能保留重要信息。 3. **机器学习预处理**：在...
基于t-sne算法的降维可视化实例.zip
最新发布
09-15
5. **可视化结果**：最终，我们得到的低维表示可以直观地绘制在二维或三维图上，揭示数据的内在结构和潜在聚类。 **应用领域：** T-SNE广泛应用于机器学习、数据挖掘、图像分析等领域。例如，在自然语言处理中，它...
pca.rar_pca降维_主成分分析_主成分降维_降维处理
09-19
在机器学习、统计学和数据可视化领域，PCA广泛应用于减少数据复杂性，同时保持数据集的主要特性。标题中的"pca.rar_pca降维_主成分分析_主成分降维_降维处理"正是对PCA这一主题的概括，而"pca.m"可能是一个MATLAB...
Kernel-PCA.rar_主成分_核pca_核pca的matlab_核主成分
09-19
例如，它可以用于高维数据的可视化，非线性特征提取，以及数据的分类和聚类等任务。在实际项目中，理解并能熟练运用KPCA可以帮助我们揭示隐藏在复杂数据背后的模式和结构，提升模型的性能和解释性。 **学习建议** ...
TSNE—聚类结果可视化
柳杰的博客
04-01 5万+
文章目录一、TSNE参数解析   TSNE的定位是高维数据可视化。对于聚类来说，输入的特征维数是高维的(大于三维)，一般难以直接以原特征对聚类结果进行展示。而TSNE提供了一种有效的数据降维模式，是一种非线性降维算法，让我们可以在2维或者3维的空间里展示聚类结果。 一、TSNE参数解析   t-SNE是一个可视化高维数据的工具。它将数据点之间的相似性转换为联合概率，并试图最小化低维嵌入数据和高维数据联合概率之间的KL散度。t-SNE具有非凸的代价函数，即不同的初始化可以得到不同的结果。 class skle
三、（3）PCA降3维下的K-means聚类可视化
python
05-15 5018
三、（3）PCA降3维下的K-means聚类可视化 完整代码如下： # -*- coding: utf-8 -*- """ Created on Wed May 15 11:40:27 2019 @author: sun """ import codecs import matplotlib.pyplot as plt from sklearn.feature_extraction.text...
PCA聚类算法
qinglv1的博客
06-08 5987
1.可以参考文章：   自己去搜索相关的介绍，我只是写一些需要注意的地方2.PCA与线性回归的区别：    线性回归有一个拟合值，它的误差是红线代表线性回归的误差但是对于PCA算法来说：3.数据处理：    特征什么的进行归一化(或者叫做特征缩放)4.在数学上面的表示(奇异值分解)SVD    在matlab里面或者octave里面有一个现成的svd()函数：在这里的Sigma代表一个矩阵，对于s...
主成分分析（PCA）及其可视化——python
热门推荐
PY洋洋
11-17 9万+
一、主成分分析的原理 主成分分析是利用降维的思想，在损失很少信息的前提下把多个指标转化为几个综合指标的多元统计方法。通常把转化生成的综合指标称之为主成分，其中每个主成分都是原始变量的线性组合，且各个主成分之间互不相关，这就使得主成分比原始变量具有某些更优越的性能。这样在研究复杂问题时就可以只考虑少数几个主成分而不至于损失太多信息，从而更容易抓住主要矛盾，揭示事物内部变量之间的规律性，同时使问题得到简化，提高分析效率。 主成分分析正是研究如何通过原来变量的少数几个线性组合...
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值