【MIMIC数据库教程】三、MIMIC-IV3.1表格与字段详解(三):Hosp住院模块表格详解(中)


MIMIC-IV 3.1 表格与字段详解(三):Hosp 住院模块表格详解(中)

摘要: MIMIC-IV 是一个关系数据库,包含美国马萨诸塞州某三级学术医疗中心的住院患者数据。它继承 MIMIC-III 的基础,提供更丰富的数据,包括实验室测量、用药、生命体征记录等,支持医疗健康研究。但大量繁琐的表格极大地增加了数据处理的难度,本教程将详细介绍 MIMIC-IV 3.1 版本中包含的 31 张表格及其字段,帮助读者更好地理解和使用 MIMIC-IV 数据库。我将在本专栏中持续更新 MIMIC-IV 数据库的详细解读和数据挖掘,敬请关注!


数据模块概述

MIMIC-IV 3.1 版本包含 住院 (hosp) 和 重症监护 (ICU) 两个模块的数据:

  • Hosp: 提供全院电子病历数据,包括入院信息、实验室测量、微生物学、用药、账单等,共计 22 张表
  • ICU: 记录重症监护室数据,如静脉注射、呼吸机设置、生命体征等,共计 9 张表
    在之前的文章【MIMIC数据库教程】一、MIMIC-IV3.1表格与字段详解(一)中整体性的介绍了Hosp和ICU模块中的所有表格,本文将开始对这些表格详细介绍和解读。

🏥 Hosp:omr表格

omr表格存储电子病历中记录的各种信息。它是血压、体重、身高和体重指数等门诊测量数据的有用来源,总共包含7753027行,5个字段,每个字段含义如下:

列名字段含义变量类型缺失值数量
subject_id患者ID整数0
chartdate记录时间时间0
seq_num同一天同类记录的排序号整数0
result_name电子病历中的检查信息字符串0
result_value电子病历中的检查结果字符串0

🏥 Hosp:labevents表格

labevents表格存储病人的所有实验室测量结果,其中包括血液学测量、血气、化学检验以及基因检测等不太常见的检验。,总共包含158374764行,16个字段,每个字段含义如下:

列名字段含义变量类型缺失值数量
labevent_id实验室检查记录ID整数0
subject_id患者ID整数0
hadm_id住院号整数73768897
specimen_id实验室测量样本ID整数0
itemid实验室测量项目ID整数0
order_provider_id下达测量的医护人员ID字符串113933995
charttime测量结果的制表时间时间0
storetime实验室系统报告的测量结果时间时间2568511
value实验室测量结果字符串16062783
valuenum转换后的测量结果浮点数21490341
valueuom测量指标的单位字符串26555866
ref_range_lower参考下限浮点数31579618
ref_range_upper参考上限浮点数31579618
flag指示指标是否异常字符串112405302
priority实验室测量的优先级字符串7652745
comments注释字符串130357314

🏥 Hosp:microbiologyevents表格

microbiologyevents表格存储病人的微生物检查结果,总共包含3988224行,25个字段,其余字段含义如下:

列名字段含义变量类型缺失值数量
microevent_id微生物检查记录ID整数0
subject_id患者ID整数0
hadm_id住院ID整数2228343
micro_specimen_id微生物测量标本ID整数0
order_provider_id下达微生物测量的医护人员ID整数2839884
chartdate记录测量结果的时间时间0
charttime记录测量结果的时间时间303456
spec_itemid培养微生物样本的ID整数0
spec_type_desc样本的描述字符串1
test_seq多个样本的区分字段整数0
storedate提供微生物检测结果的时间时间18540
storetime提供微生物检测结果的时间时间32192
test_itemid给定试样的测试ID整数0
test_name给定试样的测试名字符串0
org_itemid检测时生长的微生物ID整数2352859
org_name检测时生长的微生物名字符串2352859
isolate_num检测抗生素时的隔离菌落整数2352859
quantity字符串3988042
ab_itemid抗生素药敏试验ID整数2577966
ab_name抗生素字符串2577966
dilution_text字符串2613366
dilution_comparison字符串2614476
dilution_value测试抗生素敏感性时的稀释值浮点数2614476
interpretation抗生素敏感性测试结果字符串2577966
comments注释字符串1269864

🏥 Hosp:patients表格

patients表格存储病人的基本信息,包含性别年龄等信息,总共包含364627行,6个字段,每个字段含义如下:

列名字段含义变量类型缺失值数量
subject_id患者ID整数0
gender性别字符串0
anchor_age移位年龄整数0
anchor_year移位年整数0
anchor_year_group标定组字符串0
dod患者死亡时间时间326326

患者的年龄信息和死亡时间是做过偏移的


🏥 Hosp:pharmacy表格

pharmacy表提供了有关患者处方药物的详细信息,包括药物剂量、处方剂量、用药频率、用药途径和处方持续时间。总共包含17847567行,27个字段,每个字段含义如下:

列名字段含义变量类型缺失值数量
subject_id患者ID整数0
hadm_id住院ID整数2228343
pharmacy_id与pharmacy表匹配的标识符整数0
poe_id与poe表匹配的标识符字符串145597
starttime指定处方药的开始时间时间21894
stoptime指定处方药的结束时间时间92169
medication药物名称字符串1137574
proc_type药物类型字符串0
status处方状态(有效、无效和停用)字符串0
entertime处方输入药房系统的时间时间0
verifiedtime医生核实处方的时间时间6571
route处方的预期给药途径字符串74881
frequency给药频率字符串96223
disp_sched每天给药的时间字符串7172767
infusion_type输液类型的编码字符串16635584
sliding_scale是否按比例给药字符串15964957
lockout_interval病人再次服药前必须等待的时间字符串17541248
basal_rate24小时内的给药速度实数17540691
one_hr_max一小时内的最大剂量字符串17785592
doses_per_24_hrs每24小时的预期剂量实数6884721
duration给定剂量的持续时间实数13539612
duration_interval持续时间的测量单位字符串96540
expiration_value整数2263523
expiration_unit字符串101837
expirationdate时间17825815
dispensation配药来源字符串79257
fill_quantity配方中的比例字符串17825816

🏥 Hosp:poe表格

poe表提供了有关患者医嘱的信息,总共包含52212109行,12个字段,每个字段含义如下:

列名字段含义变量类型缺失值数量
poe_id医嘱标识符字符串0
poe_seq医嘱顺序整数0
subject_id患者ID整数0
hadm_id住院ID整数0
ordertime下达医嘱的时间时间0
order_type医嘱类型字符串0
order_subtype医嘱子类字符串32220166
transaction_type字符串0
discontinue_of_poe_id如果该POEA终止了某POEB,记录被终止POEB字符串41480217
discontinued_by_poe_id如果该医嘱被POEC终止,记录POEC字符串41556491
order_provider_id执行该医嘱的医护人员ID字符串308039
order_statuspoe状态,记录当前poe是否还生效字符串0

🔗 结论

住院信息中表格实在太多了,还是写不完,太长了,再多加一期。

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