Python绘制列线图

列线图是临床预测模型必不可少的元素，目前绘制列线图在R语言中是非常简单的事情，而且有各种精美的格式，但是你知道怎么使用python绘制列线图吗？

今天给大家介绍一个可以绘制列线图的python库，名字是：simpleNomo。

这个包可以直接使用excel文件进行绘制列线图，理论上只要是可以计算变量系数的模型都能使用，感觉还是挺方便的。

安装

环境需求：

pandas==1.2.4
numpy==1.21.5
matplotlib==3.5.1

安装，没改镜像的记得先修改pip镜像，不然可能会安装失败哦：

pip install simpleNomo

使用简介

就一个函数，使用方式如下：

nomogram(path, result_title="Positive Risk", fig_width=10, single_height=0.45, dpi=300,
         ax_para = {"c":"black", "linewidth":1.3, "linestyle": "-"},
         tick_para = {"direction": 'in', "length": 3, "width": 1.5,},
         xtick_para = {"fontsize": 10, "fontfamily": "Songti Sc", "fontweight": "bold"},
         ylabel_para = {"fontsize": 12, "fontname": "Songti Sc", "labelpad":100, 
                        "loc": "center", "color": "black", "rotation":"horizontal"},
         total_point=100)

主要是调节一下字体、标签啥的，和R语言中各种列线图的丰富选项是不能比的哈~

下面是使用演示，首先需要自己准备一个excel文件，这个template.xlsx文件内容长这样：

然后直接用即可：

import simpleNomo as sn

path = "../000files/nomogram-main/template.xlsx"
fig = sn.nomogram(path = path)

出图如下：

作者觉得相比于R和SAS，这个包绘制列线图的优势是可以显示risk，这是其他方式不具备的。

使用时记得引用文献：

Hong, H., & Hong, S. (2023). simpleNomo: A Python Package of Making Nomograms for Visualizable Calculation of Logistic Regression Models. Health Data Science, 3, 0023.

这个文献中还比较了一下和SAS、R中绘制列线图的异同：

所以你会使用这个python库绘制列线图吗？

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